摘要
随着全球生态环境问题的日益凸显,生态修复已成为重要的研究课题。团粒喷播技术作为一种新兴的生态修复手段,在植被恢复方面具有显著优势。
目的
探究团粒喷播修复过程中植物群落组装与土壤微生物群落的关系。
方法
通过对珠海长琴岛边坡不同喷播批次样地的深入调查,剖析先锋植物群落结构、土壤养分含量与土壤真菌、细菌群落特征之间的内在联系。
结果
长琴岛喷播修复土壤真菌群落主要由9个门组成,其中子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)为优势菌门,细菌群落则以假单胞菌门(Pseudomonadota)、酸杆菌门(Acidobacteriota)和拟杆菌门(Bacteroidota)为优势菌门。在功能方面,与植物致病性(plant pathogen)、木材腐解(wood saprotroph)和内生共生(endophyte)功能相关的真菌相对丰度较高,与氮循环功能相关的细菌相对丰度较高。采用支持向量机法确定了与喷播批次间差异紧密相关的24个土壤微生物及养分指标;通过聚类分析将主要修复植物分为2组,将24个相关土壤微生物和养分指标分为4类;通过组间相关分析得出植物组合与土壤微生物和养分指标之间存在对应相关性。
结论
不同喷播批次间的群落结构和多样性存在差异,植物群落组装对土壤微生物群落结构和功能具有重要影响。本研究成果为生态修复实践提供了关键的理论支撑,有助于进一步优化生态修复策略,提升生态系统的稳定性和可持续性。
自然生态系统破坏是当前亟需全球合力解决的重大问题,联合国和我国均提出了远大的生态治理方案和计划,将生态修复作为解决该问题的主要应对手
团粒喷播技术通过将大量植物种子混入人工土壤中,以喷射的方式建立种子库和表层土壤,其较高的机械化水平使其修复效率远高于传统技
长琴岛,原名三角岛,是中国(可能也是世界上)首个采用团粒喷播技术进行生态修复的无居民海
1 材料与方法
1.1 研究区概况
长琴岛(22.14-22.15°N,113.70-113.72°E)位于中国澳门东侧13 km的海域,隶属中国珠海市。该岛气候类型为热带海洋性季风气候,2022年平均气温为22.7 ℃,年最高气温为37.4 ℃,最低气温为6.0 ℃,年降雨量2 030.8 mm。长琴岛的自然土壤类型在系统分类中为铁质湿润雏形土对应发生分类的砖红壤,表土层有机碳含量为(16.6±3.8) g/kg,全氮含量为(0.80±0.10) g/kg,C:N比为29.1-14.2。
长琴岛的自然植被中,乔木主要有大叶相思(Acacia auriculiformis A. Cunn. ex Benth.)、木麻黄(Casuarina equisetifolia L.)、台湾相思(Acacia confusa Merr.)、笔管榕(Ficus subpisocarpa Gagnep.)、野漆树[Toxicodendron succedaneum (L.) Kuntze]等,灌木主要有了哥王[Wikstroemia indica (Linn.) C. A. Mey]、鞍叶羊蹄甲(Bauhinia brachycarpa Wall. ex Benth.)、假杜鹃(Barleria cristata L.)、兰香草[Caryopteris incana (Thunb.) Miq.]、石斑木[Rhaphiolepis indica (L.) Lindl.]、黄杨[Buxus sinica (Rehder & E. H. Wilson) M. Cheng]、夹竹桃(Nerium oleander L.)等,草本主要有马唐[Digitaria sanguinalis (L.) Scop.]、鬼针草(Bidens pilosa L.)、假臭草[Praxelis clematidea (Hieron. ex Kuntze) R.M.King & H.Rob.]、白羊草[Bothriochloa ischaemum (L.) Keng]、毛马齿苋(Portulaca pilosa L.)、蒲苇[Cortaderia selloana (Schult. & Schult. f.) Asch. & Graebn.]、龙葵(Solanum nigrum L.)、类芦[Neyraudia reynaudiana (Kunth) Keng ex Hitchc.]、五节芒[Miscanthus floridulus (Labill.) Warburg ex K. Schumann]等。此外,岛上有成片的蜈蚣凤尾蕨(Pteris vittata L.)。岛上原有的人工林为桉树(Eucalyptus robusta Sm.)-木麻黄混交林,桉树的株行距为3 m×3 m,木麻黄栽植于桉树行间,株距为1 m。长琴岛历史上曾被用作采石场,其表面植被因采石活动受到严重破坏。在本次修复之前,部分受损区域被种植了桉树和木麻黄混交林。2020年,采用团粒喷播技术对海岛受损边坡进行了修复,并对一些生长不良的传统造林地进行了林相改
1.2 不同样地的位置及采样方法
本研究采用的喷播土壤为人工制造的土壤基质,各批次土壤的制备均遵循同一配方。该人工土壤的理化指标为:容重0.6-1.2 g/c
采样时间为2022年12月。喷播修复样地根据喷播批次分为4个区域,分别为SRI、SRII、SRIII和SRIV。其中SRI和SRII位于南坡,而SRIII和SRIV位于北坡。每个区域选择3个10 m×10 m的样地,不同区域的植物群落之间存在明显差异(

