基于PCR-DGGE指纹的南海海绵共附生细菌优势种群的揭示与系统发育分析

摘要:

采用PCRDGGE指纹、克隆测序和系统发育分析技术较系统地对我国南海贪婪倔海绵（Dysidea avara） 和澳大利亚厚皮海绵（Craniella australiensis）共附生的优势细菌进行了研究。研究发现变形菌门（Proteobacteria）细菌是这两种海绵中的主要优势细菌，贪婪倔海绵中的变形菌包含了α、β、γ 三种类型，而澳大利亚厚皮海绵中仅有γ一种类型。两种海绵都有拟杆菌（Bacteroidetes），但是具体的种类不同。这些细菌都是第一次在海绵中被发现。澳大利亚厚皮海绵共附生的优势细菌还包括放线菌属（Actinobacterium）及厚壁菌门（Firmicutes）细菌，菌群多样性要比贪婪倔海绵的丰富。两种海绵尽管来自于同一海域但其共附生优势细菌的组成明显不同，这说明海绵共附生微生物具有宿主特异性。

Abstract: