摘要:为研究水禽流感大规模爆发的机理，进行了水禽流感病例中并发病原，特别是免疫抑制性病原的检测研究。根据已发表的鹅圆环病毒（Goose circovirus, GoCV）序列，设计了一对检测引物，对浙江永康禽流感病死鹅样品进行PCR扩增，获得与预期552bp大小相符的DNA片段，经测序确认为GoCV特异序列，推测样品中存在GoCV。根据测定的序列进一步设计反向扩增引物，经扩增、测序、拼接后获得GoCV全长基因组序列。基因组序列分析表明，浙江永康株GoCV_yk01全长1821bp，具有圆环病毒共同的与病毒复制相关的茎环结构和Rep蛋白保守基序等特征，它与德国、中国台湾发表的序列在全基因组水平有91％～93％的同源性，在Rep和外壳蛋白的氨基酸水平有94％～97%的同源性。应用ClustalW方法作进化树分析显示，GoCV_yk01序列与德国株及中国台湾株均不在同一分支。圆环病毒可以感染淋巴细胞等增殖快的细胞，引起免疫抑制，从而造成其他病原的并发和继发感染，怀疑GoCV可能在2004年初永康爆发的鹅流感中起到了一定的协同作用。该GoCV_yk01是中国内地首次检测确认并测定全基因组序列的鹅圆环病毒。