图1 不同喷播样地的植物群落组成。SRI、SRII、SRIII和SRIV分别为4个喷播批次区域,每个区域调查了3个样地;聚类分析依据堪培拉距离,下同。
Figure 1 Plant community composition of different spray seeding plots. SRI, SRII, SRIII, and SRIV are areas of the four spray-seeding batches respectively, and three plots were investigated in each area. The cluster analysis was based on Canberra distance. The same as below.
在每个样地中,采用多点混合方法采集土壤样品,取样深度为0-10 cm。所有采样工具在采样前均经过灭菌消毒处理。用于微生物测序的样品,每份约10 g,在-80 ℃下冷藏和运输。同时采集用于测定土壤养分指标的样品。本研究采样区的喷播植被配备有喷灌系统,采样时间为喷灌后1 h,土壤含水量约为25%-30%,相对均匀。
1.3 土壤理化性质测定
土壤有机碳(soil organic carbon, SOC)的测定采用重铬酸钾-浓硫酸外加热
1.4 土壤微生物测序
PCR由苏州金唯智生物科技有限公司完成。双端测序得到的正反向reads首先进行两两组装连接,过滤拼接结果中含有N的序列,保留序列长度大于200 bp的序列。经过质量过滤,去除嵌合体序列,最终得到的序列用于操作分类单元(operational taxonomic unit, OTU)分析,使用VSEARCH (v1.9.6)进行序列聚类(序列相似性设为97%),比对ITS rDNA的参考数据库为UNITE ITS (v9.0)数据库 (https://unite.ut.ee/),比对16S rRNA基因参考Silva (v138)数据库(https://www.arb-silva.de/documentation/release-138)。然后用核糖体数据库项目(ribosomal database program, RDP)贝叶斯算法对OTU的代表性序列进行物种分类学分析,并在不同物种分类水平下统计每个样本的群落组成。
基于OTU的分析结果,采用对样本序列进行随机抽平的方法,分别计算Shannon、Chao1多样性指数以反映群落的物种丰度和多样性。真菌功能采用FUNGuild数据库(https:// github.com/UMNFuN/FUNGuild)注
1.5 数据分析方法
采用方差分析(analysis of variance, ANOVA)比较不同修复批次之间土壤微生物和养分指标的差异显著性,如果在P<0.05水平显著,则采用Duncan法进行两两比较,并使用不同的小写字母标注组间存在的显著(P<0.05)差异。植物群落和真菌群落在不同修复区域之间的差异采用聚类分析,聚类分析依据堪培拉距离。通过聚类分析和支持向量机筛选最能区分不同聚类的微生物属和土壤指标。具体方法为:将真菌和细菌各属的相对丰度和土壤指标合并成一个指标库,根据聚类分析结果,通过支持向量机筛选与前3级分类有关的指标,如果筛选后的指标数大于20,则只保留重要性排在前20的指标。由于支持向量机的分析结果虽然重复性较高但并非完全一致,因此每次支持向量机筛选的各指标重要性数值均为执行10次结果的均值。最后,采用组间Pearson相关分析法结合聚类分析,分别探究主要修复植物与土壤微生物的群落组成和功能之间的关系。所有误差项均以标准差表示。
ANOVA和Duncan两两比较通过SPSS 22.0软件实现;细菌和真菌的功能注释及支持向量机分析通过BioinCloud网站(https://www.bioincloud.tech/)实现;聚类分析和组间相关性分析通过Chip Graphing网站(https://www.chiplot.online/)实现。
2 结果与分析
2.1 土壤真菌群落的结构、多样性及功能分析
长琴岛喷播修复区土壤真菌群落主要由9个门组成(

