摘要
昆虫肠道微生物与宿主之间存在相互依赖的共生关系,这对宿主昆虫的代谢、免疫、发育及农药抗性等功能发挥着重要作用。肠道微生物受到食物、性别和饲养环境等因素的影响,目前尚未见针对植食性昆虫斑须蝽(Dolycoris baccarum)雌雄之间群落结构的相关报道。
目的
探究性别对斑须蝽微生物组成及丰度的影响,以挖掘性别相关的微生物,为利用不同性别的微生物防治斑须蝽提供依据。
方法
基于PacBio平台,采用第三代16S rRNA基因扩增子测序技术和生物信息学分析,研究斑须蝽雌性和雄性肠道内细菌的多样性及组成。使用传统细菌分离培养法获取斑须蝽的肠道菌,并结合形态学及16S rRNA基因序列分析进行鉴定。
结果
斑须蝽共生菌种类丰富,共注释到14门29纲60目109科165属。从门(phylum)、纲(class)、目(order)、科(family)、属(genus)、种(species) 6个微生物分类水平分析可知,只有奇异球菌门(Deinococcota)和奇异球菌纲(Deinococci)是雄性特有的;而绿屈挠菌门(Chloroflexi)、脱硫杆菌门(Desulfobacterota)、蓝菌门(Cyanobacteria)、色球藻纲(Cyanobacteriia)、乳杆菌属(Lacticaseibacillus)、肌氨酸酐水解谷氨酸杆菌(Glutamicibacter creatinolyticus)、不动杆菌(Acinetobacter)和类干酪乳杆菌(Lacticaseibacillus paracasei)则是雌性特有的。研究发现,在不同分类阶元中,雄性在黏质沙雷氏菌(Serratia marcescens)中的数量显著高于雌性。在雌雄肠道中,γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)的含量分别为51.223%和95.512%;肠杆菌目(Enterobacterales)的占比分别为49.784%和95.492%;耶尔辛氏菌科(Yersiniaceae)的占比分别为2.385%和10.377%;沙雷氏菌属在雌性和雄性中的占比分别为2.383%和10.372%;黏质沙雷氏菌在雌性和雄性中的占比分别为2.310%和10.375%。经过形态学和16S rRNA基因鉴定的28株体外分离的菌均属于沙雷氏菌属(Serratia)。
结论
斑须蝽雌雄成虫的肠道微生物组成存在显著差异。雄性成虫的肠道微生物多样性显著高于雌性成虫,并且表现出性别二态性。通过体外分离的菌株均属于沙雷氏菌属。这为研究斑须蝽雌雄成虫的肠道微生物潜在功能及斑须蝽的生物防治提供了理论支持。
关键词
斑须蝽(Dolycoris baccarum),属于半翅目(Hemiptera)蝽科(Pentatomidae)蝽亚科(Pentatominae),也被称为花大姐,广泛分布于亚洲和欧洲各
昆虫消化道内的所有微生物统称为昆虫肠道菌群。关于昆虫肠道菌的研究在环境科
研究发现,在大多数生物中,性别是影响宿主体内微生物的重要因素。例如,不同性别的桔小实蝇(Bactrocera dorsalis)肠道内微生物含量显著不同。肠杆菌科(Enterobacteriaceae) 细菌在雌性肠道中的含量高于雄性,但总体而言,雌性桔小实蝇的肠道内菌群多样性低于雄
1 材料与方法
1.1 供试昆虫和培养基的配制
供试昆虫采自在湖南郴州的烟草种植基地。
LB液体培养基(g/L):胰蛋白胨20.0,酵母粉10.0,氯化钠20.0;EB液体培养基(g/L):胰蛋白胨20.0,酵母粉30.0,氯化钠10.0,葡萄糖20.0,牛肉浸粉6.0;NA液体培养基(g/L):胰蛋白胨20.0,牛肉浸粉6.0,氯化钠10.0。LB、EB和NA固体培养基分别添加1.5%的琼脂。
1.2 肠道菌的体外培养
为排空其体内食物和粪便,首先将供试昆虫饥饿24 h。随后,随机选取3只身体健康、大小一致的斑须蝽,放入4 ℃的冰箱中冷冻10 min,取出后用75%乙醇洗涤3次,以去除表面杂质。接着,用磷酸盐缓冲液(phosphate buffered saline, PBS)洗涤3次,确保虫体表面清洁。之后,对昆虫进行解剖,获取肠道,并将其置于1.5 mL离心管中,使用电动研磨棒对肠道组织进行充分研磨,直至无法看见组织结构。将研磨后的组织液3 000 r/min离心5 min后,吸取上清液并转移至新的1.5 mL离心管中,备用。
