恶臭假单胞菌丙氨酸消旋酶基因的克隆、序列分析及表达
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    从恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)200的基因组出发,用PCR方法克隆到两个独立作用的丙氨酸消旋酶基因,称之为dadX和alr。DadX编码357个氨基酸长的多肽,计算分子量为38.82kDa,alr编码409个氨基酸长的多肽,计算分子量为44182kDa。序列分析显示,DadX的氨基酸序列与Pseudomonas putida KT2440,铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa),鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)和大肠杆菌(Escherichia coli)的DadX比较,相似性分别为96.64%、71.99%、44.88%和47.37%。Alr的氨基酸序列与Pseudomonas putida KT2440比较,同源性为94.38%,而与铜绿假单胞菌(P. aeruginosa)、鼠伤寒沙门氏菌(S. typhimurium)和大肠杆菌(E. coli)的Alr比较, 同源性均较低,分别为22.89%、25.72%和26.44 %。在P. putida 200的DadX和Alr氨基酸序列中部发现有对于酶活性至关重要的保守区域,如磷酸吡哆醛(PLP)结合位点。DadX和 alr在大肠杆菌中得到表达,DadX丙氨酸消旋酶只对丙氨酸有消旋作用,而 Alr丙氨酸消旋酶可以作用于丙氨酸和丝氨酸两种底物,且对丝氨酸特异性更高。Alr的表达不依赖于外源启动子,说明在其结构基因上游存在启动子结构。

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引用本文

曹芹 赵智 张英姿 王宇 丁久元. 恶臭假单胞菌丙氨酸消旋酶基因的克隆、序列分析及表达. 微生物学报, 2006, 46(1):

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