• 2009年第49卷第11期文章目次
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    • >学科先贤
    • 注重生理学研究的植物病理学家——林传光

      2009, 49(11).

      摘要 (914) HTML (0) PDF 530.28 K (1338) 评论 (0) 收藏

      摘要:

    • >小型综述
    • 浸矿细菌——喜温硫杆菌研究进展

      2009, 49(11):1411-1417.

      摘要 (1414) HTML (0) PDF 622.45 K (2112) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:生物冶金技术具有良好的发展前景。喜温硫杆菌是生物冶金过程中的优势浸矿菌之一,在混合浸矿体系中可协助铁氧化细菌显著提高浸矿效率。本文在分析相关文献的基础上,并结合本实验室的研究工作,从喜温硫杆菌在浸矿过程中的作用机制、抗砷机制、基因组学研究和遗传改造等方面的研究进展进行了综述,并对未来相关研究方向做了展望,旨在为喜温硫杆菌研究提供参考。

    • 超嗜热古菌遗传操作系统研究进展

      2009, 49(11):1418-1423.

      摘要 (1463) HTML (0) PDF 613.09 K (2401) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:遗传操作系统,是研究基因和基因产物功能的一个极为重要的工具。超嗜热古菌遗传操作系统方面的研究落后于甲烷菌及嗜盐古菌中的研究,主要原因是选择标记的缺乏。然而,近十年来,在以硫化叶菌(Sulfolobus)为代表的超嗜热泉古菌和Thermococcus kodakaraensis为代表的超嗜热广古菌中,遗传操作系统研究取得了很大的进展。本文主要对这两种超嗜热古菌的遗传操作系统进展以及应用进行概述。

    • >分类和进化
    • 硇洲岛海胆可培养细菌的多样性

      2009, 49(11):1424-1429.

      摘要 (1452) HTML (0) PDF 746.09 K (2325) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】研究南海硇洲岛马粪海胆(Hemicentrotus pulcherrimus)可培养细菌多样性。【方法】采用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对样品中细菌(含放线菌)多样性进行研究。【结果】用补充0~2.0 mol/L NaCl的MA、ISP 2、NA、SWA和HAA培养基从海胆样品中分离到106株细菌菌株,根据形态观察和部分生理生化实验结果去冗余,选取34个代表性菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育多样性分析。结果表明,这些分离菌株代表21个物种,属于3个大的系

    • 先锋牧草-香根草联合固氮菌多样性研究

      2009, 49(11):1430-1437.

      摘要 (1356) HTML (0) PDF 1.21 M (2213) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】香根草(Vetiver zizanioides)是一种多年生禾本科草本植物,具有极强的生态适应性和抗逆能力,可作饲料和水土保持用。通过研究香根草联合固氮菌多样性,为进一步研究和应用打下基础。【方法】采用无氮培养基,首次从香根草中分离到47株联合固氮菌,分别应用SDS-PAGE全细胞蛋白质电泳、DNA指纹图谱、唯一碳源和16S rDNA全序列测定等方法,进行聚类和多样性分析。【结果】SDS-PAGE、IS-PCR和Bio-BIQA碳源利用的聚类结果基本一致,将供试菌株分为6个类群和4个单菌株;

    • 泡菜、传统腊肠中降胆固醇乳酸菌的筛选及鉴定

      2009, 49(11):1438-1444.

      摘要 (2114) HTML (0) PDF 891.05 K (2063) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】筛选具有降胆固醇功能的乳酸菌菌株,为乳酸菌体外、体内的降胆固醇生理特性和机理研究奠定基础。【方法】以碳酸钙-MRS选择性培养基(Calcium Carbonate-Man Rogosa and Sharp Medium)从中国传统食品泡菜、腊肠中筛选乳酸菌,应用改良的胆固醇筛选培养基筛选具有较高降胆固醇能力的乳酸菌菌株,并研究其耐酸性,耐胆盐活性,生长曲线及产酸特性;结合菌落形态学、接触酶反应、革兰氏染色、碳水化合物微量鉴定管及16SrRNA寡核苷酸碱基序列分析鉴定菌株。【结果】筛选得到的两

    • >遗传和分子生物学
    • 极端嗜盐古菌中CRISPR结构的生物信息学分析

      2009, 49(11):1445-1453.

