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基于Biolog表型芯片的立枯丝核菌菌核形成所需代谢底物分析  PDF

  • 向立刚 1,2
  • 汪汉成 1
  • 蔡刘体 1
  • 陈丽莉 1
  • 张文建 2
  • 王军 2
  • 孟建玉 1
  • 杨靓 3
  • 温明霞 2
1. 贵州省烟草科学研究院,贵州 贵阳; 2. 贵州省烟草公司遵义市公司,贵州 遵义; 3. 福建农林大学,植物病毒研究所,福建 福州

最近更新:2025-04-30

DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20240778

CSTR: 32112.14.j.AMS.20240778

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摘要

目的

分析立枯丝核菌菌核形成所需的代谢底物,旨在了解营养元素和环境因子对其菌核形成的影响规律。

方法

基于Biolog表型芯片技术测定663种营养物质、96种渗透压和96种pH环境下立枯丝核菌的菌核形成能力。

结果

在供试的营养物质及环境条件中,分别有19/95的碳源、21/95的氮源、16/94的磷硫源、69/94的营养补充物、61/282的肽类氮源、28/96的渗透压环境以及40/96的pH环境可以诱导立枯丝核菌形成菌核;其中,N-乙酰-d-氨基葡萄糖、尿苷3′-单磷酸盐、磷酸胆碱和5种二肽(Arg-Trp、Met-Arg、Pro-Phe、Val-Tyr、Val-Met),以及10 mmol/L、20 mmol/L硫酸铵(pH 8.0)和pH 4.5+l-脯氨酸3种环境条件可显著促进立枯丝核菌菌核的形成;立枯丝核菌在pH 4.0-10.0范围内均能形成菌核;KEGG分析显示,诱导菌核形成的物质主要参与了代谢途径、ABC转运蛋白、次生代谢物生物合成和d-氨基酸代谢等通路。

结论

营养限制和环境胁迫是诱导立枯丝核菌菌核形成的关键因素。在营养受限的条件下,适宜立枯丝核菌形成菌核的物质包括d-山梨醇、d-木糖、N-乙酰-d-半乳糖胺、d-阿拉伯糖和d-松三糖等5种碳源;N-乙酰-d-氨基葡萄糖、腺苷和胸腺嘧啶等3种氮源;尿苷3′-单磷酸盐和磷酸胆碱等2种磷源;吐温-80等1种营养补充物;以及Arg-Trp、Met-Arg、Pro-Phe、Val-Tyr和Val-Met等5种肽类氮源。适宜的渗透压环境为10 mmol/L、20 mmol/L硫酸铵(pH 8.0),适宜的pH环境为pH 4.0-4.5和pH 9.5-10.0。本研究结果为立枯丝核菌菌核形成机制的研究奠定了基础。

立枯丝核菌(Rhizoctonia solani Kühn),隶属于担子菌门(Basidiomycota),最早由Kühn于1858年在马铃薯上发[

1]。目前,立枯丝核菌可分为14个融合群(anastomosis groups, AGs)[2],部分融合群又根据其形态、寄主范围以及DNA序列的差异被细分为不同亚[3-4]。作为一种典型的土传真菌,该菌能够侵染包括绝大多数谷类作物、蔬菜、水果(或果树)以及观赏植物在内的广泛寄主,引起种腐、根腐、冠腐、茎腐、纹枯和立枯等多种病[5]。立枯丝核菌因其广泛的寄主范围和多样的病害类型,已成为农业生产中影响最广的病原菌之一。

菌核是部分真菌在生长条件受限或受到不良环境胁迫时,由营养菌丝聚集形成的一种特殊休眠体结构,其形态多样,能在环境条件适宜时萌发,形成无性或有性繁殖结[

6]。立枯丝核菌的菌核形状不规则,表面粗糙坚硬,多呈浅褐色至黑褐色,且内外颜色一致。由于菌核的存在,立枯丝核菌可以适应多种极端环境,并抵御杀菌剂的胁迫,从而增加菌株的抗药[7-8]。据报道菌核可在土壤或植物残体中存活多年,待环境条件适宜时又能迅速萌发,成为初侵染源侵染植[9-10]。菌核的存在无疑为农业生产中立枯丝核菌所引发的病害防治带来了巨大挑战。

