摘要:[目的] 肠道是动物的主要消化器官，同时也是机体抵抗外源病原菌的重要屏障，已有研究表明，动物的品种、饲养方式、生长阶段均会影响动物的肠道菌群结构，但对舍饲和放牧饲养条件下藏猪的肠道菌群结构，以及藏猪和长白、约克与杜洛克三元杂交猪（DLY猪）的肠道菌群结构是否有差异，尚未见报道。[方法] 本研究选取6-7月龄的放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪的小肠组织，分别采用组织切片法测定各试验猪的肠道形态、酶活性测定试剂盒测定肠道内容物的消化酶活性，高通量测序法测定肠道微生物。[结果] DLY猪小肠的肌层厚度和绒毛高度高于藏猪，而隐窝深度低于藏猪；舍饲藏猪和放牧藏猪的小肠形态没有显著变化。DLY猪小肠的胰蛋白酶活性高于藏猪，而淀粉酶活性低于藏猪。三组猪小肠微生物的优势菌门均为Proteobacteria、Firmicutes和Bacteroidetes；藏猪的优势菌属为Ralstonia和Escherichia，而DLY猪的优势菌属为Ralstonia和Bradyrhizobium，但含量却存在显著性差异。舍饲藏猪与放牧藏猪肠道菌群结构相似度较高，而藏猪与DLY猪肠道菌群结构相似度较低。[结论] 放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪的小肠形态、消化酶活性和肠道菌群结构均存在显著性差异。

摘要:【目的】为探究饲养方式对藏猪结肠消化酶活性、菌群结构和短链脂肪酸含量的影响。【方法】研究分别选取5头相同月龄的放养藏猪和舍饲藏猪。屠宰采集结肠粪便样品，分别利用酶联免疫吸附法(enzyme linked immunosorbent assay, ELISA)试剂盒、高通量测序技术和气相色谱仪测定放养藏猪和舍饲藏猪结肠消化酶活性、菌群结构和短链脂肪酸含量。【结果】同一月龄下，放养藏猪的日增重显著低于舍饲藏猪(P<0.05)。放养藏猪结肠中纤维素酶和半纤维素酶的活性均显著高于舍饲藏猪(P<0.05)；2种饲养方式藏猪结肠的6种α多样性指数均无显著差异(P>0.05)，且主成分分析(principal component analysis, PCA)得到放养藏猪和舍饲藏猪结肠菌群存在一定的相似性。在门和科分类水平上，相较于舍饲藏猪，放养藏猪结肠中疣微菌门、黄杆菌科、月形单胞菌科、浮霉状菌科和伊格尔兹氏菌科的相对丰度显著升高，而链球菌科、韦荣氏球菌科、假单胞菌科、红环菌科、红螺菌科、乳杆菌科、理研菌科和巴斯德氏菌科的相对丰度显著降低(P<0.05)；在属和种分类水平上，共有7个菌属和4个菌种在两种饲养方式藏猪结肠中存在显著差异，依次为密螺旋菌属、瘤胃球菌属、伊格尔兹氏菌属、巨球型菌属、另枝菌属、假单胞菌属、链球菌属、普拉梭菌、埃氏巨球形菌、罗伊氏乳杆菌和普氏菌。短链脂肪酸研究表明，放养藏猪结肠中乙酸的含量显著高于舍饲藏猪(P<0.05)。【结论】在本试验条件下，饲养方式对藏猪结肠纤维素酶和半纤维素酶活性、菌群结构及乙酸含量均有影响。与舍饲藏猪相比，放养藏猪生长性能较差，但其对纤维素的降解能力更强。

摘要:【目的】研究饲养在西藏高原的放牧藏猪、舍饲藏猪和商品猪（杜长大猪，DLY猪）粪便中真菌群落组成的差异性，获取与饲粮粗纤维消化相关的真菌群落。【方法】以饲养在西藏高原的5月龄放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪为研究对象，采用消化试验测定放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪对饲粮粗纤维的表观消化率。采集粪便样品利用单分子实时测序技术（SMRT），测定粪便真菌ITS基因全长序列，分析粪便真菌群落的结构和多样性，采用Pearson相关分析获取饲粮粗纤维表观消化率与真菌群落的相关性。【结果】在放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪的粪便样品中共鉴定出了4个门、13个纲、23个目、39个科、55个属、58个种，放牧藏猪在各分类水平的分类单元数均显著高于舍饲藏猪与DLY猪（P<0.05）。子囊菌门（Ascomycota）和担子菌门（Basidiomycota）是优势菌门，在门水平下，放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪间无显著差异（P ≥ 0.05），但在纲、目、科、属、种水平下，放牧藏猪多个真菌类群相对丰度显著高于舍饲藏猪与DLY猪（P<0.05）。放牧藏猪具有更高的菌群丰富度和独有分类操作单元（OTU）（P<0.05），通过主坐标分析发现放牧藏猪粪便真菌群落与舍饲藏猪和DLY猪之间差距明显。放牧藏猪对饲粮粗纤维的表观消化率显著高于舍饲藏猪与DLY猪（P<0.05），Pearson相关性分析表明，Phialemonium atrogriseum、Phialemonium inflatum、Podospora communis与饲粮粗纤维表观消化率呈显著正相关（P<0.05）。【结论】放牧藏猪具有较强的纤维消化能力，可以从其肠道内鉴定出更丰富的真菌类群并进行深入开发，有利于进一步研究藏猪耐粗饲等优良特性。