分别吸取5 mL的LB、EB和NA液体培养基到已灭菌的15 mL离心管中,随后,各取200 μL原液分别转移至3种液体培养基中。待溶液充分混匀后,将其置于恒温振荡培养箱中,分别在30 ℃和37 ℃下200 r/min培养12 h。分别取100 μL过夜培养的菌液,加入装有900 μL相应液体培养基或磷酸盐缓冲液(PBS)的2 mL离心管中,混匀后再吸取100 μL菌液至下一个装有900 μL相应液体培养基或PBS的2 mL离心管中,重复上述步骤,直至获得倍比稀释1
1.3 肠道菌的测定
从斑须蝽的雄性成虫和雌性成虫各取8头个体。首先,将这些昆虫置于饥饿状态24 h,随后将其放入4 ℃冰箱中冷冻10 min。取出后,使用75%乙醇溶液对虫体进行3次洗涤,以去除表面杂质。接着,用磷酸盐缓冲液(PBS)再洗涤3次,彻底去除虫体表面残留的乙醇。完成洗涤后,对昆虫进行解剖,分离并收集肠道组织,解剖过程中使用的组织匀浆缓冲液为磷酸盐缓冲液(PBS)。解剖得到的雄性和雌性肠道分别进行标记并保存备用。每组选取5个样本用于后续检测,另外3个样本作为备用。所有样本在处理过程中迅速用液氮进行冷冻处理,并贴上标签后存入-80 ℃冰箱中,以确保样本的稳定性和完整性。在进行样本处理的同时,按照粪便/土壤基因组DNA提取试剂盒(南京诺唯赞生物科技股份有限公司)的说明提取斑须蝽肠道内的细菌总DNA。将得到的总DNA样本置于-80 ℃冰箱中保存,以备后续实验使用。
1.4 建库测序
以提取的DNA为模板,根据全长引物序列合成带有barcode的特异性引物。雌雄斑须蝽肠道微生物采用16S rRNA基因扩增子测序前引物(中间为barcode)(5′-CTACACGACGCTCTTCC GATCTGATCGAGTCAAGRGTTYGATYMTGGCTCAG-3′)和后引物(中间为barcode)(5′-AAGC AGTGGTATCAACCAGAGTCATCGACGTRGYTACCTTGTTACGACTT-3′)进行PCR扩增。PCR反应体系(25 μL):2×KAPA HiFi HotStart ReadyMix 12.5 μL,上、下游引物(10 µmol/L)各1.0 μL,DNA模板0.5 µL,ddH2O 10 µL, 4 ℃、1 000 r/min离心30 s后进行PCR反应。PCR反应条件:95 °C预变性3 min;95 °C变性20 s,57 °C退火30 s,72 °C延伸75 s,30个循环;72 °C终延伸5 min。反应完成后对产物进行纯化、定量和均一化,以形成测序文库(SMRT bell)。建好的文库首先进行质检,质检合格的文库使用PacBio进行测序。下机数据为bam格式,通过smrtlink分析软件导出CCS文件,根据barcode序列识别不同样品的数据,并转换为fastq格式。以上工作委托康圣序源生物科技(武汉)有限公司完成。
1.5 生物多样性分析
在对样品进行全长微生物多样性扩增测序后,获得了高质量的HiFi数据。首先对原始测序序列进行质量控制,包括低质量过滤和长度过滤,以确保数据的准确性和可靠性,从而得到高质量的测序序列。随后,对HiFi序列进行聚类与去噪处理,并划分OTUs/ASVs (以下统称为Feature)。基于Feature的序列组成,进行物种分类分析。
基于特征分析结果,对样品在各个分类水平上进行了全面的分类学分析,包括门、纲、目、科、属、种等分类学水平。通过这一分析,获得了各样品在不同分类水平上的群落结构图、物种聚类热图、分类学水平系统发育树及分类学树状图,为后续研究提供了丰富的基础数据。
在物种多样性分析方面,通过α多样性分析,研究单个样品内部的物种多样性。具体而言,统计了各样品的ACE、Chao1、Shannon及Simpson指数,并绘制了样品稀释曲线及丰度等级曲线,以直观展示样品的物种丰富度和多样性。此外,通过β多样性分析,比较不同样品在物种多样性(包括群落组成及结构)方面存在的差异,进一步揭示样品间的生态学关系。
1.6 主坐标分析法和非度量多维标定法
主坐标分析法(principal coordinates analysis, PCoA)是一种降维排序方法,用于分析各个样品之间的差异。该方法将不同样品表示为不同的点,使这些点之间的欧氏距离的平方正好等于原始的差异数据,从而实现定性数据的定量转换。通过主坐标分析,可以对多个样品进行分类,并进一步展示样品间的物种多样性差异。
