12株猪瘟病毒E2基因主要抗原区域的序列差异分析

摘要:

用RTPCR扩增了12个不同时期分离的HCV毒株E2基因主要抗原区域的cDNA片段并对其进行了序列测定。应用DNAstar序列分析软件对所测的12个HCV毒株与国内外已知的6个毒株Alfort株、Ald株、Brescia株、Gpe株、C株、CW株及早期已测定的HCLV株、HCVSM株和北京顺义株(BJSY2/96)3个毒株的相应片段进行了同源性比较分析。E2基因主要区域长度均为224 bp,包括从HCV 2485到2708位的E2基因B、C区域。所测的疫苗株HCLV与国外测得的疫苗株C株核苷酸及氨基酸同源性分别为991%和100%，表明目前应用的疫苗株是稳定的；用目前我国流行的部分野毒株对HCLV株免疫猪的攻击试验表明，HCLV对野毒株均具有很好的免疫力，这与序列分析结果相吻合。根据系统树分析，可将HCV分为两大群，5株90年代的野毒株及1株80年代的野毒株(其中北京3株、河南2株、广东1株)均与国内外C株、标准株属同一群(即第一群)，其核苷酸及氨基酸的同源性分别为857%～100%和838%～100%；与Alfort株同属第二群的有6个野毒株(广西北海、辽宁、河北黄骅、吉林、深圳光明、四川成都)，其中80年代与90年代的野毒株各有三株，核苷酸及氨基酸的同源性分别为843%～100%和851%～100%；21株HCV的核苷酸及氨基酸的同源性分别为781%～100%和784%～100%。两群之间的特征性差异表现在713和729位氨基酸位点的不同，经分析发现猪瘟野毒株具有复杂性与多样性。

关键词:猪瘟病毒，E2基因，序列分析

Abstract:

Key words:猪瘟病毒，E2基因，序列分析