摘要:采用非分离培养分析方法，即16S rDNA限制性酶切片段长度多态性（ARDRA）和测序方法对南海湛江海域海绵Pachychalina sp.体内的古菌多样性进行了研究。从海绵体内直接提取古菌总DNA。以样品总DNA为模板，用古菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增获得16S rDNA，回收、纯化16S rDNA产物并克隆到TVector。进行第二次PCR扩增反应，且对扩增产物进行ARDRA。在古菌16S rDNA的ARDRA图谱中，大多数克隆的酶切带谱上存在差异；随机挑选8个克隆子进行测序，获得古菌16S rDNA的部分序列，并对16S rDNA序列进行聚类分析构建了系统进化树，结果发现海绵体内的古菌主要属于Methanogenium organophilum、Methanoplanus petrolearius等古菌类。但它们与目前数据库中收录的古细菌间的相似性均不超过90%，它们极有可能是一些新的古菌。
