摘要
目的
以宁夏第二排水沟为研究对象,探究实施生态工程后排水沟水体细菌群落结构特征的变化。
方法
利用高通量测序技术分析水体样本中细菌群落结构,结合非度量多维尺度分析方法(non-metric multidimensional scaling, NMDS)和冗余分析(redundancy analysis, RDA),探讨细菌群落的共存模式及其影响因素。
结果
生态工程实施后,水体中的铵态氮、总氮、高锰酸盐指数、重铬酸盐指数和氟化物含量在2021年8月至2022年8月期间呈明显下降趋势;水体细菌群落的主要优势菌门为变形菌门、放线菌门、拟杆菌门和绿屈挠菌门,优势菌属主要为hgcI_clade、SAR11_cladeIII、栖湖菌属(Limnohabitans)、红育菌属(Rhodoferax)和黄杆菌属(Flavobacterium)。不同采样点间的群落结构差异显著。NMDS分析表明不同月份之间的差异显著;RDA分析表明总磷(TP)、重铬酸盐指数(CODCr)和pH是影响细菌群落结构的主要因子。TP、CODCr和总氮(TN)共同对细菌群落结构的解释度最大(8.81%),其次是TP和CODCr共同对细菌群落结构的解释度(-8.05%)。
结论
实施生态工程后,宁夏第二排水沟的水质得到了改善,细菌群落结构更加丰富。水质理化特性在驱动宁夏第二排水沟细菌群落分布及多样性方面起到了重要作用,为区域水体生态环境治理提供了科学依据。
排水沟作为城市与乡村排水系统的重要组成部分,承担着降水径流、污水及废水的收集与排放任
水体中的细菌群落结构是反映水质变化、环境因子波动及污染状态的重要生物标志物。细菌的多样性、丰度与分布受水体理化指标(如pH、温度、溶解氧浓度等)及水中营养物质的调
宁夏地处黄河上游干旱半干旱地区,排水沟作为农业灌溉及防洪排涝的核心设施,其水质变化对区域水资源管理、土地盐碱化防治及生态环境保护具有重要影
1 材料与方法
1.1 研究区概况与采样点分布
宁夏第二排水沟,又称银川市第二排水沟,是一条重要的排水沟道,全长32 km,起点位于金凤区良田镇植物园村,穿越银川市,最终流入黄河。该排水沟承担着城市泄洪和农田排水的功能,接纳银川市第五污水处理厂的尾水和沿线的生活污水。其中,兴庆区段经过胜利街、治平路、清和街、丽景街、银古路、银川市第五污水处理厂、大新镇新水桥村至贺兰县金贵镇汉佐村,全长11.8 km。
本研究在宁夏第二排水沟兴庆区境内设置了6个采样点,根据全球定位系统(global positioning system,GPS)确定各采样点的经纬度坐标及高程。各采样点的具体特征和坐标见
Sampling site | Longitude (E) | Latitude (N) | Elevation (m) | Position feature |
---|---|---|---|---|
S1 | 106.269 625° | 38.426 501° | 1 107.40 | Shengli street intersection |
S2 | 106.281 720° | 38.440 568° | 1 105.10 | Baohu east road intersection |
S3 | 106.300 610° | 38.454 844° | 1 103.20 | Xinhua east street intersection |
S4 | 106.309 122° | 38.460 486° | 1 100.10 | Yintong highway intersection |
S5 | 106.319 875° | 38.466 880° | 1 098.70 | Beijing east road intersection |
S6 | 106.368 652° | 38.489 518° | 1 095.10 | Jingzang expressway intersection |
1.2 样品采集与预处理
本研究于2022年8月至2023年8月进行采样,采样时间分别为2022年8月、2022年12月、2023年5月以及2023年8月。根据GPS确定各采样点的具体位置,在每个样点用采水器采集表层(0-50 cm)水样约5 L,置于事先用乙醇灭菌的聚丙烯采样瓶中。回实验室后将样品分为2份:一份将各水样充分摇匀后,取300 mL加入到用乙醇灭菌的滤瓶中,用0.22 μm孔径的聚碳酸酯滤膜(Millipore Corporation公司)过滤;将各滤膜置于1.5 mL的灭菌离心管中,存放于-80 ℃超低温冰箱中,用于后续的浮游细菌16S rRNA基因分析。另一份样品用于测定水体的理化指标。
1.3 样品理化性质测定与分析
水样采集按照《水质采样方案设计技术规定(GB12997—91)》《水质采样技术指导(GB12998—91)》和《水质采样样品的保存和管理技术规定(GB12999—91)》的要求进
1.4 水体微生物16S rRNA基因检测
对用于细菌分析的水体样品进行16S rRNA基因扩增子测
1.5 数据分析与制图
利用Excel 2021和SPSS 27.0对理化指标数据及水体微生物丰度数据进行统计整理,并通过单因素ANOVA检验分析数据的显著性。细菌群落的Chao1指数与Shannon指数用于分析群落的α多样性,计算采用Mothur软件完成。门属水平下细菌群落结构通过Origin 2022绘制柱状堆积图呈现。基于Bray-Curtis距离,采用R语言的“vegan”包和“ANOSIM”包对细菌群落结构进行ANOSIM分析,并结合非度量多维尺度分析法(non-metric multidimensional scaling, NMDS)在OTUs水平研究细菌群落的相似性或差异性,NMDS图由R语言绘
2 结果与分析
2.1 水体物理化学性质
第二排水沟水体9组理化指标的4次检测结果见