非度量多维标定法(non-metric multi-dimensional scaling, NMDS)是一种适用于生态学研究的排序方法。该方法主要通过将多维空间的研究对象(样本或变量)简化到低维空间进行定位、分析和归类,同时保留对象间原始关系的数据分析方法。与PCoA类似,NMDS通过样本的分布可以展示组间或组内的差异。点与点之间的距离表示差异程度,当stress值小于0.2时,表明NMDS分析具有一定的可靠性。在坐标图上,距离越近的样品,相似性越高。
1.7 多响应置换过程分析法
多响应置换过程分析法(multi-response permutation procedures, MRPP)也称为相似性分析。MRPP通过比较组内和组间的距离来评估组之间的差异。该方法计算每个组内样本之间的平均距离,并将其与组间样本距离进行比较。使用置换方法生成在0假设下的距离分布,计算A值及相应的P值。MRPP主要用于分析多维数据组间相似性的统计方法,基于Bray-Curtis距离的参数检验,旨在分析组间微生物群落结构差异的显著性。
2 结果与分析
2.1 测序数据质控结果
按雌雄性别分为2个实验组(F/M),每个实验组分别进行5次重复实验(F1-F5/M1-M5),共完成10个样品的多样性测序。测序结果表明,共获得359 541条全长序列。每个样品至少产生32 995条全长序列,平均产生35 954条全长序列。样品测序数据经过质控和去噪处理后,得到的clean reads数据统计结果如
Sample ID | Raw reads | Clean reads | Effective reads | Effective rate (%) | Average length | G+C (%) | Q20 (%) | Q30 (%) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
M | 36 382 | 36 382 | 35 817 | 98.45 | 1 472 | 54.26 | 96.66 | 91.95 |
F | 35 526 | 35 526 | 35 190 | 99.05 | 1 463 | 55.40 | 96.58 | 91.82 |
Average length:有效读长平均长度;G+C (%):有效读长G+C含量;Q20 (%):质量值高于Q20的有效读长比例;Q30 (%):质量值高于Q30的有效读长比例。
Average length: Average length of effective reads; G+C (%): G+C content of effective reads; Q20 (%): Proportion of effective reads with a quality score above Q20; Q30 (%): Proportion of effective reads with a quality score above Q30.
2.2 稀疏性曲线及等级丰度曲线分析
稀疏性曲线(rarefaction curve)作为判断各样本测序量是否充分的依据。雌雄两组及各个样本的稀疏曲线均随着抽取序列数量的增加而逐渐趋于平缓,说明样本测序量充足,可以进行数据分析(图

图1 稀疏性曲线及等级丰度曲线。A:雌雄组稀释性曲线;B:各试验个体稀释性曲线;C:雌雄组等级丰度曲线;D:各试验个体等级丰度曲线(F:雌性;M:雄性;F1-F5:雌性重复个体;M1-M5:雄性重复个体)。
Figure 1 Rarefaction curve and rank abundance curves. A: Dilution curves of male and female groups; B: Dilution curves of individual test subjects; C: Rank abundance curves of male and female groups; D: Rank abundance curves of individual test subjects (F: Female; M: Male; F1-F5: Female replicate individuals; M1-M5: Male replicate individuals).