虽然菌核能够抵御多种不良环境,但其形成也受温度、光照、pH、活性氧(reactive oxygen species, ROS)以及营养物质等环境因子的影[

11-14]。Biolog表型芯片技术是一种与基因组学和蛋白组学并列的技术,能够同时测定微生物在190种碳源、95种氮源、282种肽类、94种磷硫源、94种营养补充物,以及96种渗透压和96种pH环境下的代谢情况。因此,本研究利用Biolog表型芯片技术分析立枯丝核菌菌核形成过程中所需的代谢底物,旨在了解营养元素和环境因子对其菌核形成的影响,并为通过抑制菌核形成来进行病害防控技术的研究提供参考依据。

1 材料与方法

1.1 材料

供试立枯丝核菌LK4菌株分离自贵州省遵义市染病烟苗。d-葡萄糖、无水磷酸二氢钾和硫酸钠均购自西格玛奥德里奇(上海)贸易有限公司;酵母氮源购自BD医疗器械有限公司;0.2 μm注射器过滤膜购自颇尔生命科学有限公司;OmniLog PM高通量微生物细胞表型测定系统、浊度计、FF-IF接种液和表型微阵列(Phenotype MicroArray, PM)微孔板PM1、PM2A、PM3B、PM4A、PM5、PM6、PM7、PM8、PM9、PM10均购自Biolog公司。

1.2 试剂及菌丝悬浮液制备

d-葡萄糖溶液:准确称量57.664 g d-葡萄糖用灭菌水溶解并定容至100 mL。PM (3B、5、6、7、8)添加液:称取0.816 6 g无水磷酸二氢钾和0.341 g硫酸钠用灭菌水溶解定容至100 mL。PM (9、10)添加液:称取8.04 g酵母提取物用灭菌水溶解并定容至100 mL。将d-葡萄糖溶液和2种PM添加液分别使用0.2 μm过滤膜过滤除菌。立枯丝核菌菌丝片段的制备:将PDB中静置培养72 h的立枯丝核菌菌丝用无菌纱布过滤,去除菌丝包裹的菌碟后,用灭菌蒸馏水冲洗菌丝去除其携带的培养基,反复冲洗3遍后将菌丝置于灭菌研钵中,加入适量灭菌水充分研磨以制成菌丝片段悬浮液。最后使用浊度仪测量并调节悬浮液浊度至62%。

1.3 微孔板接种及孵育

各微孔板接种成分如表1所示,PM1和PM2A微孔板接种成分相同,PM3B、PM5、PM6、PM7和PM8微孔板接种成分相同,PM9和PM10微孔板接种成分相同,PM4A微孔板与其他微孔板不同。采用8通道移液器将配制好的混合接种液加入到相应微孔板中,每孔100 μL。微孔板完成接种并经封口膜封闭后,置于OmniLog PM系统中28 ℃孵育240 h。

表1  各微孔板中添加的物质成分及用量
Table 1  Composition and dosage of substances added to each microplate
SolutionsPM1, 2APM3B, 5, 6,7, 8PM4APM9, 10
FF-IF inoculum (mL) 20.00 50.00 10.00 20.00
d-glucose (mL) - 1.88 0.38 0.75
PM additive solution (mL) - 5.00 - 2.00
Mycelial fragment suspension (mL) 0.50 1.25 0.25 0.50
Sterile water (mL) 3.50 1.88 1.38 0.75
Total volume (mL) 24.00 60.00 12.00 24.00

-: Indicates that the corresponding substance has not been added to the solution.

1.4 菌核形成能力评估

培养结束后,综合评估各微孔中菌核的数量及体积大小,以评价菌核的形成情况。菌核形成能力等级划分如下:++++表示极强;+++表示强;++表示一般;+表示弱。

2 结果与分析

2.1 碳源对立枯丝核菌菌核形成的影响

在95种供试碳源中共有19种可以诱导立枯丝核菌形成菌核,其中在d-山梨醇(d-sorbitol)、d-木糖(d-xylose)、N-乙酰-d-半乳糖胺(N-acetyl-d-galactosamine)、d-阿拉伯糖(d-arabinose)和d-松三糖(d-melezitose)诱导下菌核形成能力一般;而在其余14种碳源诱导下,菌核形成能力较弱(表2)。KEGG分析结果表明,诱导菌核形成的碳源主要参与的代谢通路包括代谢途径(metabolic pathways)、ABC转运蛋白(ABC transporters)、戊糖和葡萄糖醛酸相互转化(pentose and glucuronate interconversions)、半乳糖代谢(galactose metabolism)和次生代谢物生物合成(biosynthesis of secondary metabolites)等(原始数据存储在国家微生物科学数据中心,网址为http://nmdc.cn,编号为NMDCX0001772)。

