摘要:摘要：土壤重金属污染严重影响了人类健康和生态系统稳定，已成为亟待解决的现实问题。在重金属污染地，氮素的极端不足是植被恢复主要限制因子之一。根瘤菌—豆科植物共生体系是固氮能力最强的生物固氮体系，在促进重金属污染地氮素循化和营养元素积累中具有重要作用。本文阐述土壤重金属污染的修复方法及其特点，微生物抗重金属的机理及促植物生长和重金属积累的特性，根瘤菌—豆科植物共生体系在土壤重金属污染修复中的优越性，研究现状及应用潜力。提出应用“豆科植物—根瘤菌共生体系”修复重金属污染土壤的新思路和新任务。

摘要:摘要：红褐肉座菌（Hypocrea jecorina, 即Trichoderma reesei的有性型）是工业上重要的纤维素酶生产菌株，也是用于研究纤维素酶和半纤维素酶基因转录调控机制的模式菌株。在诱导物存在的条件下，H. jecorina可以迅速启动这些糖苷水解酶基因的转录表达，但不同的诱导物对纤维素酶和半纤维素酶基因的诱导表达模式存在一定差异。目前对不溶性诱导物如结晶纤维素如何诱导这些基因的起始转录问题有三种假设；并且已发现某些参与调控纤维素酶基因转录的正调控因子(Xyr1、Ace2、Hap2/3/5)和负调控因子(Ace1、Cre1)，这些调控因子可在纤维素酶基因启动子上结合且彼此间可能发生相互作用。本文系统综述了红褐肉座菌纤维素酶基因转录表达调控中的关键因素及其相互作用的相关研究进展。

摘要:摘要：二萜类化合物广泛存在于植物和真菌中，是一类具有重要商业价值的天然产物。二萜环化酶作为催化牻牛儿牻牛儿焦磷酸(geranylgeranyl diphosphate，GGPP)形成二萜的关键生物合成酶，在不同生物中的特异性决定了二萜化合物的结构多样性和生物活性多样性。对不同物种中二萜环化酶基因的分离、克隆和表达特征的分析有利于二萜类化合物的生物合成及调控研究。相比植物，真菌二萜化合物和二萜环化酶的研究刚刚起步。本文综述了近几年真菌二萜环化酶的研究进展，重点叙述了真菌二萜化合物的生物合成途径、二萜环化酶的特征及其克隆策略，并对二萜环化酶的代谢工程作了简要概述。

摘要:摘要:志贺氏菌的侵袭能力归功于其具有的特殊武器——III型分泌系统，这方面的研究一直以来都是病原微生物领域关注的焦点，本文将对近年来志贺氏菌III型分泌系统的研究进展进行简要综述。

摘要:摘要：【目的】研究湖南小溪国家级自然保护区普通非盐环境（ordinary non-saline environment）土壤样品中可培养嗜盐及耐盐细菌（含放线菌）多样性。【方法】采用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对样品中嗜盐及耐盐细菌多样性进行研究。【结果】用补充5%–20%（w/v）NaCl的MA、ISP 2、ISP 5、NA和HAA培养基从土壤样品中分离到114株细菌，其中8株为中度嗜盐菌，19株为轻度嗜盐菌，87株为耐盐菌。根据形态观察和部分生理生化实验结果去冗余，选取61个代表性菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育多样性分析。结果表明，这些菌株属于细菌域（Bacteria）的3个大的系统发育类群（门；phylum）（Actinobacteria，Firmicutes，Proteobacteria）的16个科、18个属，代表了41个物种。多数菌株属于Firmicutes门（38株，62.3%）和Actinobacteria门（18株，29.5%）。大多数菌株与其系统发育关系最密切的已知物种的典型菌株之间存在一定的遗传差异（16S rRNA基因序列相似性为96.9%–99.8%），其中有7个菌株（JSM 070026, JSM 081004, JSM 081006, JSM 081008, JSM 083058, JSM 083085, JSM 084035）代表7个潜在新种（potential novel species）。【结论】研究结果表明，湖南小溪国家级自然保护区普通非盐环境土壤中存在较为丰富的可培养嗜盐及耐盐细菌多样性，并且潜藏着较多新的微生物类群（物种）。