2.3 韦恩图分析
通过韦恩图分析对斑须蝽雌雄成虫的肠道微生物种类进行了比较。结果显示,雌性成虫和雄性成虫的肠道微生物种类总数为280。两性成虫共有的肠道微生物种类数为86,雌性成虫的肠道微生物种类数为125,占两性成虫肠道微生物总数的44.6%。雄性成虫的肠道微生物种类数为241,占两性成虫肠道微生物总数的86.1%。可观察到,雌雄成虫肠道微生物种类的差异性大于相似性,雄性成虫的肠道微生物种类较雌性成虫更为丰富(图

图2 雌雄两组肠道微生物群落图。A:雌雄两组微生物群落的韦恩图(橙色区域表示雄性特有的菌群数量,蓝色区域表示雌性特有的菌群数量,阴影区域表示雌雄共有的菌群数量);B:各个样本微生物群落的花瓣图(不同椭圆的颜色代表不同的分组,重叠部分表示分组共有的菌群数量,而非重叠部分则表示分组特有的菌群数量)。F:雌性;M:雄性;F1-F5:雌性个体;M1-M5:雄性个体。
Figure 2 The gut microbiota community profiles of male and female groups. A: Venn diagram depicting the microbial communities between male and female groups (The orange section denotes the number of microbial species that are unique to males; The blue section indicates the number of microbial species unique to females; The shaded section represents the microbial species that are shared by both sexes); B: A petal diagram of the microbial community composition for each sample, with the colors of the various ellipses corresponding to different groups (The overlapping sections highlight the number of microbial species shared among the groups; The non-overlapping sections signify the microbial species unique to each group). F: Females; M: Males; F1-F5 and M1-M5 denote individual female and male subjects, respectively.
2.4 两性成虫的肠道菌群α多样性分析
样本α多样性指数统计结果如
Gender | Shannon | Simpson | ACE | Chao1 | Coverage |
---|---|---|---|---|---|
F | 0.504 | 0.196 | 60.073 | 60.371 | 0.998 |
M | 1.479 | 0.547 | 98.599 | 100.134 | 0.997 |

图3 α多样性指数箱线图。A:ACE指数箱线图;B:Chao1指数箱线图;C:Shannon指数箱线图;D:Simpson指数箱线图。箱的上下端线:上下四分位数;中位线:中位数;上下边缘:最大最小内围值。
Figure 3 Boxplot of alpha diversity indices. A: ACE index boxplot; B: Chao1 index boxplot; C: Shannon index boxplot; D: Simpson index boxplot. The upper and lower ends of the box: Upper and lower quartiles; Median line: Median; Upper and lower edges: Maximum and minimum inner values.
2.5 主坐标分析(PCoA)和非度量多维标定(NMDS)
在对斑须蝽雌雄成虫肠道微生物进行分析时,PCoA分析图显示,第一主成分的贡献率为79.03%,第二主成分的贡献率为9.45%。

图4 雌雄肠道微生物PCoA和NMDS分析图。A:PCoA分析图;B:NMDS分析图。椭圆形圈:95%置信椭圆(即该样本组假如有100个样本会有95个落在其中)。
Figure 4 PCoA and NMDS analysis plots of gut microbiota in males and females. A: PCoA analysis plot; B: NMDS analysis plot. Elliptical circles: 95% confidence ellipses (indicating that if there were 100 samples in this group, 95 would fall within the ellipse).

图5 雌雄成虫肠道菌物种丰度聚类热图。左侧的聚类树:物种聚类树;上方的聚类树:样品聚类树;热图颜色梯度从蓝色到红色:某个物种在不同样品间相对比例由低到高。
Figure 5 Cluster heatmap of gut microbial species abundance in male and female adults. Left clustering tree: Species clustering tree; Upper clustering tree: Sample clustering tree; Color gradient of the heatmap from blue to red: The relative abundance of a particular species across different samples ranging from low to high.