图1 不同月份水体中9种理化因子的变化特征。A:pH值;B:电导率;C:总溶解性固体;D:氨氮;E:总氮;F:总磷;G:高锰酸钾指数;H:重铬酸盐指数;I:氟化物。不同字母表示在P<0.05水平上存在显著差异。误差条表示不同月份对应指标的标准误差。
Figure 1 Variation characteristics of nine physicochemical factors in the water body across different months. A: pH; B: Electrical conductivity; C: Total dissolved solids; D: Ammonium nitrogen; E: Total nitrogen; F: Total phosphorus; G: Permanganate index; H: Chemical oxygen demand; I: Fluoride. Different letters represent significant differences at the P<0.05 level. The error bar represents the standard error of the corresponding index for different months.
2.2 水体细菌群落的多样性分析
Chao1、Observed、Shannon和Simpson指数是反映微生物群落丰富度和多样性的重要指标。对不同月份水体细菌的α多样性指数结果绘制柱状图(

图2 不同月份水体细菌群落α多样性指数。A:Chao1物种丰富度指数;B:观测物种数指数;C:Shannon多样性指数;D:Simpson多样性指数。不同字母表示在P<0.05水平上存在显著差异。误差条表示不同月份对应指标的标准误差。
Figure 2 Alpha diversity index of bacterial communities in the water body across different months. A: Chaol index; B: Observed index; C: Shannon index; D: Simpson index. Different letters represent significant differences at the P<0.05 level. The error bar represents the standard error of the corresponding index for different months.
2.3 细菌群落结构组成
2.3.1 门水平分类下水体细菌群落结构组成
从门水平分析4次采样水体细菌相对丰度前10的水体细菌群落特征(

图3 门水平不同月份水体细菌群落相对丰度。A:2021年8月门水平相对丰度前10的菌门;B:2021年12月门水平相对丰度前10的菌门;C:2022年5月门水平相对丰度前10的菌门;D:2022年8月门水平相对丰度前10的菌门。
Figure 3 Relative abundance of bacterial communities at the phylum level in the water body across different months. A: Top 10 bacterial phyla in terms of relative abundance at the phylum level in August 2021; B: Top 10 bacterial phyla in terms of relative abundance at the phylum level in December 2021; C: Top 10 bacterial phyla in terms of relative abundance at the phylum level in May 2022; D: Top 10 bacterial phyla in terms of relative abundance at the phylum level in August 2022.
2.3.2 属水平分类下水体细菌群落结构组成
为了进一步分析属水平细菌群落结构,对6个采样点位4次采样的细菌相对丰度前10菌属绘制柱状图(

图4 属水平不同月份水体细菌群落相对丰度。A:2021年8月属水平相对丰度前10的菌属;B:2021年12月属水平相对丰度前10的菌属;C:2022年5月属水平相对丰度前10的菌属;D:2022年8月属水平相对丰度前10的菌属。
Figure 4 Relative abundance of bacterial communities at the genus level in the water body across different months. A: Top 10 bacterial genera in terms of relative abundance at the genus level in August 2021; B: Top 10 bacterial genera in terms of relative abundance at the genus level in December 2021; C: Top 10 bacterial genera in terms of relative abundance at the genus level in May 2022; D: Top 10 bacterial genera in terms of relative abundance at the genus level in August 2022.
2.4 细菌群落结构比较
基于Bray-Curtis距离的NMDS方法用于评估不同月份水体细菌群落的相似性,结果见

图5 水体细菌群落结构在不同月份的非度量多维尺度(NMDS)与ANOSIM分析
Figure 5 Non-metric multidimensional scaling (NMDS) and ANOSIM analysis of bacterial community structure in the water body across different months.
2.5 不同种养模式下水体细菌群落结构与理化因子的相关性
2.5.1 RDA相关性分析
采用冗余分析(RDA)对理化因子和水体细菌门水平主要物种进行关联分析。在门水平上,将理化因子与排名前10的优势细菌群落进行RDA分析(

