《微生物学报》创刊于1953年，是由中国科学院主管，中国科学院微生物研究所和中国微生物学会主办的综合性学术刊物。

办刊宗旨：创造性的学术研究为主，为中国的社会经济发展和文化建设服务

收录数据库：北大中文核心期刊、中国科技核心期刊、CSCD核心期刊、科学引文数据库(SCD)，中国科技论文统计源期刊(CSTPCD)、中国知网(CNKI)、荷兰Scopus、荷兰EMBASE、美国化学文摘(CA)、美国生物学文摘(BA)、英国剑桥文摘(Cambridge Abstract)、俄罗斯文摘(AJ)、波兰哥白尼索引(IC)

报道内容：普通微生物学，工业、农业、医学、兽医微生物学，病毒学，免疫学以及与微生物学有关的生物工程等等方面的研究成果。应用机理的研究涉及到农业、食品、医药、化工轻工和能源环保等领域。

栏目设置：主要栏目包括研究报告、数据论文、技术与方法、综述和专论等。

1. 研究报告：结果完整，具有创新性。一般包括研究背景、研究方法、结果与讨论、结论等几个部分。

2. 数据论文：数据论文是指原创的、具有较高学术价值、可供微生物学同行共享和重复使用的数据或数据集。文章格式与研究论文基本相同，只是以数据为研究核心，在研究方法部分要求介绍更详细，包括数据获得方法，数据描述（如数据内容、使用软件、文件格式等），数据验证和评估，数据使用方法和建议。数据集（库）应以微生物及相关学科的数据资料（库）为主要内容，呈现一个或一组完整的数据（库），说明其对微生物学研究的意义，可以不包含结果与讨论部分。较大数据集或者论文关联数据建议提交至科学数据存储与发布平台ScienceDB（www.scidb.cn）。文章发表后相关数据将同步出版，并有独立的数据DOI或URL等访问链接。

3. 技术与方法：与微生物相关的新技术和新方法、对研究方法和实验技术的重要改进或者新的应用、国际前沿重大技术的最新介绍等。

4. 综述：选题要有新意，有一定的启发作用和参考价值。结合自己的研究工作，就该研究领域存在的问题和解决的途径提出自己的观点。作者不多于5人，并提供一份背景材料，主要介绍针对综述内容本课题组开展的工作。

5. 专论：全面介绍和论述微生物研究专题；系统阐述微生物学相关研究方向的发展历程以及最新的理论、观点等。

期刊变化：