2.6 多响应置换过程(MRPP)分析
MRPP分析结果显示A值为0.068,大于0,且实际观测到的组内平均相异度(observed delta)值为0.592,小于预期的组内平均相异度(expected delta)值0.636,表明组间差异大于组内差异。P值为0.046,小于0.05,表明雌雄两组间肠道微生物组成具有显著差异。
2.7 两性成虫肠道微生物的物种组成分析
通过对样本进行高通量测序分析,从门(phylum)、纲(class)、目(order)、科(family)、属(genus)、种(species) 6个微生物分类水平进行分析。结果如

图6 不同分类介元水平菌群含量图。A:门水平;B:纲水平;C:目水平;D:科水平;E:属水平;F:种水平。
Figure 6 Abundance plots of microbial communities across various taxonomic levels. A: Phylum level; B: Class level; C: Order level; D: Family level; E: Genus level; F: Species level.
在门水平上,丰度前10的微生物包括变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、未分类的古细菌门(Candidatus archaea incertae sedis)、放线菌门(Actinobacteriota)、未分类菌门(Candidatus bacteria incertae sedis)、拟杆菌门(Bacteroidota)、奇异球菌门(Deinococcota)、蓝菌门(Cyanobacteria)、绿屈挠菌门(Chloroflexi)和脱硫杆菌门(Desulfobacterota)。尽管二者的肠道菌群均包含变形菌门、厚壁菌门、未分类的古菌门、放线菌门、未分类菌门和拟杆菌门,但它们在组成和相对丰度上存在差异。雌性和雄性的第一优势种群均为变形菌门,然而雄性中该门的含量(95.681%)远高于雌性(52.704%)。第二优势种群均属厚壁菌门,雄性中的含量(2.324%)低于雌性(24.639%)。其他菌门物种的丰度较小,但雌雄之间仍存在差异。值得注意的是,雄性成虫的肠道内含有少量奇异球菌门(0.141%),而雌性成虫的肠道内则未检测到。此外,在雌性成虫的肠道内检测到少量蓝菌门(0.054%)、绿屈挠菌门(0.041%)和脱硫杆菌门(0.021%),而雄性肠道内则未检测到(
Phylum name | Proportion in females (%) | Proportion in males (%) |
---|---|---|
Proteobacteria | 52.704 | 95.681 |
Firmicutes Unclassified archaea Actinobacteriota Candidatus bacteria incertae sedis |
24.639 14.634 7.309 0.210 |
2.324 0.232 1.135 0.289 |
Bacteroidota | 0.245 | 0.145 |
Deinococcota | 0.000 | 0.141 |
Cyanobacteria | 0.054 | 0.000 |
Chloroflexi | 0.041 | 0.000 |
Desulfobacterota | 0.021 | 0.000 |
在纲水平上,物种丰度前10的包括γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)、杆菌纲(Bacilli)、未分类古细菌纲(Unclassified archaea)、放线菌纲(Actinobacteria)、α-变形杆菌纲(Alphaproteobacteria)、梭菌纲(Clostridia)、未分类纲(Candidatus classis incertae sedis)、拟杆菌纲(Bacteroidia)、奇异球菌纲(Deinococci)和色球藻纲(Cyanobacteriia)。除雄性独有的奇异球菌纲外,二者在纲水平上的优势种群相同,但相对丰度不同。γ-变形菌纲在雌雄肠道中的含量分别为51.223%和95.512%,雄性显著高于雌性。杆菌纲在雌性肠道中含量为23.981%,雄性为2.264%。未分类古细菌纲在雌雄肠道微生物的占比分别为14.665%和0.262%,雌性显著高于雄性。放线菌纲、α-变形杆菌纲、梭菌纲、拟杆菌纲在雌性成虫肠道中的相对含量分别为7.373%、1.471%、0.657%和0.242%,而雄性肠道中的含量则分别为1.156%、0.162%、0.064%和0.141%,均低于雌性。未分类纲在雄性肠道中的相对含量为0.282%,略高于雌性的0.214% (
Class name | Proportion in females (%) | Proportion in males (%) |
---|---|---|
Gammaproteobacteria | 51.223 | 95.512 |
Bacilli Unclassified archaea Actinobacteria Alphaproteobacteria |
23.981 14.665 7.373 1.471 |
2.264 0.262 1.156 0.162 |
Clostridia | 0.657 | 0.064 |
Candidatus classis incertae sedis | 0.214 | 0.282 |
