土壤微生物总DNA的提取和纯化

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土壤微生物总DNA的提取和纯化
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本文建立了从土壤中提取总DNA的方法，并通过改进使适合于对革兰氏阳性菌的提取。用9种性质不同的土壤进行验证，均提取到了DNA，每克干土的DNA提取量从3.30μg～13.41μg，通过透析袋回收进行纯化，纯化回收率达到65.34%，纯化后的土壤DNA可以直接扩增出16S rDNA。9种土壤的提取率从60.51%～93.45%，可以从每g干土添加362个菌体的土壤中扩增到目的条带。

关键词:土壤DNA提取，纯化，提取量，提取率，PCR扩增

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Key words:土壤DNA提取，纯化，提取量，提取率，PCR扩增

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[1]张瑞福曹慧崔中利,李顺鹏樊奔.土壤微生物总DNA的提取和纯化[J].微生物学报,2003,43(2):276-282.

[2]何丽鸿赵勇陈明杰,潘迎捷.堆肥中微生物总DNA的高效提取[J].微生物学报,2006,46(1):162-165.

[3]赵裕栋,周俊,何璟.土壤微生物总DNA提取方法的优化[J].微生物学报,2012,52(9):1143-1150.

[4]方再光,黄惠琴,张开山,潘志强,鲍时翔.海绵Pacnychalina sp.体内古菌多样性非培养技术分析[J].微生物学报,2005,45(1):121-124.

[5]陈敏.土壤样品中DNA提取方法的比较[J].微生物学杂志,2005,25(3):101-104.

[6]宋培勇.从土壤中提取DNA方法比较[J].微生物学杂志,2006,26(1):109-112.

[7]徐晓皎,曹成有,崔振波,杨敏.风沙土微生物总DNA不同提取和纯化方法比较[J].应用生态学报,2010,21(5):1327-1333.

[8]刘昕昕,孟令波,潘明阳,李淑敏.东北设施黑土土壤微生物总DNA提取方法探讨[J].生物技术,2013(2):45-48.

[9]张静文,罗明,徐文修,肖正群.用于微生物多样性分析的棉田土壤总DNA的提取[J].生物技术,2009,19(5):34-37.

[10]张于光,李迪强,王慧敏,肖启明.用于分子生态学研究的土壤微生物DNA提取方法[J].应用生态学报,2005,16(5):956-960.

[11]李靖宇,赵吉,边玉,武琳慧,于景丽.湿地土壤微生物DNA提取及其脱腐技术[J].微生物学通报,2010,37(8):1130-1137.

[12]张海燕,王彩虹,龚明福,张利莉.一种简单有效且适于土壤微生物多样性分析的DNA提取方法[J].生物技术通报,2009(8).

[13]胡元森,李翠香,周毅,王雅果.两种从土壤中提取DNA方法的比较[J].生物技术,2006,16(5):34-36.

[14]冯敏,吴红艳,王志学,郭玲玲,李赞.用于分析土壤微生物结构变化规律的变性梯度凝胶电泳条件研究[J].微生物学杂志,2018(5):73-77.

[15]胡磊,杨广,尤民生.茶园土壤微生物总DNA不同提取方法的比较[J].基因组学与应用生物学,2010,29(2).

[16]窦莹颖,林展民,朱英德,路,群,叶波平.浙贝母根际土壤总DNA提取和纯化方法的比较[J].微生物学通报,2008,35(11):1840-1844.

[17]栗若兰,郑智慧,路新华,张华,蒋沁.利用土壤宏基因组技术定向筛选抗生素产生菌的方法学建立[J].微生物学通报,2011,38(7):1125-1130.

[18]袁勇芳,许杨,李思光,汤祖辉.红曲霉DNA提取及其RAPD-PCR反应体系的建立[J].生物技术,2002,12(1):2-4.

[19]骆耐香,陈森洲,袁桂峰,徐雅娟,陈建宏.广西沿海地区红树林根系土壤中放线菌的分离与鉴定[J].基因组学与应用生物学,2010,29(2).

[20]李钧敏,金则新.一种高效可直接用于PCR分析的土壤总微生物DNA抽提方法[J].应用生态学报,2006,17(11):2107-2111.

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[1]李钧敏,金则新.一种高效可直接用于PCR分析的土壤总微生物DNA抽提方法[J].应用生态学报,2006,17(11):2107-2111.