图2 土壤真菌各菌纲的相对丰度热图及聚类分析
Figure 2 Heatmap and cluster analysis of relative abundances of soil fungal classes.
修复区土壤真菌群落的Chao1和Shannon指数分别在333.9-449.2和4.46-5.60之间(图

图3 土壤真菌群落的多样性指数和功能。A:Chao1指数;B:Shannon指数;C:主要功能。不同小写字母表示不同喷播批次区域之间存在显著(P<0.05)差异,下同。
Figure 3 Diversity index and function of soil fungal community. A: Chao1 index; B: Shannon index; C: Main functions. Different lowercase letters indicate significant (P<0.05) differences between different spray batch areas. The same as below.
2.2 土壤细菌群落的结构、多样性及功能分析
长琴岛喷播修复区域土壤细菌群落由19个菌门组成,其中变形菌门(Proteobacteria, 现归为假单胞菌门Pseudomonadota)、酸杆菌门(Acidobacteriota)和拟杆菌门(Bacteroidota)是优势菌门,相对丰度的均值分别为45.14%、28.81%和10.96% (

图4 土壤细菌群落各菌门的相对丰度热图及聚类分析。变形菌门(Proteobacteria)与黏球菌门(Myxococcota)现归为假单胞菌门(Pseudomonadota)。
Figure 4 Heatmap and cluster analysis of relative abundances of soil bacterial phyla. The bacterial phylum Proteobacteria and Myxococcota are reclassified under the phylum Pseudomonadota now.
修复区土壤细菌群落的Chao1和Shannon指数分别在248.4-431.9和6.88-7.40之间(图

图5 土壤细菌群落的多样性指数和功能。A:Chao1指数;B:Shannon指数;C:主要功能。
Figure 5 Diversity index and function of soil bacterial community. A: Chao1 index; B: Shannon index; C: Main functions.
2.3 不同喷播批次之间的土壤养分、微生物的差异及其与修复植物之间的相关性分析
SRIII和SRIV的土壤SOC含量显著高于SRI和SRII (P<0.05,

图6 不同喷播批次土壤的有机碳(SOC)、全氮(TN)、全磷(TP)及全钾(TK)含量
Figure 6 Soil organic carbon and nutrient content in different spray seeding batches. A: Soil organic carbon (SOC); B: Total nitrogen (TN); C: Total phosphorus (TP); D: Total potassium (TK).
反映SRI与其余批次之间差异的土壤微生物和养分指标有20个,包含13个真菌属的相对丰度、5个细菌属的相对丰度以及SOC和TK的含量(

图7 各喷播批次之间土壤微生物和养分差异特征的支持向量机分析。A:反映SRI与其余批次之间差异的指标;B:反映SRII与SRIII+SRIV之间差异的指标;C:反映SRIII与SRIV之间差异的指标。3次分析的分组依据为图1的植物群落组成聚类分析。
Figure 7 Support vector machine analysis of differences in soil microorganisms and nutrients among different spray seeding batches. A: The indicators reflecting the differences between SRI and other batches; B: The indicators reflecting the differences between SRII and SRIII+SRIV; C: The indicators reflecting the differences between SRIII and SRIV. The grouping of the three analyses was based on the cluster analysis of plant community composition in Figure 1.
聚类分析结果表明,修复植物根据与土壤微生物和养分指标之间的相关性可以分为2组,分别是:(1) 望江南+车桑子;(2) 银合欢+金合欢+台湾相思。土壤微生物和养分指标则可以根据与植物之间的相关性,通过聚类分析分为4类 (

图8 主要修复植物生长密度与土壤微生物和养分指标之间的相关性分析。**和*分别表示在P<0.01和P<0.05水平显著,下同。
Figure 8 Correlation analysis between growth density of main restoration plants and soil microbial and nutrient indicators. ** and * indicate significant levels at P<0.01 and P<0.05, respectively. The same as below.
聚类分析结果表明,根据与土壤微生物功能之间的相关性,修复植物可以分为2组,分别是:(1) 望江南+车桑子;(2) 银合欢+金合欢+台湾相思。该结果与