Bacteroidia | 0.242 | 0.141 |
Deinococci | 0.000 | 0.142 |
Cyanobacteriia | 0.053 | 0.000 |
两性成虫目水平丰度前10的种群包括:肠杆菌目(Enterobacterales)在雌雄成虫肠道微生物中的占比分别为49.784%和95.492%,雄性显著高于雌性;乳杆菌目(Lactobacillales)在雌雄成虫肠道微生物中的占比分别为23.017%和0.021%,雌性显著高于雄性;未分类古细菌目(Candidatus Ordo incertae sedis archaea)、微球菌目(Micrococcales)、假单胞菌目(Pseudomonadales)、根瘤菌目(Rhizobiales)、棒状菌目(Corynebacteriales)和丹毒丝菌目(Erysipelotrichales)在雌性肠道微生物中的占比分别为14.661%、6.295%、1.350%、1.175%、0.596%和0.417%,均高于雄性的0.263%、0.206%、0.009%、0.046%、0.492%和0.002%;葡萄球菌目(Staphylococcales)在雌性中的占比为0.341%,低于雄性的2.035%;未分类细菌目(Candidatus Ordo incertae sedis bacteria)在雌性肠道微生物中的占比为0.217%,低于雄性的0.283% (
Order name | Proportion in females (%) | Proportion in males (%) |
---|---|---|
Enterobacterales | 49.784 | 95.492 |
Lactobacillales Candidatus Ordo incertae sedis archaea Micrococcales Staphylococcales |
23.017 14.661 6.295 0.341 |
0.021 0.263 0.206 2.035 |
Pseudomonadales | 1.350 | 0.009 |
Rhizobiales | 1.175 | 0.046 |
Corynebacteriales | 0.596 | 0.492 |
Candidatus Ordo incertae sedis bacteria | 0.217 | 0.283 |
Erysipelotrichales | 0.417 | 0.002 |
雌雄成虫肠道微生物在科水平上含量最多的10类包括:欧文菌科(Erwiniaceae),在雌性肠道微生物中占比为47.151%,远低于雄性的85.028%;未分类古细菌科(Candidatus Familia incertae sedis archaea)在雌性肠道微生物中的占比为14.660%,显著高于雄性的0.265%;耶尔辛氏菌科(Yersiniaceae)在雌性肠道微生物中的占比为2.385%,显著低于雄性的10.377%;乳酸菌科(Lactobacillaceae)、肠球菌科(Enterococcaceae)和微球菌科(Micrococcaceae) 在雌性肠道微生物中的占比分别为12.520%、9.482%和6.063%,均显著高于雄性的0.017%、0.005%和0.310%;葡萄球菌科(Staphylococcaceae)在雌性肠道微生物中的占比为0.341%,低于雄性的2.035%;莫拉氏菌科(Moraxellaceae)在雄性肠道微生物中的占比仅为0.006%,而在雌性中的占比为1.041%;棒状杆菌科(Corynebacteriaceae)在雌雄肠道微生物中的占比差异较小,分别为0.415%和0.495%;链球菌科(Streptococcaceae)在雌性肠道微生物中的占比为0.767%,而在雄性中的占比仅为0.009%。总体来看,尽管雌雄肠道微生物的优势种群相同,但在丰度上存在较大差异(
Family name | Proportion in females (%) | Proportion in males (%) |
---|---|---|
Erwiniaceae | 47.151 | 85.028 |
Candidatus Familia incertae sedis archaea Yersiniaceae Lactobacillaceae Enterococcaceae |
14.660 2.385 12.520 9.482 |
0.265 10.377 0.017 0.005 |
Micrococcaceae | 6.063 | 0.310 |
Staphylococcaceae | 0.341 | 2.035 |
Moraxellaceae | 1.041 | 0.006 |
Corynebacteriaceae | 0.415 | 0.495 |
Streptococcaceae | 0.767 | 0.009 |
雌雄肠道微生物属的丰度前10种分别为:泛菌属(Pantoea)在雌性中的含量为47.534%,远小于雄性的84.911%;未分类古细菌属(Candidatus uncultured archaeon)在雌性和雄性中的占比分别为14.663%和0.622%;沙雷氏菌属(Serratia)在雌性和雄性中的占比分别为2.383%和10.372%;魏斯氏菌属(Weissella)在雌性和雄性中的占比分别为11.440%和0.009%;肠球菌属(Enterococcus)在雌性和雄性中的占比分别为9.480%和0.005%;谷氨酸杆菌属(Glutamicibacter)在雌性和雄性中的占比分别为5.891%和0.001%;葡萄球菌属(Staphylococcus)在雌性和雄性中的占比分别为0.342%和2.031%;乳杆菌属(Lacticaseibacillus)在雌性和雄性中的占比分别为1.072%和0;不动杆菌属(Acinetobacter)在雌性和雄性中的占比分别为1.030%和0.006%;棒状杆菌属(Corynebacterium)在雌性和雄性中的占比分别为0.419%和0.491%。除乳杆菌属为雌性肠道独有外,其余9种为雌雄共有,但丰度水平差异显著(