[2]杨德君　吴襟　刘毅　段子渊　沈文　龙燕.一种快速提取肠道微生物总DNA的方法[J].中国微生态学杂志,2006,18(2):91-93.

[3]范圣第,权春善.环境DNA的提取和纯化方法的研究[J].大连民族学院学报,2005,7(5):1-4.

[4]顾华杰,李玉祥,赵明文,潘根兴.几种水稻田土壤微生物总DNA提取方法的比较[J].江苏大学学报(医学版),2005,15(4):300-305.

[5]贾夏,韩士杰,赵永华,周玉梅.根际土壤微生物DNA提取及纯化方法的比较[J].林业研究,2006,17(1):31-34.

[6]吴银宝,史金才,莫测辉,蓝小花,陈文燕.猪粪和土壤样品中微生物DNA提取方法的比较[J].农业工程学报,2006(Z2).

[7]张霞陈中义张杰宋水山李国勋.遗传重组微生物的环境监测[J].中国生物工程杂志,2005,25(3):12-16.

[8]胡江　代先祝　李顺鹏.阿特拉津及其降解菌的使用对土壤微生物群落的影响[J].应用生态学报,2005,16(8):1518-1522.

[9]文红秀,李昌平.家兔盲肠微生物总DNA的提取[J].猪业科学,2004,21(12):28-29.

[10]黄婷婷　曹慧　王兴祥　崔中利.一种土壤微生物总DNA的高效提取方法[J].土壤,2004,36(6):662-666.

[11]滕应　骆永明　赵祥伟　李振高　宋静　吴龙华.重金属复合污染农田土壤DNA的快速提取及其PCR-DGGE分析[J].土壤学报,2004,41(3):343-347.

[12]吴敏娜　张惠文　李新宇　苏振成　张成刚.提取北方土壤真菌DNA的一种方法[J].生态学杂志,2007,26(4):611-616.

[13]张搏　杨江科　苏华武　闫云君.脂肪酶产生菌的筛选、鉴定及其产酶条件优化[J].生物技术,2007,17(1):23-26.

[14]张宁,王凤山.DNA提取方法进展[J].中国海洋药物,2004,23(2):40-46.

[15]胡元森　吴坤　刘娜　陈红歌　贾新成.黄瓜不同生育期根际微生物区系变化研究[J].中国农业科学,2004,37(10):1521-1526.

[16]赵青　肖履中.羊毛皮张和土壤中炭疽杆菌PCR检测方法的建立[J].中国兽医科学,2004,34(2):7-10.

[17]甲基对硫磷长期污染对土壤微生物的生态效应[J].农村生态环境

[18]赵青肖履中.羊毛皮张和土壤中炭疽杆菌PCR检测方法的建立[J].中国兽医科技,2004,34(2):7-11.

[19]潘和平　常根柱　臧荣鑫　卢建雄.蓝茎冰草DNA的提取方法[J].中国草食动物,2007,27(6):47-48.

[20]向光明　王纯利　贾宏涛　蒋平安.利用DGGE指纹图谱技术考察不同营养条件下土壤微生物群落结构的变化[J].新疆农业大学学报,2007,30(3):60-64.

[21]陈旭玉,周亚奎,郑服丛.橡胶林土壤微生物2种DNA提取方法的比较[J].热带农业科学,2008,28(3).

[22]胡元森,李翠香,孙富林,吴坤,贾新成.不同培养基组合提高土壤细菌可培养性的研究[J].微生物学报,2007,47(5):882-887.

[23]胡元森,吴坤,李翠香,贾新成.黄瓜连作对土壤微生物区系影响Ⅱ——基于DGGE方法对微生物种群的变化分析[J].中国农业科学,2007,40(10):2267-2273.

[24]徐淑霞,张世敏,孙强,王少华,吴坤.五氯酚降解菌的筛选及降解条件的研究[J].土壤,2008,40(3).

[25]蒋小芳,罗佳,黄启为,徐阳春,杨兴明,沈其荣.不同原料堆肥的有机无机复混肥对辣椒产量和土壤生物性状的影响[J].植物营养与肥料学报,2008,14(4).

[26]宋琳玲,曾光明,陈耀宁,范长征,余震,杨恋.固态发酵过程中微生物总DNA提取方法比较[J].环境科学学报,2008,28(11).

