大肠杆菌和志贺氏菌O抗原糖基转移酶与聚合酶的生物信息学研究

摘要:

利用生物信息学手段对大肠杆菌和志贺氏菌的110个O抗原糖基转移酶与39个O抗原聚合酶的序列进行分析，探讨这两种酶的序列和结构特点。统计了其序列一致性，密码子使用和（G+C）%含量的特点；讨论了O抗原糖基转移酶和聚合酶对底物的特异性；推测了6组糖基转移酶的功能；通过对蛋白拓扑结构的预测，发现O抗原聚合酶中广泛存在一个位于细胞周质中的亲水环（Loop），是可能的功能区域；通过对蛋白高级结构的预测，发现O抗原糖基转移酶属于两个不同的蛋白超家族。

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