应用变性梯度凝胶电泳和16S rDNA序列分析对kefir粒中细菌多样性的研究

摘要:

以开菲尔（Kefir）粒为材料，经过DNA抽提和16S rDNA V3区PCR扩增，扩增产物经变性梯度凝胶电泳（DGGE）分离并切割电泳条带进行序列测定，并与现有的数据库进行了比较，对Kefir粒的细菌多样性进行分析。结果表明，DGGE 图谱中可检测到的8条带的 16S rDNA 基因序列中有7个基因序列与GenBank数据库登录的相关序列的相似性大于98%，余下的1个基因序列的相似性也大于96%。相似性大于98％的7个克隆中，有3个属于鞘氨醇杆菌属（Sphingobacterium），2个属于乳杆菌属（Lactobacillus），其它2个分别属于肠杆菌属（Enterobacter）和不动杆菌属（Acinetobacter）。首次报道了鞘氨醇杆菌作为优势菌群存在开菲尔Kefir粒中。

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