[27]王明道,吴宗伟,原增艳,陈红歌,吴坤,贾新成.怀地黄连作对土壤微生物区系的影响[J].河南农业大学学报,2008,42(5).

[28]张瑞福　崔中利　何健　黄婷婷　李顺鹏.甲基对硫磷长期污染对土壤微生物的生态效应[J].生态与农村环境学报,2004,20(4):48-50.

[29]贾建丽,李广贺.油田区土壤微生物种群构成及系统分类初步研究[J].环境科学,2009,30(4):1185-1192.

[30]何沙娥,张智俊.适用于竹林土壤PCR-DGGE分析用的微生物总DNA提取及纯化方法[J].浙江林学院学报,2009,26(2).

[31]徐大勇　黄为一.人工接种堆肥和自然堆肥微生物区系与分子多态性的变化[J].生态与农村环境学报,2006,22(1):29-33.

[32]胡元森　刘亚峰　吴坤　窦会娟　贾新成.黄瓜连作土壤微生物区系变化研究[J].土壤通报,2006,37(1):126-129.

[33]宋培勇.从土壤中提取DNA方法比较[J].微生物学杂志,2006,26(1):109-112.

[34]王秋君,张小莉,罗佳,黄启为,沈其荣,杨兴明.不同有机无机复混肥对小麦产量、氮效率和土壤微生物多样性的影响[J].植物营养与肥料学报,2009,15(5):1003-1009.

[35]靳正忠,雷加强,徐新文,李生宇,赵思峰.极端干旱区防护林地土壤微生物多样性[J].生态学报,2009,29(8).

[36]张海燕,王彩虹,龚明福,张利莉.一种简单有效且适于土壤微生物多样性分析的DNA提取方法[J].生物技术通报,2009(8).

[37]刘佳,许修宏,李洪涛.利用PCR-DGGE技术对自然堆肥微生物群落多样性的分析[J].东北农业大学学报,2009,40(9).

[38]王代长,王慎阳,蒋新,衡利沙,谭金芳,刘世亮,曹永鲜.可变电荷与恒电荷土壤胶体对DNA吸附与解吸特征[J].环境科学,2009,30(9).

[39]陈邦,范代娣,王琰.土壤微生物DNA提取方法的研究[J].西北大学学报,2009,39(5).

[40]郑璐,高乃云.环境样品中DNA提取方法的研究进展[J].给水排水,2010,36(5).

[41]罗佳,蒋小芳,孟琳,黄启为,徐阳春,沈其荣,杨兴明.不同堆肥原料的有机无机复合肥对油菜生长及土壤供氮特性的影响[J].土壤学报,2010,47(1):97-106.

[42]吕志堂,纪翠平,马亭亭.磁铁矿尾矿宏基因组DNA提取方法的初步研究[J].安徽农业科学,2010,38(7).

[43]曾艳,孙建光,王敏,陈强,高俊莲.一株高抗镉细菌KCd1的分离鉴定及其抗性基因初步研究[J].四川农业大学学报,2010,28(1):46-51.

[44]陈杨栋,陈婷,李力炯,曹张军,张兴群.几种苎麻园土壤微生物总DNA提取方法比较[J].实验室研究与探索,2010,29(4).

[45]金海林,金东淳,李颖,张佳,李烨.土壤微生物3种DNA提取方法的比较[J].延边大学农学学报,2010,32(1):59-61,68.

[46]黄翠丽,王敏,成晓杰,程敏,仇天雷,宫春波,陈强,高俊莲.一株产共轭亚油酸瘤胃细菌Streptococcus infantarius RB111的筛选与鉴定[J].微生物学通报,2011,38(1):78-84.

[47]宋培勇,马莉莉.TENP-PBS预处理在提取土壤DNA中的应用[J].安徽农业科学,2010,38(24).

[48]殷涌光,金哲雄,王婷,王春利,安文哲.茶叶可食性DNA的PEF快速提取方法[J].食品科技,2007,32(4):187-190.

[49]杨朝晖　肖勇　曾光明　刘云国　邓久华.用于分子生态学研究的堆肥DNA提取方法[J].环境科学,2006,27(8):1613-1617.

[50]贾夏　韩士杰　赵永华　周玉梅.高浓度CO2对红松根际及根外土壤微生物群落结构的影响[J].环境科学学报,2006,26(11):1833-1837.