图9 主要修复植物生长密度与土壤微生物功能之间的相关性分析
Figure 9 Correlation analysis between growth density of main restoration plants and soil microbial functions.
3 讨论
3.1 通过团粒喷播形成的植物群落对土壤微生物群落的影响
本研究发现长琴岛喷播修复土壤真菌群落的优势菌门为Ascomycota和Basidiomycota,其中Dothideomycetes、Sordariomycetes和Agaricomycetes是优势菌纲。前人对热带林地土壤真菌的研究也发现Ascomycota和Basidiomycota是该区域的真菌优势
在细菌方面,本研究发现生态修复土壤的细菌群落以Proteobacteria (现归为Pseudomonadota)、Acidobacteriota和Bacteroidota为优势菌门。前人研究发现,国内热带地区林地土壤细菌群落的优势菌门为Proteobacteria (现归为Pseudomonadota)、Acidobacteriota和Actinobacteri
本研究还发现在长琴岛喷播修复区的植物群落组装过程中形成了典型的植物组合,例如组合1 (望江南+车桑子)、组合2 (银合欢+金合欢+台湾相思)以及潜在组合(银合欢+望江南),这些植物组合与土壤微生物群落结构和功能密切相关。以往研究表明,植物组合能够通过根系分泌物和凋落物的成分影响微生物的生长和群落结
3.2 环境因子与植物和微生物群落之间的关系
坡度、坡位、坡向等立地条件因子能够影响光照、温度、水分等环境因子,从而影响植物和微生物的生
此外,支持向量机分析结果表明,土壤SOC和TK含量是表征不同喷播批次之间差异的关键指标。其中,北坡2个喷播批次土壤的SOC含量显著高于南坡,这可能是由2个因素导致的。(1) 南坡是台风迎风坡,每年受到多次台风影响,土壤侵蚀相对严
3.3 支持向量机法在筛选组间土壤微生物群落差异主要指标的应用
支持向量机法在处理本研究中的微生物数据时展现出优势,它能够从众多复杂的微生物指标中精准筛选出最能体现处理间差异的关键指标,并对这些指标的重要性进行有效排序。在面对大量的微生物数据时,传统的组间相关分析和冗余分析方法往往只能展示有限数量的指标,难以全面揭示微生物群落的复杂特
目前数据分析中常用的机器学习方法有随机森林法和支持向量机法2种,随机森林方法多次重复运行结果的可重复性极低,这使得研究结果的可靠性和稳定性难以保
4 结论
(1) 长琴岛喷播修复样地的土壤真菌以Dothideomycetes、Sordariomycetes和Agaricomycetes为优势菌纲,细菌以Pseudomonadota、Acidobacteriota和Bacteroidota为优势菌门,且不同喷播批次间土壤真菌和细菌群落结构及功能均存在差异。
(2) 生态修复的植物群落组装过程中形成了不同的植物组合,这些植物组合对应的土壤微生物群落结构和功能有明显区别。未来生态修复面对不同生态问题时,可以更有目的性地选择不同的植物组合,通过其共生土壤微生物获得相应的生态功能。
(3) 不同喷播批次间土壤SOC的差异主要是坡向不同导致的,而土壤TK的差异主要与植物群落及其共生微生物有关。
(4) 本研究采用的团粒喷播技术所用的植物种子以豆科植物为主,而其他科的种子较少。未来生态修复工程可采用更加多样化的种子库,以实现更多的功能。此外,未来研究还需要探索支持向量机等机器学习工具在生态环境领域更广泛的应用场景与途径。
作者贡献声明
李春林:提出概念、数据分析、获取基金、方法论、项目管理、撰写文章;许剑平:提出概念、数据分析、执行调研、方法论、提供资源、撰写文章;王志康:数据收集与监管、数据分析、获取基金、执行调研、软件程序、完成呈现、撰写文章;孙琳婷:数据收集与监管、数据分析、执行调研、验证;张良振:数据收集与监管、执行调研、验证;张式雷:数据收集与监管、监督管理;曹志泉:数据收集与监管、执行调研;徐春莹:执行调研;孙佳丽:执行调研;姜硕:执行调研。
利益冲突
作者声明不存在任何可能会影响本文所报告工作的已知经济利益或个人关系。
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