摘要:

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摘要:为了探讨素食对肠道微环境的影响及其在维护机体健康中的作用，本文通过文献回顾分析了素食对肠道菌群多样性、潜在有益或有害菌属以及菌群代谢产物的影响。结果发现，素食能够调节肠道微环境，其中纯素、1–2周的短期素食以及某些疾病患者的素食影响更大。而对于肠道特定菌及代谢物，仅有益的普雷沃氏菌(Prevotella spp.)在素食者中显著高于杂食者，其余由于肠道菌群具有一定的个体差异均尚无定论，仍需进一步研究。

摘要:人类疱疹病毒8型(human herpesvirus 8, HHV-8)又称卡波西肉瘤相关疱疹病毒(Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus, KSHV)，是一种人类γ-2型疱疹病毒。在不同种族和地区人群感染率差异较大。当HHV-8感染免疫功能正常人群时，病毒复制受限、HHV-8-DNA拷贝数较低、仅表达少量潜伏期蛋白，不易被机体免疫监察系统察觉，从而发展为终身潜伏感染。而当HHV-8感染免疫功能紊乱或免疫功能缺陷人群时，可发展为卡波西肉瘤(Kaposi’s sarcoma, KS)、多中心性卡斯特莱曼病(multicenter Castleman’s disease, MCD)、原发性渗出性淋巴瘤(primary effusion lymphoma, PEL)，以及最近报道的KSHV炎性细胞因子综合征(KSHV inflammatory cytokine syndrome, KICS)，其死亡率高达60%。HHV-8主要通过干扰机体固有免疫和适应性免疫信号通路和表达病毒微小核糖核酸(microRNA, miRNA)等途径破坏机体免疫应答，导致其在宿主细胞内终身潜伏甚至发展为恶性肿瘤。本综述旨在探讨HHV-8的免疫逃逸机制，为HHV-8相关恶性肿瘤的免疫治疗及生物标志物提供思路。

摘要:宿主是微生物栖息地，在宿主的皮肤、口腔、呼吸系统等处生存着多种微生物群体。在共生生物中，发现了一类“通常无害，但在特定的遗传或环境条件下可能会致病的共生体”，国际上引入新术语称为“pathobiont”。然而，目前该类微生物的中文名词尚未统一确定。本文对该词构成和相关研究分析后将pathobiont定义为“病理共生菌”，并总结其在宿主菌群失调、病原体感染及营养失调等多种条件下的致病性及诱发的多重病理效应，为宿主微生物生态失衡机制的研究提供了新思路。

摘要:遗传性球形红细胞增多症(hereditary spherocytosis, HS)是一种遗传性溶血性疾病，在全球范围内较为常见，临床上常表现为贫血、黄疸、脾大等。HS的诊断和治疗在近些年取得了显著进展，胆石症是其最为常见的并发症，严重影响患者身体健康。已有研究发现，HS合并胆汁淤积的患者存在胆汁酸代谢失衡的现象，并且胆汁酸代谢失衡又影响肠道菌群的组成和丰度。本研究就胆汁酸代谢调节肠道菌群在HS合并胆汁淤积中的作用机制进行综述，为HS合并胆汁淤积提供了治疗新策略。

摘要:黑木耳是我国重要的食药用真菌，其富含的多糖物质具有显著的生物活性。本文综述了黑木耳多糖提取与纯化技术，重点关注提升多糖纯度和生物活性的新型方法。同时，深入探讨了多糖结构的精细解析技术及其复杂结构与生物活性之间的关联性，为多糖功能机制的深入理解提供了新视角。此外，本文还分析了黑木耳多糖抗氧化、免疫调节、抗肿瘤等生物活性研究进展，提出了基于多糖特性的新应用策略。最后，本文不仅指出了当前研究中的空白与挑战，更提出了未来值得重视的研究方向，包括多糖改性、纳米技术应用及多糖与其他生物活性物质(膳食纤维、蛋白质和维生素等)的协同作用等，为黑木耳多糖在大健康产业中的开发与利用提供了一定的理论参考。

