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    • 土生空团菌(Cenococcum geophilum Fr.)18S rDNA中的I型内含子

      2012, 52(9):1059-1068.

      关键词:关键词:土生空团菌,I型内含子,二级结构,遗传多样性
      摘要 (1230)HTML (0)PDF 1.88 M (2220)收藏

      摘要:摘要:【目的】分析土生空团菌[Cenococcum geophilum Fr. (Cg)]18S rDNA 中I 型内含子的核苷酸序列和二级结构特征,探讨影响土生空团菌遗传多样性的因素。【方法】对23个Cg菌株18S rDNA的3端进行PCR扩增,对其中14个菌株的扩增片段测序。利用MAGE version 4.0软件构建Neighbor-Joining系统发育树,利用Mfold 预测内含子的二级结构。【结果】序列分析表明,19个中国菌株中14个在18S rDNA中有I型内含子。结合GenBank中的相关数据,可知Cg菌株18S rDNA中内含子的序列长度为488-590nt,显示出92.3%-100%的同源性。在其5端序列比较保守,在3端序列差异较大。二级结构分析表明Cg菌株18S rDNA 中的内含子都有10个配对区(P1-P10),在P5区域由P5,P5a,P5b,P5c,P5d组成,在P9的3端有2个配对区(P9.1、P9.2)。【结论】来源于不同寄主及地域的Cg菌株有丰富的遗传多样性,本文没发现地理因素和寄主来源对Cg的遗传分化有影响。

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