摘要:摘要：【目的】研究我国首次临床分离的一株格特隐球菌VGII基因型菌株（XH91）的分子和表型特征。【方法】对受试株XH91进行血清型的分子鉴定；选取核基因组和线粒体基因组中共16个基因片段进行多位点序列分型；对受试株进行单倍体繁育、同性交配及异性交配能力评价；观察受试株的黑色素生成、荚膜厚度及37℃生长等表型特征。【结果】我国首株格特隐球菌VGII基因型菌株XH91为血清B型；该菌株在多位点序列分型上与温哥华岛致病基因型VGIIb一致；XH91能与a交配型发生交配，产生担孢子，而不能与α交配型发生交配且不具备单倍体繁育能力；XH91的黑色素生成、荚膜厚度及37℃生长等表型特征与参考株无明显差异。【结论】我国首株格特隐球菌VGII基因型菌株XH91在基因型、表型特征上均与温哥华岛VGIIb基因亚型一致，该结果将为我国格特隐球菌VGII基因型的分子流行病学和疾病监控提供重要资料。

摘要:摘要：【目的】研究黄土高原地区大豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育。【方法】采用BOX-PCR、16S rDNA PCR-RFLP、16S-23S IGS PCR-RFLP和16S rRNA基因序列分析方法对分离自我国黄土高原地区4个省的15个地区的130株大豆根瘤菌及部分参比菌株进行了遗传多样性和系统发育分析。【结果】BOX-PCR反映的菌株多样性最丰富，形成的遗传群最多，16S rDNA PCR-RFLP 方法在属、种水平上聚群较好，16S-23S IGS PCR RFLP反映的多样性介于BOX-PCR和16S rDNA PCR-RFLP之间，能够较好地反映出属、种和亲缘关系很近的菌株间的差异，3种方法聚类分析结果基本一致，可将所有供试菌株分为两大类群，中华根瘤菌属（Sinorhizobium）和慢生根瘤菌属（Bradyrhizobium）。从系统发育来看，供试的快生大豆根瘤菌为费氏中华根瘤菌（Sinorhizobium fredii），慢生大豆根瘤菌为日本慢生大豆根瘤菌（Bradyrhizobium japonicum）和辽宁慢生根瘤菌（Bradyrhizobium liaoningense）。 【结论】我国黄土高原地区大豆根瘤菌具有较丰富的遗传多样性，S. fredii优势种，慢生大豆根瘤菌仅占10%，同时，分离到2株B. liaoningense。

摘要:摘要：【目的】转酮酶是非氧化磷酸戊糖途径中的关键酶。从北京棒杆菌(Corynebacterium pekinense PD-67)中克隆转酮酶 (transketolase，EC 2.2.1.1，TK) 基因，并将转酮酶基因在C. pekinense PD-67中进行表达，研究增加转酮酶活性对C. pekinense PD-67生理特性的影响。【方法】分别以C. pekinense野生株AS1.299和突变株PD-67的基因组为模板，用PCR方法扩增tkt的全基因序列和前端控制序列；通过pAK6载体提高tkt基因在C. pekinense PD-67中的拷贝数，从而提高C. pekinense PD-67中转酮酶的活性。【结果】tkt基因核苷酸序列及其编码的氨基酸序列与结构分析结果表明，C. pekinense突变株PD-67与野生株AS1.299相比较，二者调控序列及结构基因核苷酸序列完全一致。与谷氨酸棒杆菌ATCC 13032相比较，突变株PD-67的氨基酸序列有5个氨基酸差异，其中4个位于与辅因子硫胺素焦磷酸结合的结构域内。突变株PD-67来源的tkt基因在北京棒杆菌PD-67中得到了表达，重组菌转酮酶比活力比对照菌株提高了2倍。C. pekinense PD-67（pTK3）与对照菌株PD-67( pAK6)相比，生长加快，L-色氨酸的最终积累量也较高。【结论】本工作从C. pekinense 1.299和PD-67中克隆到tkt基因，并实现tkt基因的同源表达。适当提高菌株转酮酶活力，有助于菌体生长和色氨酸积累。

