我国部分地区H9亚型禽流感病毒血凝素基因序列比较与遗传发生关系分析

摘要:

为从分子水平掌握我国H9亚型AIV的遗传变异情况和流行规律，本研究汇集近年来从我国12个省、市、自治区的发病鸡群中分离到的23株H9亚型禽流感病毒，通过RT-PCR方法和核苷酸序列测定获得了23个毒株的HA基因cDNA核苷酸序列。核苷酸和推导的氨基酸序列同源性比较结果表明，这些毒株HA基因的核苷酸序列同源性为94．1％～100％，氨基酸序列同源性为95．4％～100%；将这23个毒株和来自亚洲及世界其它地区的另外31株的HA基因cDNA序列同源性进行比较发现，分离自香港的HK170499株与日本的2个毒株关系较近；氨基酸序列分析发现，CKGS199、CKTJ196、CKTJ296、CKSH300和CKBJ197五个毒株各发生了一个潜在的糖基化位点的丢失。54株H9亚型AIVHA基因55bp～1152bp的氨基酸序列分析发现，裂解位点尽管有10种基序，但本研究中的23株和近年来从我国大陆和香港地区的分离的毒株则均为RSSR↓GLF；构成受体结合位点的191位氨基酸有一个规律，即所有中国大陆毒株与部分香港毒株都为N，其它毒株均为H，141aa～143aa处的糖基化位点有与191aa类似的规律，即：凡是191aa为N的毒株，该处均为NVS（CKBJ194除外），凡是191aa为H的毒株，则该处均为NVT；遗传发生关系分析，中国大陆毒株处于欧亚谱系的第一支。本研究结果表明近年来我国鸡群中H9N2亚型禽流感病毒的感染流行可能有一个共同的来源，这为制定防治该亚型禽流感流行的有效对策提供了重要的科学依据。

Abstract: