摘要:高通量测序技术已经增加了人们对肠道微生物组和表观遗传学修饰的理解，将肠道微生物组和宿主表观遗传学修饰紧密联系起来，阐明了很多疾病的发生过程如免疫、代谢、心血管疾病甚至是癌症。肠道微生物组与宿主具有相互作用，与人体密不可分，相辅相成。肠道微生物组的生态失调可能诱导疾病的发生并能调控宿主表观遗传学修饰。宿主表观遗传学调控和肠道微生物组（或其代谢产物）变化的相互关系在很多疾病中都有报道。因此，肠道微生物组可作为某些疾病的诊断标记，健康肠道微生物组的移植会逆转这种微生态失调，可作为一种有效的治疗策略。本文主要探讨了肠道微生物组直接调控宿主表观修饰和通过小分子生物活性物质和其他酶辅因子间接影响表观修饰，以及基于肠道微生物组调控宿主表观修饰的诊断和治疗应用等。

摘要:为了适应复杂多变的生存环境，微生物通常需要在保证基因组序列不变的前提下不断调整胞内代谢网络。表观调控可以在不改变DNA序列的情况下对基因表达进行调控，因此成为细菌中重要的调控方式。作为一种DNA修饰，DNA甲基化修饰是生物体中最常见的表观调控工具。在本文中我们全面、深入解析了两种孤儿甲基转移酶：DNA腺嘌呤甲基转移酶（DNA adenine methyltransferase，Dam）和细胞周期调控甲基转移酶（Cell cycle-regulated methyltransferase，CcrM）在原核生物中的表观调控功能。我们主要探讨了DNA甲基化参与的细胞生理过程包括DNA复制起始、DNA错配修复、基因表达调控、致病性和相变异等方面。同时，我们结合三维基因组研究技术基因组结构捕获（Chromosome conformationcapture，3C）技术和新型DNA磷硫酰化修饰讨论了该领域的发展前景。