摘要:摘要：【目的】通过定点突变技术改变乳链菌肽（nisin）特定位置氨基酸，获得性质改善的nisin突变体，为扩大其应用范围提供依据。【方法】在抑菌谱扩大的nisin单突变体M21K nisinZ的基础上，对M21K nisZ基因第29位丝氨酸密码子进行定点突变；将其克隆至乳酸菌表达载体pMG36e，并在Lactococcus lactis NZ9800中进行表达；双突变体M21K/S29K nisinZ经分离纯化后检测其在抑菌活性、抑菌谱和稳定性等方面的变化。【结果】与单突变体M21K nisinZ及野生型nisinZ（wild-type，WT）相比，双突变体M21K/S29K nisinZ对指示菌的抑菌活性虽有所下降，但其对温度及pH值的稳定性有显著提高。同时其抑菌谱与M21K nisinZ相同，可抑制革兰氏阴性菌，扩大了WT的抑菌谱。【结论】通过改变nisin分子特定位置的氨基酸可以改善nisin分子的理化性质，有可能得到应用范围更广的nisin品种。

摘要:摘要：【目的】聚羟基脂肪酸酯（polyhydroxyalkanoates, PHAs）是一种生物可降解的天然高分子聚酯，本研究的目的是从广东省某啤酒厂废弃的活性污泥中分离筛选PHAs产生菌。【方法】首先，从活性污泥中分离PHAs产生菌。分离方法分3步：（1）富集培养PHAs产生菌；（2）通过苏丹黑B染色法进行初筛；（3）挑选PHAs产量较高的菌株，然后对细胞内提取产物进行分析，最后通过生理生化试验和16S rRNA基因序列分析法对该菌株进行鉴定。【结果】从广东省某啤酒厂的活性污泥样品中筛选获得PHAs产生菌HG-B-1，被鉴定为嗜麦芽寡养单胞菌（Stenotrophomonas maltophlia）。细胞染色分析、胞内提取物的红外光谱分析表明HG-B-1胞内贮藏物为PHAs。该菌株在以蔗糖为碳源、牛肉膏为氮源的发酵培养基中，37℃振荡培养24 h，PHAs产量可达细胞干重的23.4 ％。【结论】本文从广东省某啤酒厂的活性污泥中筛选得到PHAs产生菌，获得了一株新型的PHAs产生菌，为进一步研究和开发新型的PHAs产生菌提供了菌源和基础资料。

摘要:摘要:[目的] 通过磷脂酰胆碱(PC)阳性大肠杆菌菌株与磷脂酰乙醇胺(PE)阳性野生型和PE阴性突变型菌株比较，并用PC+PE+双阳性菌株佐证，从细菌形态、生理生化以及巨噬细胞对细菌的吞噬作用等方面探讨活体内磷脂酰胆碱能否替代磷脂酰乙醇胺。[方法] 光学和电子显微镜观察细菌形态和结构；不同条件培养细菌并使用分光光度计测定OD600值，评估细菌的生长情况；使用SDS-PAGE和2-D电泳法测定细菌间质蛋白组分；用小鼠RAW264.7 巨噬细胞系检测细菌的粘附和吞噬作用。[结果]与短棒状的PE+野生型细菌AD93/pDD72相比，PC+细菌AD93/ptac67中仍有25%丝状体；与PE-突变体AD93一样，PC+细菌AD93/ptac67仍需要添加二价离子Mg2+或Ca2+才能生长；与野生型AD93/pDD72相比，PC+细菌AD93/ptac67的周质蛋白组分、粘附率与相对吞噬效率呈现明显的差异；与野生型细菌Top10/ptac85相比，PE+PC+双阳性细菌Top10/ptac66的细胞壁外层、抗逆性和周质蛋白组分也显示差别。[结论]在活体内，膜磷脂中PC替代PE不能使PE-突变体细胞的功能完全恢复至野生型状态，PE和PC在功能上存在明显的差别，两者在功能上不能相互替代。

