新疆地区盐湖的中度嗜盐菌16S rDNA全序列及DNA同源性分析

摘要:

通过数值分类和16S rDNA PCR\|RFLP分析，对分离自新疆地区的中度嗜盐革兰氏阴性菌进行研究，发现了一个新类群。在此基础上，进行了中心株AI3的16S rDNA全序列分析，并与中度嗜盐菌已知种和相关种进行比较，得到系统发育树状图。在此树状图中，大多数参比菌株聚在一起，其16S rDNA全序列的同源性在96%以上，而AI3与参比菌株的16S rDNA全序列相比，其相似性低于75%。但是，AI3与Alcanivorax borkumensis［１］的16S rDNA全序列的相似性为96%，与Halobacillus litoralis的16S rDNA全序列的相似性为99%，三者构成一个独立的发育分支。这说明在系统发育上，AI3与参比菌株属于不同的分支，是一个新的类群。在新类群内，菌株之间的DNA同源性大于70%，而中心株AI3与标准菌株伸长盐单胞菌(Halomonas elongata)的DNA同源性为44%，表明新分离的菌株可能构成一个新种群。

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