红树林土壤细菌群落16S rDNA V3片段PCR产物的DGGE分析

摘要:

从土壤中抽提微生物总DNA，直接扩增16S rDNA V3片段，应用变性梯度凝胶电泳(DGGE)和分子克隆技术分析16S rDNA V3片段的多态性，发现地域因素和红树品种都是影响土壤细菌群落结构的因素。通过对杯萼海桑土壤16S rDNA V3片段PCR产物两个DGGE条带进行分子克隆、序列测定和Blast分析，发现每个DGGE条带包含着许多不同的16S rDNA V3片段，并且其中多数为NCBI未收录的序列。这表明DGGE和克隆技术相结合的方法是研究土壤微生物群落结构的一种可行方法。

关键词:红树林土壤，16S rDNA，DGGE

Abstract:

Key words:红树林土壤，16S rDNA，DGGE