      摘要 (1473) HTML (0) PDF 690.97 K (2841) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】利用生物信息学方法了解目前拥有全基因组序列的极端嗜盐古菌中CRISPR结构的特征。【方法】通过比对,保守性分析,GC含量分析,RNA结构预测等方法对已有全基因组序列的嗜盐古菌基因组进行研究。【结果】在5株嗜盐古菌基因组中发现CRISPR结构,在leader序列内得到具有回文性质的保守motif。发现在大CRISPR结构内repeat序列具有很强的保守性。同时根据第四位碱基的不同,repeat序列可形成两类不同的RNA二级结构。【结论】leader序列中回文结构的发现对其可能为蛋白结合位点的假

    • 报告基因法比较两种放线菌启动子的活性

      2009, 49(11):1454-1458.

      摘要 (2090) HTML (0) PDF 1.00 M (2490) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】比较启动子Psf与红霉素抗性基因启动子(PermE*)在链霉菌中的表达强度差异。【方法】本文利用卡那霉素抗性梯度以及邻苯二酚2,3-双加氧酶显色系统,比较了两个启动子的表达差异。【结果】两个启动子在棒状链霉菌(Streptomyces clavuligerus) NRRL3585、天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)M145,委内瑞拉链霉菌(Streptomyces venezuelae)ISP5230及变铅青链霉菌(Streptomyces lividans TK

    • 新型隐球酵母铜应答转录因子Cuf1与荚膜的生物合成的相关性研究

      2009, 49(11):1459-1464.

      摘要 (1464) HTML (0) PDF 1.10 M (1938) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】新型隐球酵母是人类条件致病真菌,主要感染免疫缺陷患者。该酵母最显著的特征是细胞外包被主要的致病因子-多糖荚膜,其调控机制复杂。本文研究旨在阐述编码铜依赖转录因子的CUF1基因对其荚膜生物合成的负调控作用。【方法】以野生型菌株为对照,对CUF1缺失的突变菌株进行菌落形态观察、荚膜墨汁染色的显微观察、细胞聚沉试验以及荚膜定量分析。【结果】与野生型菌株相比,Δcuf1突变株产生的菌落更粘,显微镜下亦可明显观察到荚膜更厚。同样数量的细胞,突变株聚沉平衡后体积更大。此外,荚膜粗提物定量称重分析也证明突

    • 华癸中生根瘤菌质粒复制基因repC的克隆与鉴定

      2009, 49(11):1465-1467.

      摘要 (1636) HTML (0) PDF 1.07 M (1757) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】repC为质粒复制必需的起始蛋白基因。本研究旨在对华癸中生根瘤菌菌株HN3015及其质粒消除突变株进行repC基因的克隆和鉴定。【方法】采用通用引物RC1和RC3进行repC基因的PCR扩增,扩增产物克隆到载体pMD-18T,然后测序。利用Southern 杂交对repC基因定位。利用在线软件分析基因的序列特征,BLAST 工具进行同源性搜索;ExPASy推断其氨基酸的序列;ClustalW进行同源核苷酸和氨基酸序列的多重比较分析;PredictProtein 进行蛋白二级结构分析。【结果】

    • >生理和代谢
    • 集胞藻PCC6803 EGY同源基因破坏突变体的构建及表型分析

      2009, 49(11):1468-1476.

      摘要 (1478) HTML (0) PDF 1.26 M (1856) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:拟南芥中近来发现的定位于叶绿体的膜嵌合金属蛋白酶EGY1影响叶绿体发育与脂肪酸合成,经生物信息学分析,集胞藻PCC6803 (Synechocystis sp. PCC6803)中slr0643、sll0862基因编码同源蛋白。【目的】为了鉴定这两个基因的功能,【方法】本文通过同源重组插入卡那霉素抗性基因、切断目的基因,分别构建了slr0643::km和sll0862::km两种突变体,检测突变体的生理生化表型。【结果】在30℃,20 μE/m2s自养培养下,slr0643::km与野生型相比,早期

    • 灰黄青霉Pa-pex11基因对青霉素产生的影响

      2009, 49(11):1477-1482.