摘要:效应-免疫蛋白对(effector-immunity pairs, E-I pairs)在细菌的种间竞争中发挥重要作用，随着人们研究的不断深入和基因组数据的大量涌现，新鉴定的E-I pairs的数量正在快速增长，其多样性化的作用机制也不断地被报道。鉴于此，本文基于不同的细菌分泌系统，对E-I pairs所介导的细菌接触依赖型拮抗作用的最新研究进展进行综述，系统总结了接触依赖性生长抑制(contact-dependent growth inhibition, CDI)系统、VI型分泌系统(type VI secretion system, T6SS)和VII型分泌系统(type VII secretion system, T7SS)中的E-I pairs，简要介绍了未来该领域面临的挑战，旨在为进一步揭示E-I pairs细菌种间竞争中的作用研究提供新思路。

摘要:细菌的快速检测一直是食品卫生、环境安全和临床检验等研究领域关注的重点和热点。传统的细菌检测方法面临着操作步骤烦琐、灵敏度低、耗时长、样品/试剂消耗大、对检测条件和实验人员的要求较高等缺点，已难以满足当前快速检测的需求。近年来，随着微流控技术的突飞猛进，基于液滴微流控分析的检测方法也越发引人注目。该方法实质是一种高通量检测筛选技术，其利用微流控系统生成的大小均一、相互独立的微体积液滴，之后对这些液滴进行操控并进行针对性的检测与分析，具有灵敏度高、耗时短、样本/试剂消耗量少、污染小等优点，逐渐被用于生物、医药、化学、环境等多个领域，为实现细菌的快速检测提供了较大可能性。本文先从细菌的代谢增殖、核酸扩增和单细胞分析3个角度介绍了基于液滴微流控分析的细菌快速检测的常用原理，之后按照液滴检测的维度(一维、二维、三维)简述了常见的检测方式，最后结合作者们自身的研究内容，对该领域的新技术与潜在应用前景进行了展望，为该领域的同行提供了一个有价值的参考。

摘要:细菌趋化性是指利用自身的运动能力对环境中化学物质浓度梯度产生响应，使其由随机运动转变为具有偏向性的运动，是细菌适应环境的一种基本属性。了解细菌趋化性及其与环境和微生物体系的相互作用机制，对于阐明它们在调节微生物群落结构、降解污染物和参与生态圈物质循环等方面的作用和影响具有重要意义。本文概述了细菌的常见运动方式、趋化模式和相关信号传导机制；分析探讨了研究细菌趋化性的常见方法及影响细菌趋化性的物理、化学和生物因素；系统阐述了运动细菌的趋化性对微生物群落形成和结构的影响，为研究运动细菌在共生体系或食品发酵过程影响微生物群落结构、菌间互作和物质代谢等方面提供了理论参考。

摘要:植物内生菌是指生活史的全部或部分阶段栖息于植物组织内的微生物类群。内生菌与植物协同进化，并在宿主的生长发育和环境适应中产生诸多效应。近30年来，针对内生菌的起源、传递、功能及其与宿主植物相互作用规律和机制方面已有大量的研究成果。然而，目前的技术手段局限性使得绝大多数的植物内生菌仍不能被纯培养，这严重制约了这些植物内生菌资源的研究和有效利用。本文综述了目前对内生菌特别是那些难培养内生菌分离培养方法的现状，着重关注植物内生菌分离培养方面的技术创新和进展，为植物内生菌的深入研究和资源的有效开发利用提供借鉴。

