水稻黑条矮缩病毒基因组片段S7的cDNA克隆及全序列分析

摘要:

应用RTPCR技术克隆了2个水稻黑条矮缩病毒 (rice blackstreaked dwarf virus,RBSDV)中国分离物，即浙江分离物和河北分离物的基因组片段S7，并测定了他们的全序列。结果表明：RBSDV浙江分离物(RBSDVZj)基因组片段S7全长2193nts(EMBL登录号为AJ297427)，RBSDV河北分离物基因组片段S7全长2190nts(EMBL登录号为AJ297428)，二者均含有两个开放阅读框(open reading frame,ORF)，分别编码约41kD和36kD多肽，2个中国分离物核苷酸同源性高达99%，相应的ORF编码的多肽同源性分别为100%和94.4%，与日本RBSDV基因组片段S7核苷酸同源性为93.4%和93.8%，相应ORF编码的多肽同源性分别为98.1%(ORF1)、96.5%和97.8%(ORF2)，与意大利MRDV S6核苷酸同源性为85.1%和85.3%，相应多肽同源性分别为92.3%(ORF1)、85.5%和86.8%(ORF2)。

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