表2  诱导立枯丝核菌菌核形成的碳源
Table 2  The carbon source promotes the development of sclerotia in Rhizoctonia solani
MicroplateWellSubstrateSclerotial formation
PM1 B02 d-sorbitol ++
B03 Glycerol +
B08 d-xylose ++
C03 d,l-malic acid +
C08 Acetic acid +
D05 Tween-40 +
D10 Lactulose +
E07 α-hydroxybutyric acid +
F05 Fumaric acid +
H06 l-lyxose +
PM2A B01 N-acetyl-d-galactosamine ++
B05 d-arabinose ++
C01 Gentiobiose +
C04 d-melezitose ++
C12 Palatinose +
D01 d-raffinose +
D04 l-sorbose +
D07 Turanose +
G12 l-methionine +

2.2 氮源对立枯丝核菌菌核形成的影响

立枯丝核菌在PM3B微孔板中的产核情况表明,22%的供试氮源(21/95)可诱导菌核形成,其中N-乙酰-d-氨基葡萄糖(N-acetyl-d-glucosamine)诱导下的菌核形成能力最强,腺苷(adenosine)和胸腺嘧啶(thymidine)次之(表3)。KEGG分析结果表明,N-乙酰-d-氨基葡萄糖参与氨基糖和核苷酸糖代谢(amino sugar and nucleotide sugar metabolism)、代谢途径、核苷酸糖的生物合成(biosynthesis of nucleotide sugars)、ABC转运蛋白和磷酸转移酶系统(phosphotransferase system, PTS) 5条代谢通路。诱导菌核形成的氮源主要参与的代谢通路包括代谢途径、ABC转运蛋白、次生代谢物生物合成和d-氨基酸代谢(d-amino acid metabolism)等(编号为NMDCX0001772)。

表3  PM3B微孔板中诱导立枯丝核菌菌核形成的氮源
Table 3  The nitrogen source promotes the development of sclerotia in Rhizoctonia solani on PM3B microplate
WellSubstrateSclerotial formation
A04 Nitrate +
A10 l-aspartic acid ++
A12 l-glutamic acid +
B01 l-glutamine ++
B10 l-serine +
C01 l-tyrosine +
C05 d-aspartic acid +
C08 d-serine +
D04 Hydroxylamine +
D06 N-amylamine +
D12 Agmatine +
E08 d-glucosamine +
E11 N-acetyl-d-glucosamine ++++
F03 Adenosine +++
F04 Cytidine +
F08 Thymine +
F09 Thymidine +++
H03 Ala-Glu +
H04 Ala-Gly +
H05 Ala-His +
H10 Gly-Glu ++

2.3 磷、硫源对立枯丝核菌菌核形成的影响

磷、硫作为细胞结构的组成成分以及酶活性的参与者,在94种供试磷、硫源中仅有16种能够诱导立枯丝核菌产生菌核(表4)。其中,立枯丝核菌在尿苷3′-单磷酸盐(uridine 3′- monophosphate)和磷酸胆碱(phosphoryl choline)诱导下的菌核形成能力极强。KEGG分析显示,尿苷3′-单磷酸盐参与的代谢通路包括代谢途径和嘧啶代谢(pyrimidine metabolism),而磷酸胆碱参与的代谢通路包括壁聚糖酸生物合成(teichoic acid biosynthesis)、甘油磷脂代谢(glycerophospholipid metabolism)、代谢途径和癌症中的胆碱代谢(choline metabolism in cancer) (编号为NMDCX0001772)。

