摘要:对分离自山羊瘤胃的真菌分离培养液中甲烷菌进行16S rDNA扩增、DGGE分析、RFLP及测序分析，研究共存于真菌分离培养液中甲烷菌的种类及其多样性。DGGE结果显示：从厌氧真菌分离至第45代，甲烷菌多样性指数由1.32降至0.99，相似性最低为34.7%；第45代至62代，多样性指数由099升至1.15，相似性最低为89.2%。RFLP多态性分析69个克隆共得到5个操作分类单元，选择其中6个具有代表性的序列进行测序。序列及系统进化分析表明，属于其中3个操作分类单元的克隆最相似菌都是Uncultured archaeal symbiont PA202，相似性均为95%，没有与这些克隆相似性较高的已培养甲烷菌；属于另外2个操作分类单元的克隆最相似菌都是Uncultured rumen methanogen 956，相似性均为97%，最相似已知菌为Methanobrevibacter sp. NT7，相似性为97%。结果表明，真菌培养液中存在目前尚未分离培养的瘤胃甲烷菌。