Genus name | Proportion in females (%) | Proportion in males (%) |
---|---|---|
Pantoea | 47.534 | 84.911 |
Candidatus uncultured archaeon Serratia Weissella Enterococcus |
14.663 2.383 11.440 9.480 |
0.622 10.372 0.009 0.005 |
Glutamicibacter | 5.891 | 0.001 |
Staphylococcus | 0.342 | 2.031 |
Lacticaseibacillus | 1.072 | 0.000 |
Acinetobacter | 1.030 | 0.006 |
Corynebacterium | 0.419 | 0.491 |
雌雄肠道微生物种水平丰度前10种分别为:菠萝泛菌(Pantoea ananatis)在雌性和雄性中的占比分别为45.632%和84.341%;未分类古细菌(Candidatus uncultured archaeon)在雌性和雄性中的占比分别为14.669%和0.265%;黏质沙雷氏菌(Serratia marcescens)在雌性和雄性中的占比分别为2.310%和10.375%;魏斯氏菌(Weissella uvarum),在雌性和雄性中的占比分别为9.715%和0.001%;病臭肠球菌(Enterococcus malodoratus)在雌性和雄性中的占比分别为7.520%和0.003%;金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)在雌性和雄性中的占比分别为0.291%和1.429%;粪肠球菌(Enterococcus faecalis)在雌性和雄性中的占比分别为1.473%和0.001%;溶肌氨酸酐水解谷氨酸杆菌(Glutamicibacter creatinolyticus)、不动杆菌(Acinetobacter baumannii)和类干酪乳杆菌(Lacticaseibacillus paracasei)均为雌性特有。雌性肠道微生物在种水平上既有独特微生物,也有重叠微生物,但在丰度水平上存在显著差异(
Order name | Proportion in females (%) | Proportion in males (%) |
---|---|---|
P. ananatis | 45.632 | 84.341 |
Candidatus uncultured archaeon S. marcescens W. uvarum E. malodoratus |
14.669 2.310 9.715 7.520 |
0.265 10.375 0.001 0.003 |
G. creatinolyticus | 5.582 | 0.000 |
S. aureus | 0.291 | 1.429 |
E. faecalis | 1.473 | 0.001 |
A. baumannii | 1.146 | 0.000 |
L. paracasei | 0.922 | 0.000 |
2.8 细菌的体外分离
通过EB、LB、NA这3种培养基进行体外分离雌雄斑须蝽肠道菌,分别提取菌株的DNA,并对其16S rRNA基因进行PCR扩增和测序。测序结果拼接后,序列在NCBI网站的BLAST服务器上与GenBank进行同源比对。结果显示,在3种培养基上分离到28株菌株。具体为:LB培养基上雌性5株,雄性6株;EB培养基上雌性3株,雄性3株;NA培养基上雌性6株,雄性5株。这些菌株均属于沙雷氏菌属(Serratia) (

图7 离体培养斑须蝽成虫肠道菌生长图。A:EB培养基培养的雄虫肠道菌;B:EB培养基培养的雌虫肠道菌;C:LB培养基培养的雄虫肠道菌;D:LB培养基培养的雌虫肠道菌;E:NA培养基培养的雄虫肠道菌;F:NA培养基培养的雌虫肠道菌。
Figure 7 Growth of intestinal bacteria in ex vivo culture. A: Intestinal bacteria from male insects cultured on EB medium; B: Intestinal bacteria from female insects cultured on EB medium; C: Intestinal bacteria from male insects cultured on LB medium; D: Intestinal bacteria from female insects cultured on LB medium; E: Intestinal bacteria from male insects cultured on NA medium; F: Intestinal bacteria from female insects cultured on NA medium.