摘要:摘要：【目的】具有1-氨基环丙烷-1-羧酸（ACC）脱氨酶活性的盐生植物碱蓬内生细菌的分离及生物学特性的研究有助于探索内生细菌与宿主植物耐盐性的关系。【方法】采用研磨法从健康碱蓬植株的根、茎、叶中分离具有ACC脱氨酶活性的碱蓬内生细菌，根据形态特征、生理生化、API鉴定系统和16S rRNA对菌种进行鉴定，并分别测定了菌株产ACC脱氨酶、铁载体、吲哚乙酸、赤霉素、脱落酸、蛋白酶及溶磷、固氮和拮抗病原菌的特性。【结果】将分离得到的内生细菌LP11、 SS12、 TW1和TW2分别鉴定为栖稻假单胞菌（Pseudomonas oryzihabitans）、假单胞菌（Pseudomonas sp.）、成团泛菌（Pantoea agglomerans）和恶臭假单胞菌（Pseudomonas putida），4株菌除具有较高的ACC脱氨酶活力之外，还可不同程度地产生铁载体、吲哚乙酸、赤霉素和脱落酸，且均有溶磷作用，但无固氮能力及蛋白酶活力，唯有菌株SS12对萝卜枯萎病菌（Fusarium oxysporum f. sp. conglutinans）和黄瓜枯萎病菌（F. oxysporum f. sp. cucumerinum）具有拮抗作用。【结论】从盐生植物碱蓬中分离到的假单胞菌属和泛菌属内生细菌，具有丰富多样的生物学特性。

摘要:【目的】通过分析富含高分子有机物的云南洱源牛街热泉原核微生物16S rRNA基因克隆文库，丰富对高温热泉原核微生物多样性的认识，为进一步开发和利用该热泉微生物资源奠定基础。【方法】构建洱源牛街高温热泉原核微生物16S rRNA基因克隆文库，通过测序和相似性比对以及聚类分析研究该热泉原核微生物的多样性。【结果】该热泉原核微生物以细菌为主,包括变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、梭杆菌门（Fusobacteria）等在内的约10个细菌类群，其中变形菌门（Proteobacteria）中的β-变形菌纲（β- Proteobacteria）为优势菌群，其次为拟杆菌门（Bacteroidetes）、绿菌门（Chlorobi）；古菌的生物量和丰度较细菌少，归属广古菌（Euryarchaeota）和泉古菌（Crenarchaeota）两个类群，以广古菌为优势菌群。

摘要:摘要：【目的】为了了解再生水灌溉对草坪根际可培养细菌群落组成的影响，【方法】采用稀释平板法，对北京市陶然亭公园内再生水灌区及其对照自来水灌区草坪根际细菌进行了分离，并对其16S rDNA序列进行了分析。【结果】16S rDNA序列分析表明自来水样品分离得到的菌落分属于15个属的20个种，而再生水样品分离得到的菌落分属于18个属的24个种。自来水和再生水灌区草坪根际细菌主要包括变形菌门α亚群（Alphaproteobacteria，分别为9.7%和13.4%）、变形菌门β亚群（Betaproteobacteria，分别为8.1%和12.3%）、变形菌门 γ 亚群（Gammaproteobacteria，分别为17.9%和42.0%）、拟杆菌门（Bacteroidetes，分别为13.0%和2.9%）、厚壁菌门（Firmicutes，分别为23.6%和10.1%）和放线菌门（Actinobacteria，分别为27.6%和19.6%）其中，芽孢杆菌属（Bacillus sp.）是自来水灌区草坪根际优势菌属（23.6%），而不动杆菌属（Acinetobacter sp.）是再生水灌区根际优势菌属（17.4%）。从不同类群优势菌属看，除变形菌门 γ 亚群受再生水影响优势菌属在两灌区表现出一定的差异外， 其余各亚群优势菌属均未受再生水影响，其中，不动杆菌属是再生水灌区变形菌门 γ 亚群的优势菌属（41.3%），肠杆菌属（Enterobacter sp.）是自来水灌区变形菌门 γ 亚群的优势菌属（45.4%）。【结论】这表明，再生水灌溉未改变细菌群落组成类型，但改变了不同类型多度分布状况。具体表现为优势种多度值增加及部分非优势种有无。再生水灌区特有机会性致病菌、植物致病菌和重金属耐性细菌的出现表明再生水灌溉中病原微生物及重金属的控制工作还有待于进一步严格。