[51]陈红歌,胡元森,贾新成,吴坤.垃圾填埋场细菌种群空间分布及组成多样性研究[J].环境科学学报,2005,25(6):809-815.

[52]邵继海　何绍江　冯新梅.四种土壤微生物总DNA的纯化方法的比较[J].微生物学杂志,2005,25(3):1-4.

[53]魏兆军　廖爱美　贾如　姜绍通.食品污染微生物基因组DNA提取的简易方法[J].食品科学,2006,27(12):410-413.

[54]郑维　权春善　朴永哲　范圣第.一种快速提取细菌总DNA的方法研究[J].中国生物工程杂志,2006,26(4):75-80.

[55]胡元森　李翠香　周毅　王雅果.两种从土壤中提取DNA方法的比较[J].生物技术,2006,16(5):34-36.

[56]樊奔　崔中利　邱珊莲　曹慧　李顺鹏.以质粒载体构建土壤宏基因组文库的研究[J].土壤学报,2006,43(3):513-516.

[57]滕应　骆永明　李振高.污染土壤的微生物多样性研究[J].土壤学报,2006,43(6):1018-1026.

[58]蒋云霞　郑天凌.天然红树林土壤微生物大片段宏基因组文库的构建[J].环境科学,2007,28(11):2609-2614.

[59]袁志辉　蓝希钳　杨廷　肖杰　周泽扬.家蚕肠道细菌群体调查与分析[J].微生物学报,2006,46(2):285-291.

[60]张珍妮,吴晓芙,陈永华,石卉.DGGE技术在环境微生物多样性研究中的应用[J].生物技术通报,2009(12).

[61]郁雪平,朱伟杰,高观朋,王伟.生防木霉菌Th2和T4对甜瓜根围土壤微生态的影响[J].植物保护学报,2009,36(6):522-528.

[62]任国领,袁红梅,侯兆伟,卞立红,黄永红.大庆油田油藏微生物基因组DNA的提取与分析[J].大庆石油学院学报,2010,34(4).

[63]Zhong-yi ZHANG,Wen-xiong LIN,Yan-hui YANG,Hui CHEN,Xin-jian CHEN.Effects of Consecutively Monocultured Rehmannia glutinosa L. on Diversity of Fungal Community in Rhizospheric Soil[J].中国农业科学(英文版),2011,10(9):1374-1384.

[64]刘佳,李婉,许修宏,李洪涛.接种纤维素降解菌对牛粪堆肥微生物群落的影响[J].环境科学,2011,32(10):3073-3081.

[65]闫亮珍,李晓然,全哲学,马恩波.汾酒大曲和酒醅样品DNA提取方法的优化[J].食品与发酵工业,2011,37(3).

[66]刘淼,张涛,孙建,娄恺.新疆彩色丘陵地貌岩石层细菌多样性研究[J].新疆农业科学,2011,48(3):572-577.

[67]邸宁,刘志民,马焕普.研究土壤微生物多样性的PCR条件优化[J].安徽农业科学,2011,39(23):14059-14061,14064.

[68]王慎阳,饶伟,王代长,张亚楠,李腾,唐冰培,杨世杰.蒙脱土、高岭土和针铁矿对DNA吸附与解吸特征[J].环境科学,2012,33(5):1736-1743.

[69]温洪宇,王璐,杨柳,惠星星,仝赫,杨依凡.乳品废水活性污泥总DNA提取方法的比较[J].环境科学与管理,2012,37(4):144-148.

[70]吕新,陈丽华,李玥仁.4种不同土壤微生物DNA提取方法对DGGE分析微生物群落的影响[J].福建农业学报,2012,27(4):367-372.

[71]林茂兹,王海斌,林辉锋.太子参连作对根际土壤微生物的影响[J].生态学杂志,2012,31(1):106-111.

[72]郑会全,梁瑞友,胡德活,韦如萍,王润辉,晏姝.杉木大径材优树选择与主要经济性状变异分析[J].西南林学院学报,2012(4):26-29.

[73]兰玉倩,樊丹敏,刘志磊,王德良.应用PCR-DGGE指纹技术解析清香型大曲生产过程中酵母群落结构[J].中国酿造,2012(10):156-159.

[74]汤世博,张仁陟,张金文.西北地区耕地土壤真菌DNA提取方法比较[J].土壤通报,2012(4):832-835.

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