图8 斑须蝽肠道菌系统发育树。括号内的编号:序列的GenBank登录号;0.1:树的比例尺表示分支长度;BXC:斑须蝽;F:雌虫;M:雄虫;EB、NA、LB:培养基种类;标红:实验分离出的菌种。
Figure 8 Phylogenetic tree of intestinal bacteria in Dolycoris baccarum. The numbers in parentheses are the GenBank accession numbers; The scale of the tree is 0.1 indicating branch length; BXC: Dolycoris baccarum; F: Female; M: Male; EB, NA, LB: Types of culture media; Marked in red: Isolated strains of bacteria.
3 讨论与结论
研究表明,不同性别的昆虫体内微生物种类和丰度存在显著差异。例如,雌雄蚱蜢体腔内的变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteriota)和厚壁菌门(Firmicutes)的丰度存在显著差
两性蚊子体内微生物的多样性和丰度存在较大差异。在雄性中检测到芽孢杆菌属(Paenibacillus)和葡萄球菌属(Staphylococcus)的细菌,而晶杆菌属(Corynebacterium)、假单胞菌属(Pseudomonas)以及沙雷氏菌属(Serratia)的细菌仅存在于雌性
在种水平上,存在显著的雌雄间含量差异的2种菌。病臭肠球菌(E. malodoratus)在雌性和雄性中的占比分别为7.520%和0.003% (
为获得斑须蝽的肠道菌种资源,本研究对斑须蝽肠道菌进行了离体培
王琪
本研究对斑须蝽的雌雄个体进行了三代16S rRNA基因扩增子测序,详细分析了它们在肠道细菌的多样性和丰度方面的差异。研究发现,雄性成虫的肠道微生物多样性显著高于雌性。雌雄成虫的微生物表现出性别二态性(
Bacteria name | Proportion in females (%) | Proportion in males (%) |
---|---|---|
Deinococcota | 0.000 | 0.141 |
Cyanobacteria | 0.054 | 0.000 |
Chloroflex | 0.041 | 0.000 |
Desulfobacterota | 0.021 | 0.000 |
Deinococci | 0.000 | 0.142 |
Cyanobacteriia | 0.053 | 0.000 |
Lacticaseibacillus | 1.072 | 0.000 |
G. creatinolyticus | 5.582 | 0.000 |
A. baumannii | 1.146 | 0.000 |
L. paracasei | 0.922 | 0.000 |
作者贡献声明
刘栋杰:设计实验、参与实验并记录数据、文章撰写、查阅文献、文章修改;李昊:参与实验、审改文章;丘明艳:参与实验、审改文章;张颖昕:参与实验、审改文章;黄孙滨:审改文章;刘浩宇:参与实验、文章作图;肖艳松:提供实验材料;刘婷:提供实验材料、设计实验、提供实验思路;金丰良:设计实验、提供实验思路、审改文章;许小霞:设计实验、提供实验思路、审改文章。
利益冲突
作者声明不存在任何可能会影响本文所报告工作的已知经济利益或个人关系。
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