表4  PM4A微孔板中诱导立枯丝核菌菌核形成的磷、硫源
Table 4  The phosphorus and sulfur source promote the development of sclerotia in Rhizoctonia solani on PM4A microplate
WellSubstrateSclerotial formation
A09 Adenosine 3′-monophosphate +
B09 Guanosine 3′-monophosphate +
C04 d-glucose-6-phosphate ++
D04 Phospho-l-arginine +
D07 o-phospho-l-threonine +
D09 Uridine 3′-monophosphate ++++
E04 Phosphoryl choline ++++
E11 Inositol hexaphosphate +
F06 Dithiophosphate +
G12 l-methionine sulfone +
H02 Thiourea +
H03 1-thio-β-d-glucose +
H05 Taurocholic acid +
H06 Taurine +
H09 Butane sulfonic acid +
H11 Methane sulfonic acid +

2.4 营养补充物质对立枯丝核菌菌核形成的影响

在PM5微孔板中可诱导立枯丝核菌形成菌核的物质数量最多,占供试营养补充物的73% (69/94),但其诱导菌核形成的能力大多为一般或较弱(表5)。KEGG分析显示,诱导菌核形成的营养补充物质主要参与的代谢通路包括代谢途径、ABC转运蛋白、次生代谢物生物合成、辅因子生物合成(biosynthesis of cofactors)、核苷酸代谢(nucleotide metabolism)和氨基酸生物合成(biosynthesis of amino acids)等(编号为NMDCX0001772)。

表5  PM5微孔板中诱导立枯丝核菌菌核形成的营养补充物质
Table 5  The nutrient supplement source promotes the development of sclerotia in Rhizoctonia solani on PM5 microplate
WellSubstrateSclerotial formationWellSubstrateSclerotial formation
A06 l-aspartic acid + E07 β-alanine +
A08 l-glutamic acid + E08 d-pantothenic acid +
A10 Adenine + E09 Orotic acid +
A11 Adenosine ++ E11 Uridine +
A12 2′-deoxyadenosine + E12 2′-deoxyuridine +
B01 l-glutamine + F01 Quinolinic acid +
B02 Glycine + F02 Nicotinic acid +
B04 l-isoleucine + F03 Nicotinamide ++
B06 l-lysine + F04 β-nicotinamide adenine dinucleotide +
B08 l-phenylalanine + F05 δ-amino-levulinic acid +
B09 Guanosine 3′,5′-cyclic monophosphate + F06 Hematin +
B10 Guanine + F07 Deferoxamine +
B11 Guanosine + F08 α-d-glucose +
B12 2′-deoxyguanosine + F09 N-acetyl-d-glucosamine +
C01 l-proline + F10 Thymine +
C03 l-threonine + F11 Glutathione +
C06 l-valine + F12 Thymidine +
C07 l-isoleucine+l-valine + G01 Oxaloacetic acid +
C08 Hydroxy-l-proline ++ G03 Cyanocobalamin +
C09 (5)4-amino-imidazole-4(5)-carboxamide + G04 ρ-amino-benzoic acid +
C10 Hypoxanthine + G05 Folic acid +
C11 Inosine + G06 Inosine+thiamine +
C12 2′-deoxyinosine + G08 Thiamine pyrophosphate +
D02 l-citrulline + G10 Pyrrolo-quinoline quinone +
D03 Chorismic acid + G12 Myo-inositol ++
D04 (-)Shikimic acid + H01 Butyric acid +
D05 l-homoserine lactone + H03 α-ketobutyric acid +
D07 d-aspartic acid ++ H04 Caprylic acid +
D08 d-glutamic acid + H06 d,l-mevalonic acid +
D10 Cytosine + H07 d,l-carnitine +
D11 Cytidine + H08 Choline ++
D12 2′-deoxycytidine + H10 Tween-40 +
E01 Putrescine + H11 Tween-60 +
E02 Spermidine + H12 Tween-80 +++
E03 Spermine +

2.5 肽类氮源对立枯丝核菌菌核形成的影响

PM6、PM7和PM8微孔板用于检测肽类氮源对立枯丝核菌菌核形成的影响。结果表明,在282种供试肽类氮源中,共有61种可诱导立枯丝核菌形成菌核,其中Arg-Trp、Met-Arg、Pro-Phe、Val-Tyr和Val-Met等5种肽类氮源诱导菌核形成的能力极强;Ala-Leu、Ile-Phe、Ile-Tyr、Phe-Pro、Ala-Val和γ-Glu-Gly等6种肽类氮源诱导菌核形成的能力较强(表6)。