      摘要 (1286) HTML (0) PDF 1.32 M (2233) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】研究灰黄青霉Pa-pex11对青霉素产生的影响。【方法】通过保守序列设计引物从灰黄青霉中克隆了含有pex11同源基因DNA片段,进而通过热不对称交错PCR(Thermal asymmetric interlaced PCR, Tail PCR )扩增得到灰黄青霉中Pa-pex11基因的全序列。利用根癌农杆菌介导的遗传转化(ATMT)系统,在灰黄青霉基因组上导入额外的Pa-pex11基因。对灰黄青霉野生型菌株和转化子进行了青霉素发酵及生物活性测定。通过荧光定量PCR(quantitative

    • 异源表达NADH选择性氧化酶提高光滑球拟酵母酵解速率及丙酮酸生产强度

      2009, 49(11):1483-1488.

      摘要 (1355) HTML (0) PDF 1.27 M (3125) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】为进一步提高光滑球拟酵母(Torulopsis glabrata)葡萄糖代谢速率及丙酮酸生产强度。【方法】将源于荚膜胞浆菌(Histoplasma capsulatum)的编码选择性氧化酶的AOX1基因过量表达于T. glabrata中,获得了一株线粒体内NADH氧化途径发生改变且胞内总NADH 氧化酶活性提高1.8倍的重组菌株AOX。【结果】与出发菌株CON比较,细胞浓度以及发酵周期降低了20.3%和10.7%,而平均比葡萄糖消耗速率和丙酮酸合成速率分别提高了34.7%和54.1%。其原因

    • 超高压处理对副溶血性弧菌的影响研究

      2009, 49(11):1489-1493.

      摘要 (1237) HTML (0) PDF 1.76 M (1613) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】探讨超高压致死微生物的机理。【方法】本文以副溶血性弧菌为对象,研究了超高压处理对副溶血性弧菌的灭菌效果、对副溶血性弧菌细胞超微结构、细胞无机盐离子含量以及细胞膜蛋白的影响。【结果】结果表明,在20℃下分别经100、200 MPa高压处理10min后,副溶血性弧菌致死率为40%、84.7%,经300 MPa及以上的压力处理,副溶血性弧菌的致死率为100%。超高压处理对细菌细胞形态结构造成明显的损伤:局部细胞壁遭到破坏,出现缺口;胞质内含物结构紊乱,出现泄漏,细胞中部出现透电子区;细胞结构不完整

    • 海洋芽孢杆菌(Bacillus marinus)B-9987菌株抑制病原真菌机理的研究

      2009, 49(11):1494-1501.

      摘要 (1472) HTML (0) PDF 1.20 M (1738) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】:探讨海洋芽孢杆菌(Bacillus marinus)B-9987菌株的代谢产物BMME-1,对植物病原真菌茄链格孢菌的抑菌作用机理。【方法】分别使用分光光法、气相色谱-质谱GC-MS联用技术、红外光谱法等,检测了BMME-1处理病原真菌后,菌体渗透性、细胞壁及细胞膜成份的变化。【结果】BMME-1对茄链格孢菌的抑菌中浓度(MIC50)为6.2 mg/L,最小杀菌浓度(MFC)为50 mg/L,在MIC50浓度或高于此浓度处理靶标菌,将导致菌体蛋白质、核酸等大分子物质的外流;处理菌株葡聚糖结

    • >酶和蛋白质
    • 猪繁殖与呼吸综合征病毒Nsp2蛋白原核表达纯化及其蛋白酶活性分析

      2009, 49(11):1502-1509.

      摘要 (1257) HTML (0) PDF 1.63 M (2282) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】表达并纯化猪繁殖与呼吸综合征病毒非结构蛋白2(Nsp2),分析Nsp2的蛋白酶活性。【方法】本研究通过PCR分别扩增nsp2基因的N端和C端,利用原核表达载体pET21a(+)表达Nsp2蛋白的N端和C端(即Nsp2-N 和 Nsp2-C),通过Ni-NTA琼脂糖亲和层析和凝胶过滤的方法纯化两个重组蛋白。预测Nsp2-N含有半胱氨酸蛋白酶结构域,本研究利用western blot检测其顺式酶切蛋白酶活性;并人工合成潜在的十肽底物,利用体外多肽酶切实验检测其反式酶切蛋白酶活性。成功获得Nsp2

    • >生态和环境微生物学
    • 中国各地不同枣树品种上枣疯病植原体的PCR检测及分子变异分析

      2009, 49(11):1510-1519.