摘要:摘要：【目的】从高温油藏中发掘新的微生物种质资源。【方法】采用 Hungate 厌氧操作技术从大港油田采出水中分离到一株厌氧杆菌 HL-3。通过生理生化特征比较和16S rRNA序列比对，确定HL-3的分类地位。【结果】菌株HL-3为严格厌氧的革兰氏阴性杆菌。生长温度范围 40℃－75℃（最适温度 60℃）；pH 范围 5.0－8.0（最适 pH 6.5）；NaCl 浓度范围 0%－3.2%（最适NaCl浓度0.25%）。能够利用葡萄糖、核糖、甘露糖、木糖、纤维二糖等多种碳水化合物，发酵葡萄糖的产物是乙醇、乙酸、CO2及少量丙酸和丁醇。菌株HL-3的（G+C）mol%含量为 33.9%，与Thermoanaerobacter（嗜热厌氧杆菌属）中模式菌株T.uzonensis DSM18761T (EF530067)的16SrRNA 序列相似性为98.8%，与T.sulfurigignens DSM17917T (AF234164)的相似度次之为98.1％。菌株能够耐受浓度较高的亚硫酸根（0.1 mol/L）离子和浓度极高的硫代硫酸根（0.8 mol/L）。当硫代硫酸根浓度高于0.075 mol/L时，菌体内产生硫单质颗粒；同时，在培养血清瓶顶空中检测到硫化氢气体。菌株 HL-3与T.uzonensis DSM18761T对硫代硫酸根和亚硫酸根的耐受程度有很大不同。菌株HL-3对硫代硫酸根和亚硫酸根耐受程度及对硫代硫酸根的代谢机制与T.sulfurigignens DSM17917T(AF234164)极为相似，但二者代谢葡萄糖的产物却极不相同。【结论】所以菌株HL-3可能是Thermoanaerobacter属中的一个新种，其确切分类地位还有待用DNA分子杂交[1]的技术手段做进一步的鉴定。

摘要:摘要：【目的】探讨聚合酶链反应-酶切分型在快速鉴定环境水源军团菌方面的应用价值，并了解广州地区环境水源军团菌的分布状况。【方法】对广州地区采集的44份环境水样，作军团菌分离培养，再对分离菌株进行16S rDNA PCR-酶切分型鉴定、16S rDNA基因测序和mip基因测序鉴定。【结果】在广州地区环境水源分离的112株军团菌，经聚合酶链反应-酶切分型鉴定、16S rDNA基因测序和mip基因测序鉴定，检出嗜肺军团菌66株，非嗜肺军团菌46株，其中菲氏军团菌20株，戈氏军团菌17株，橡树岭军团菌7株，长滩军团菌2株。【结论】聚合酶链反应-酶切分型检测环境水源军团菌是一种简便、快速、特异的鉴定方法；在广州地区环境水源中普遍存在军团菌，主要是嗜肺军团菌，其次是菲氏军团菌，戈氏军团菌，橡树岭军团菌和长滩军团菌。

摘要:摘要: 【目的】肠炎型沙门菌是一种食源性人畜共患病病原菌，可在禽蛋中存活并传播。sRNA为新近发现的基因表达调控分子，本实验以sRNA（sraB）为对象，探索sRNA与肠炎型沙门菌在禽蛋中存活的相关性，及研究其在细菌抵抗蛋清抑菌作用中的调控功能。【方法】参考已报道的沙门菌全基因组及sraB序列，设计并扩增sraB突变用基因片段，运用Red重组系统（red recombination system）对肠炎沙门菌野生株（SE2472）sraB基因进行定点敲除，构建出sraB敲除株（SE2472△sraB）。分析比较sraB敲除对沙门菌在蛋清中存活的影响；另构建表达sraB的回复表达质粒pHDB3-sraB，将其转入sraB敲除株构建回复株SE2472△sraB-comp，以回复表达sraB，分析sraB表达对沙门菌敲除株的回复作用；并分别以野生株、敲除株及回复株研究sraB在抵抗蛋清中几种抑菌因子（如溶菌酶和卵转铁蛋白）作用中可能的调控作用。【结果】敲除株在蛋清中存活率为野生型的61%－70%，回复株相比野生型的存活率比敲除株提高10%－33%；在转铁蛋白抑菌实验中，孵育8 h和24 h，敲除株的存活率分别为野生型存活率的 38%和23%，孵育8 h回复株相比野生型的存活率比敲除株提高15%，但孵育24 h回复株的存活率未见提高；在溶菌酶抑菌实验中，孵育8 h和24 h后，敲除株存活率分别为野生型的41%和27%，回复株相比野生型的存活率分别比敲除株提高35%和23%。【结论】通过比较sraB敲除与否，研究肠炎型沙门菌在禽蛋中的存活及对抑菌因子的抵抗作用，结果表明sraB在肠炎沙门菌抵抗蛋清抑菌作用中起着重要调控功能。