表6  诱导立枯丝核菌菌核形成的肽类氮源
Table 6  The peptide nitrogen source promotes the development of sclerotia in Rhizoctonia solani
MicroplateWellSubstrateSclerotial formationMicroplateWellSubstrateSclerotial formation
PM6 A05 Ala-Asn + PM7 D01 Phe-Pro +++
A06 Ala-Glu + D10 Pro-Phe ++++
A09 Ala-Leu +++ E04 Ser-Leu +
A11 Ala-Phe + E06 Ser-Phe +
B01 Ala-Ser + F04 Thr-Met +
B02 Ala-Thr + F06 Trp-Ala +
B05 Arg-Ala + G02 Trp-Ser +
B07 Arg-Asp ++ H03 Val-Arg ++
B08 Arg-Gln + H04 Val-Asn +
C02 Arg-Phe ++ H10 Val-Tyr ++++
C04 Arg-Trp ++++ PM8 A03 Ala-Asp ++
C07 Asn-Glu + A07 Ala-Val +++
D05 Gln-Gln + A10 Asp-Gly +
D06 Gln-Gly ++ A11 Glu-Ala +
D07 Glu-Asp + A12 Gly-Asn +
D08 Glu-Glu + B01 Gly-Asp ++
D09 Glu-Gly + B02 Gly-Ile +
D10 Glu-Ser + C11 Pro-Arg +
E01 Glu-Val + D07 Ser-Asn +
E04 Gly-Cys + D08 Ser-Asp +
E11 Gly-Pro + D10 Ser-Glu +
F07 His-Leu + E02 Thr-Ser ++
G04 Ile-Arg + E08 Val-Glu +
G05 Ile-Gln + E10 Val-Met ++++
G10 Ile-Phe +++ F07 d-Ala-d-Ala +
H02 Ile-Tyr +++ G01 γ-Glu-Gly +++
PM7 A02 l-glutamine + G03 Gly-d-Ala ++
B04 Lys-Trp + G04 Gly-d-Asp +
B07 Met-Arg ++++ H04 Gly-Gly-Ile +
C03 Met-Lys + H12 Tyr-Gly-Gly +
C09 Phe-Ala +

2.6 渗透压环境对立枯丝核菌菌核形成的影响

在96种渗透压环境中,共有28种可诱导立枯丝核菌产生菌核,其中10 mmol/L和20 mmol/L硫酸铵(ammonium sulfate)诱导菌核形成能力最强,其次是60 mmol/L硝酸钠(sodium nitrate) (表7)。KEGG分析表明,在28种渗透压环境中,仅磷酸钠(sodium phosphate)、苯甲酸钠(sodium benzoate)、乙二醇(ethylene glycol)和尿素(urea)参与了代谢通路,参与数量分别为10、10、4和11 (编号为NMDCX0001772)。

表7  PM9微孔板中诱导立枯丝核菌菌核形成的渗透压环境
Table 7  The osmotic pressure environment promotes the development of sclerotia in Rhizoctonia solani on PM9 microplate
WellSubstrateSclerotialformation
D01 3% Potassium chloride +
D02 4% Potassium chloride +
D05 2% Sodium sulfate +
D06 3% Sodium sulfate ++
D07 4% Sodium sulfate +
D08 5% Sodium sulfate ++
D09 5% Ethylene glycol +
D10 10% Ethylene glycol ++
D11 15% Ethylene glycol +
D12 20% Ethylene glycol ++
E07 2% Urea +
F01 1% Sodium lactate ++
F02 2% Sodium lactate ++
F11 11% Sodium lactate +
G01 20 mmol/L Sodium phosphate pH 7.0 ++
G02 50 mmol/L Sodium phosphate pH 7.0 +
G04 200 mmol/L Sodium phosphate pH 7.0 ++
G05 20 mmol/L Sodium benzoate pH 5.2 ++
G09 10 mmol/L Ammonium sulfate pH 8.0 ++++
G10 20 mmol/L Ammonium sulfate pH 8.0 ++++
G11 50 mmol/L Ammonium sulfate pH 8.0 ++
G12 100 mmol/L Ammonium sulfate pH 8.0 ++
H01 10 mmol/L Sodium nitrate ++
H02 20 mmol/L Sodium nitrate +
H03 40 mmol/L Sodium nitrate ++
H04 60 mmol/L Sodium nitrate +++
H05 80 mmol/L Sodium nitrate ++
H06 100 mmol/L Sodium nitrate ++