      摘要 (1876) HTML (0) PDF 1.46 M (3011) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】检测不同地区枣树品种上的枣疯植原体侵染及保守基因序列的变异。【方法】利用植原体16S rDNA的通用引物R16mF2/R16mR1、16S-23S间区序列(SR)的通用引物SR1/SR及secY基因引物FD9f/r,通过PCR检测采自国内7个地区14个枣树品种上的32个枣疯病和4个酸枣丛枝病样品。将PCR产物进行直接或克隆测序,结合已报导的测序数据,进行序列同源性和系统进化分析。【结果】所有枣疯病样品中均检测到植原体;皆属于榆树黄化16S rV-B亚组,与我国重阳木丛枝和樱桃致死黄化遗传关系

    • 一株菊酯类农药降解菌的分离鉴定及其降解酶基因的克隆

      2009, 49(11):1520-1526.

      摘要 (1410) HTML (0) PDF 1.29 M (2245) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】筛选分离高效降解菊酯类农药的光合细菌,研究其降解特性,并对该菌株中降解酶基因进行克隆与初步分析。【方法】根据分离菌株的细胞形态结构、活细胞光吸收特征、生理生化特征及其16S rDNA序列系统发育分析鉴定降解菌,气相色谱法测定该菌株降解菊酯类农药的能力,PCR方法克隆降解酶基因。【结果】菌株PSB07-21属红假单胞菌属(Rhodopseudomonas sp.),其降解最佳条件为3000 lx、35℃、pH 7,在此条件下培养15 d对600 mg/L甲氰菊酯、氯氰菊酯、联苯菊酯降解率分别为

    • >侵染和免疫
    • 大肠杆菌来源的人乳头瘤病毒11型病毒样颗粒的制备及其免疫原性

      2009, 49(11):1527-1533.

      摘要 (2243) HTML (0) PDF 1.38 M (1852) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】 利用大肠杆菌表达系统制备人乳头瘤病毒11型病毒样颗粒(HPV11 VLPs),并对其免疫原性和所诱导中和抗体的型交叉反应性进行研究。 【方法】 在大肠杆菌ER2566中非融合表达HPV11-L1蛋白,并通过离子交换层析,疏水相互作用层析其进行纯化。纯化后的HPV11-L1经体外组装形成病毒样颗粒,通过动态光散射,透射电镜检测其形态,并通过多种HPV型别假病毒中和实验评价HPV11 VLPs的免疫原性及型交叉反应性。 【结果】 HPV11-L1蛋白在大肠杆菌中可以以可溶形式表达。经过硫酸铵沉

    • >技术与方法
    • 酵母表面展示分选酶底物用于分选酶活性检测

      2009, 49(11):1534-1539.

      摘要 (1581) HTML (0) PDF 906.51 K (2863) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】以EGFP标签检测分选酶底物QALPETGEE在毕赤酵母表面的表达,然后将酵母表面展示的底物与分选酶相互作用以检测分选酶活性。【方法】以pcDNA-myc-his-EGFP为模板,通过PCR技术将QALPETGEE-linker-EGFP基因连接到穿梭载体pKFS上,构建QALPETGEE-linker-EGFP酵母表面展示载体后转化至毕赤酵母(Pichia pastoris)GS115中。重组菌经培养,利用荧光显微镜检测重组酵母的荧光强度,然后通过荧光分光光度计检测分选酶与底物相互作用后产

    • >研究简报
    • 藏北地区传统发酵乳中乳杆菌的多样性分析

      2009, 49(11):1540-1547.

      摘要 (1183) HTML (0) PDF 2.40 M (2133) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:【目的】针对藏北地区的乳杆菌来源及种属,对其多态性进行研究。【方法】采用ERIC-PCR技术和NTSYS-pc2.1软件对从藏北地区牧民家庭制作的发酵乳制品中分离出的77株乳杆菌进行多样性分析。【结果】ERIC-PCR扩增出的条带清晰,重复性好,多态性高。聚类分析表明,在0.73的水平上,77株乳杆菌共分为4大类群:干酪乳杆菌群A1、发酵乳杆菌群A2,瑞士乳杆菌群A3和植物乳杆菌群A4。其中,干酪乳杆菌群A1和发酵乳杆菌群A2分别占供试乳杆菌的35.06%和61.04%,为优势菌群。进一步对优势菌群

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