摘要:摘要：【目的】从鸡白痢沙门菌C79-13中克隆ipaJ基因，体外表达该蛋白后进行免疫原性分析。【方法】鸡白痢沙门菌C79-13与肠炎沙门菌50041进行抑制差减杂交后获得的片段PEA2、PE31和PE44与猪霍乱沙门菌C500疫苗株pSFD10质粒上ipaJ基因高度同源，拼接后获得了鸡白痢沙门菌完整的ipaJ基因序列。从鸡白痢沙门菌中克隆出ipaJ基因并将其构建到原核表达载体pET-30a(+)上，Western-blot检测体外表达蛋白的免疫原性，同时检测了该基因在鸡白痢沙门菌分离株中的分布。【结果】从鸡白痢沙门菌中克隆了大小为840 bp的ipaJ基因序列，并获得了体外原核表达的大小为37 kDa融合蛋白。该蛋白可与鸡白痢沙门菌阳性血清反应。PCR结果显示该基因广泛存在于鸡白痢沙门菌菌株中。 【结论】本文首次报道和克隆了鸡白痢沙门菌ipaJ基因，并证明了IpaJ蛋白具有免疫原性。

摘要:摘要：【目的】研究群体信号应答蛋白编码基因nprR在苏云金芽胞杆菌（Bacillus thuringiensis，Bt）HD-73菌株晶体蛋白形成过程中的作用。【方法】通过同源重组，构建了HD-73 nprR基因缺失突变菌株HD73（ΔnprR ）。利用启动子-lacZ融合、SDS-PAGE方法，测定不同培养基中nprR基因转录活性及nprR基因缺失对cry1Ac转录及表达的影响。【结果】启动子转录活性分析表明，在LB和SSM培养基中nprR基因从对数期结束（T0）开始表达，稳定期持续表达。在LB培养基中，nprR基因的缺失使cry1Ac基因在生长过渡期和稳定期前期转录活性显著提高，同时HD73（ΔnprR ）菌株Cry蛋白生成量也明显高于出发菌株HD-73，但是在芽胞形成释放后，Cry蛋白的表达没有明显的区别。【结论】在丰富培养基中苏云金芽胞杆菌nprR基因的缺失在生长过渡期和稳定期前期能够提高cry1Ac基因转录和表达，从而缩短了cry基因表达时间，并且Cry蛋白总产量与出发菌株相当。

摘要:摘要：【目的】阿维链霉菌可作为异源表达抗生素生物合成基因簇的良好宿主，但是需要优化含有大片段DNA质粒的接合转移效率。【方法】我们选取MgCl2、NaCl、Ca(NO3)2 和CaCl2等4种无机盐，在0－200 mmol/L浓度范围内分别研究其对大质粒向阿维链霉菌接合转移的影响，再设计完全随机试验筛选最佳条件。【结果】CaCl2对阿维链霉菌接合转移有极明显的促进作用，MgCl2也有一定提高作用。通过完全随机试验筛选出最佳的CaCl2和MgCl2浓度组合，使大质粒的接合转移效率提高11倍。同时，本研究还发现阿维链霉菌异源表达放线紫红素的最适培养基，成功表达放线紫红素。【结论】特定无机盐对阿维链霉菌接合转移效率有明显提高作用，并且能促进放线紫红素在阿维链霉菌中的表达。