2.7 pH环境对立枯丝核菌菌核形成的影响

表8所示,立枯丝核菌在pH 4.0-10.0的范围内均能产生菌核,且在pH 4.0、4.5、9.5和10.0时,菌核形成能力较强;在pH 5.0-9.0时,菌核形成能力一般或较弱。此外,在pH 4.5+l-脯氨酸(l-proline)环境下立枯丝核菌的菌核形成能力最强(图1)。在诱导菌核形成的pH环境中,共有18种底物参与了代谢通路,主要包括代谢途径、氨基酸生物合成、次生代谢物生物合成、蛋白质消化和吸收(protein digestion and absorption)、ABC转运蛋白和氨酰基tRNA生物合成(aminoacyl-tRNA biosynthesis)等(编号为NMDCX0001772)。

表8  PM10微孔板中诱导立枯丝核菌菌核形成的pH环境
Table 8  The pH environment promotes the development of sclerotia in Rhizoctonia solani on PM10 microplate
WellSubstrateSclerotial formation
A02 pH 4.0 +++
A03 pH 4.5 +++
A04 pH 5.0 ++
A05 pH 5.5 ++
A06 pH 6.0 +
A07 pH 7.0 +
A10 pH 9.0 ++
A11 pH 9.5 +++
A12 pH 10.0 +++
B01 pH 4.5 +++
B02 pH 4.5+l-alanine +
B03 pH 4.5+l-arginine ++
B04 pH 4.5+l-asparagine ++
B06 pH 4.5+l-glutamic acid +
B07 pH 4.5+l-glutamine +++
B08 pH 4.5+Glycine +
B09 pH 4.5+l-histidine +
C02 pH 4.5+l-phenylalanine ++
C03 pH 4.5+l-proline ++++
C04 pH 4.5+l-serine ++
C05 pH 4.5+l-threonine +
C07 pH 4.5+l-citrulline ++
C08 pH 4.5+l-valine +++
C09 pH 4.5+Hydroxy-l-proline ++
C10 pH 4.5+l-ornithine ++
C11 pH 4.5+l-homoarginine ++
C12 pH 4.5+l-homoserine +
D02 pH 4.5+l-norleucine ++
D11 pH 4.5+Trimethylamine-N-oxide +
E10 pH 9.5+l-isoleucine ++
F12 pH 9.5+l-homoserine +
G03 pH 9.5+l-norvaline ++
H01 X-caprylate +++
H05 X-β-d-galactoside +
H06 X-α-d-glucuronide +
H07 X-β-d-glucuronide ++
H08 X-β-d-glucosaminide ++
H09 X-β-d-galactosaminide ++
H10 X-α-d-mannoside ++
H12 X-SO4 ++
fig

图1  立枯丝核菌在代表性微孔板PM10中菌核的形成情况

Figure 1  Sclerotial formation of Rhizoctonia solani in representative microplate PM10.

3 讨论

营养限制是诱导菌核形成的重要因[

15]。Christias[16]发现,在营养充足的条件下,核盘菌的菌丝体得以持续生长,但菌核形成时间显著推迟。Cooke[17]研究表明,在营养受限的条件下,菌株会优先将有限的营养物质集中用于菌核的形成,以增强其抵御不良环境的能力。在本研究中,微孔板各孔中预先填充了极少量的营养物质,接种100 μL接种液后,立枯丝核菌即处于营养受限状态。因此,能够在该条件下诱导菌核形成的物质,必定在菌核形成过程中发挥重要作用。N-乙酰-d-氨基葡萄糖、尿苷3′-单磷酸盐、磷酸胆碱和5种二肽(Arg-Trp、Met-Arg、Pro-Phe、Val-Tyr、Val-Met)已被证实在营养受限的微孔环境中显著诱导立枯丝核菌的菌核形成。此外,其他178种物质也可诱导立枯丝核菌菌核形成,但诱导能力存在差异。KEGG分析表明,这些物质主要参与了代谢途径、ABC转运蛋白、次生代谢物生物合成和d-氨基酸代谢等常规代谢通路。相比之下,显著诱导菌核形成的N-乙酰-d-氨基葡萄糖、尿苷3′-单磷酸盐和磷酸胆碱还参与了氨基糖和核苷酸糖代谢、核苷酸糖的生物合成、磷酸转移酶系统、嘧啶代谢、壁聚糖酸生物合成和甘油磷脂代谢等特有代谢通路。