图6 理化因子与水体细菌群落组成(门水平)的RDA分析
Figure 6 Correlation analysis between physicochemical factors and bacterial community composition (phylum level). 1: Proteobacteria; 2: Actinobacteriota; 3: Bacteroidota; 4: Cyanobacteria; 5: Verrucomicrobiota; 6: Desulfobacterota; 7: Chloroflexi; 8: Firmicutes; 9: Acidobacteriota; 10: Campilobacterota.
2.5.2 单个解释变量的相对重要性分析
基于RDA分析结果选取解释度排名前五的指标TP、CODCr、pH、TN和

图7 变差分解和层次分割分析结果使用UpSet图来呈现。右侧点阵图中,每行对应一个理化因子。对于每一列,孤立黑点表示各环境因子的边际效应,多点间连线表示这些环境因子间的共同效应,各组分解释的变差百分比(来自变差分解)展示在上方柱形图中。左侧柱形图为各环境因子的单独效应(来自层次分割),其值等同于该理化因子的边际效应加上与其他理化因子的共同效应的平均分配值。
Figure 7 The relative importance of five physicochemical factors on bacterial species abundance. The results of the variational decomposition and hierarchical segmentation analysis are presented using UpSet graphs. Each row in the dot matrix on the right corresponds to a physical and chemical factor. For each column, isolated black dots represent the marginal effects of various environmental factors, and lines connecting multiple points represent the common effects among these environmental factors. The percentage of variation released by each group decomposition (from the variation decomposition) is shown in the upper bar graph. The left column chart shows the individual effects of each environmental factor (from hierarchical segmentation), whose values are equivalent to the marginal effects of that physical and chemical factor, plus the average distribution value of the combined effects with other physical and chemical factors.
3 讨论
3.1 理化指标分析
从第二排水沟九组理化指标的4次检测结果来看,2021年8月至2022年8月期间,大部分关键污染物含量呈现明显下降趋势,表明水质有所改善。4次采样中TDS均无显著性差异,其原因可能是采样期间水体输入与排放的溶解物质变化不大,使得TDS维持在一个较稳定的水平。刘洋
3.2 水体细菌群落的多样性分析
从水体细菌α多样性指数的变化趋势来看,物种丰富度和群落多样性在不同时间点呈现明显波动。2021年12月,Chao1指数和Observed指数降至最低,表明此时水体细菌群落的物种丰富度显著下降。其原因可能是冬季低温导致水体中的细菌群落多样性减少,尤其是一些温暖季节的细菌无法在低温下生存或繁殖,从而导致物种丰富度下
3.3 不同月份水体细菌群落结构特征
从4次采样水体细菌群落的门水平分析来看,细菌群落的相对丰度在时间上表现出显著变化,反映了水体微生物群落对环境变化的响应。变形菌门(Proteobacteria)在所有采样中始终占据最大相对丰
从细菌相对丰度前10菌属水平分析可以明显看到不同采样点和不同时间点上水体细菌群落结构的显著差异。2021年8月,夏季高温和明显的水体分层导致表层营养物质迅速消耗,在这种低养分环境下,具备高效营养利用能力的放线菌门的hgcI_clade成为优势菌
3.4 不同月份水体细菌群落结构与理化因子的相关性
RDA分析表明,第一坐标轴和第二坐标轴共同解释了53.21%的数据变异,这说明这2个坐标轴在描述数据结构和揭示数据中的主要变化方面具有较强的解释能力。细菌群落相对丰度的变化与TP、CODCr和pH这3个因子密切相关。TP和CODCr的解释度分别为19.40%和18.20%,均呈现显著性差异(P<0.5),庞兴红
4 结论
通过对宁夏第二排水沟水体细菌群落结构特征及影响因素的分析表明:(1) 采取生态工程后水质得到了明显改善,其中CODMn、CODCr、氮磷类物质和氟离子的减少,说明生态工程对第二排水沟水质净化效果显著。(2) 水体细菌α多样性指数表明物种丰富度和群落多样性在不同时间点呈现明显波动,到2022年8月群落结构趋于稳定,物种分布更加均匀。(3) 在门水平上,细菌群落的相对丰度在不同时间表现出显著差异,其中变形菌门始终占据主导地位。属水平分析显示,在不同采样点及不同时间点,相对丰度前10菌属的群落结构存在明显差异。2022年8月,hgcI_clade成为唯一相对丰度超过5.00%的优势菌属,显示出该菌属在该时段水体中的生态优势地位。(4) TP、CODCr和pH是影响细菌群落丰度变化的关键因子,RDA分析表明TP、CODCr和TN三者共同作用对细菌群落结构的解释度最大,且为正向影响(8.81%),而TP和CODCr的共同作用对细菌群落结构的影响第二大,为负向影响(-8.05%)。
作者贡献声明
王凯:起草论文,撰写文章,修订论文;邱小琮:方法论,审阅;尹娟:项目管理,提供资源,获取基金,执行调研,方法论,项目管理,提供资源;董军林:整理数据,收集文献,数据分析。
利益冲突
作者声明不存在任何可能会影响本文所报告工作的已知经济利益或个人关系。
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