ROS在菌核形成过程中起着关键作用。它们在真核生物的正常新陈代谢中产生,并在生物体内维持低浓度以避免对细胞造成损[

18]。研究表明,菌丝向菌核分化时ROS产量增加,其积累可能诱导菌核形成,同时菌核形成消耗ROS以保护细胞免受其毒性影[19-20]。渗透压环境的改变往往会引起微生物的氧化应激反应,导致细胞内氧化还原失衡,ROS增加。本研究发现,PM9微孔板中28种渗透压环境可诱导菌核形成,其中硫酸铵、硝酸钠和乳酸钠诱导菌核的能力随浓度增加先强后弱。这可能是由于高浓度情况下产生的ROS超过了细胞消耗的阈值,导致细胞受损,最终影响菌核的形成。至于磷酸钠、氯化钾、硫酸钠和乙二醇诱导菌核形成能力不受其浓度影响的原因尚待进一步研究。

对于环境pH,普遍认为偏酸性环境有利于菌核形成,而中性或碱性环境会抑制其形成。然而,本研究发现立枯丝核菌在pH 4.0-10.0的范围内均能形成菌核,这可能是由于菌株通过代谢活动改变了培养环境的pH值。具体而言,在中等碱性环境(pH 8.0-9.0)中菌株可降低培养基的pH值,创造适宜的酸性环境以促进菌核形[

12,21]。在PM10微孔板中,立枯丝核菌在pH 4.5且添加脯氨酸的环境中菌核形成能力最强,这可能归因于2个因素:(1) pH 4.5提供了适宜的酸性环境,有利于立枯丝核菌菌核形成;(2) 脯氨酸在微生物抵御不良环境中具有多重功能,包括作为渗透压调节物质维持细胞水分平衡、与蛋白质结合形成保护膜以保护生物大分子的结构与活性,以及减少ROS的积累,降低氧化应激对细胞的伤害。这些功能共同促进了立枯丝核菌的菌核形成。

4 结论

本研究通过Biolog表型芯片技术,深入分析了立枯丝核菌菌核形成过程中对不同物质成分以及渗透压和pH环境的代谢响应。结果显示,在供试的物质及环境中分别有19/95的碳源、21/95的氮源、16/94的磷硫源、69/94的营养补充物、61/282的肽类氮源、28/96的渗透压环境以及40/96的pH环境(pH 4.0-10.0)可诱导立枯丝核菌形成菌核。适宜菌核形成的碳源包括d-山梨醇、d-木糖、N-乙酰-d-半乳糖胺、d-阿拉伯糖和d-松三糖;氮源包括N-乙酰-d-氨基葡萄糖、腺苷和胸腺嘧啶,磷源包括尿苷3′-单磷酸盐和磷酸胆碱;营养补充物质包括吐温-80;肽类氮源包括Arg-Trp、Met-Arg、Pro-Phe、Val-Tyr和Val-Met;适宜的渗透压环境为10 mmol/L和20 mmol/L硫酸铵(pH 8.0);适宜的pH环境为pH 4.0-4.5和pH 9.5-10.0。可诱导立枯丝核菌形成菌核的物质主要参与的代谢通路包括代谢途径、ABC转运蛋白、次生代谢物生物合成和d-氨基酸代谢等。

作者贡献声明

向立刚:实验设计、实施,论文初稿撰写;汪汉成:研究方案制定,论文修订;蔡刘体:实验实施,数据统计;陈丽莉:实验实施,数据统计;张文建:实验指导,论文修订;王军:实验指导,论文修订;孟建玉:实验指导,论文修订;杨靓:论文修订;温明霞:实验实施,数据统计。

利益冲突

作者声明不存在任何可能会影响本文所报告工作的已知经济利益或个人关系。

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