摘要:【背景】裙带菜是大型食用褐藻，含有丰富的海藻酸盐，是制备海藻酸寡糖(alginate oligosaccharide, AOS)的优良原料之一。酶法制备AOS的用酶是海藻酸裂解酶(alginate lyase, EC 4.2.2.-)，但是现有酶的降解效率偏低，难以对褐藻直接降解。【目的】挖掘和筛选海洋细菌潮滩发光杆菌(Photobacterium gaetbulicola)中的海藻酸裂解酶，并将其应用于裙带菜直接降解生产AOS。【方法】结合序列分析、差异表达量测定、蛋白重组表达和催化性质鉴定，从潮滩发光杆菌Gung47中筛选活性较高的海藻酸裂解酶，优化其直接降解裙带菜的反应条件，并鉴定降解产物AOS的成分。【结果】潮滩发光杆菌Gung47中有AlgPg1、AlgPg2和AlgPg3这3个海藻酸裂解酶。AlgPg1差异表达水平和比酶活都最高，是菌株利用海藻酸钠或裙带菜的关键酶。在NaCl条件下AlgPg1的比酶活达到466 U/mg。AlgPg1能直接降解裙带菜粉末和叶片，还原糖产量达到(26.2±1.6) mg/mL，即转化率为32.5%。裙带菜的降解产物是聚合度(degree of polymerization, DP) 1-6的混合寡糖，DP3含量最高。【结论】海藻酸裂解酶AlgPg1能有效地直接降解裙带菜产生AOS，为裙带菜的资源开发提供了新的工具。

摘要:【背景】角蛋白是广泛存在于动物羽毛、毛发及蹄(脚)中的难溶性蛋白质，在畜牧养殖、畜禽屠宰、肉品加工、皮革加工及羊毛加工等领域会产生大量角蛋白废弃物，对环境构成威胁，同时也是重要的蛋白饲料来源。【目的】从鸡羽毛等废弃物中分离出产角蛋白酶的细菌菌株，研究其对角蛋白的降解能力。【方法】采用脱脂奶粉培养基透明水解圈法进行初筛和鸡羽液体培养基角蛋白酶活测定法进行复筛。另外，采用淀粉酶筛选培养基和液体发酵培养基初步进行产淀粉酶活性测定。【结果】从36株分离自鸡羽毛的细菌菌株中筛选出一株高产角蛋白酶的菌株CX-2，经菌落培养观察、革兰氏染色及16S rRNA基因序列分析，将该菌株鉴定为蕈状芽孢杆菌(Bacillus mycoides)。通过单因素试验对发酵条件进行优化，发现该菌株的最佳产酶条件为：在含100 mL鸡羽液体培养基的250 mL锥形瓶中培养，温度30 ℃、pH 8.0、接种量3%、转速120 r/min，培养36 h。在此条件下测得该菌株产角蛋白酶活性最高达274.327 U/mL。另外，研究发现该菌株产淀粉酶活性达0.807 U/mL。【结论】本研究发现一株高产角蛋白酶并同时产淀粉酶的菌株CX-2，为进一步研究该菌株的角蛋白酶和淀粉酶及其在角蛋白废弃物降解中的应用奠定了理论基础。

摘要:【背景】煤矸石是煤炭开采过程产生的固体废物，表面富含微生物及营养元素。【目的】从煤矸石表面筛选高效解磷菌，并探讨不同培养条件下菌株对养分的活化效果，进而为“煤矸石-微生物-植物”生态恢复提供种质资源和理论依据。【方法】采用以卵磷脂为磷源的培养基，筛选煤矸石表面的解磷微生物，通过测定解磷圈直径比菌落直径(D/d)大小分析菌株对煤矸石的速效磷释放能力；选择并纯化解磷效果最佳的菌株，利用扫描电镜(scanning electron microscope, SEM)、傅里叶变换红外光谱(Fourier transform infrared spectroscopy, FT-IR)对培养优化处理前后的煤矸石进行表征，并在此基础上探讨菌株与煤矸石的相互作用。【结果】分离出4株解磷微生物，经分子生物学鉴定均隶属于假单胞菌属(Pseudomonas)，其中解磷效果最佳的菌株形成的D/d为3.77，菌落大小为2-4 mm，呈乳白色且革兰氏染色阴性，经过24 h培养后OD₆₀₀值达最高1.70，发酵液pH值为7.95。该菌株能有效促进煤矸石养分活化，SEM观察到解磷菌吸附在煤矸石表面，FT-IR分析显示活化前后的煤矸石分别在波长1 000 cm^-1和2 850 cm^-1处的官能团发生了伸缩振动。【结论】最佳解磷菌活化处理后，煤矸石速效磷含量最高达22.39 mg/kg。培养条件优化实验结果显示，添加培养至对数生长期(OD₆₀₀=1.70)的菌液70 mL (煤矸石:接种量固液比=1:7)对100目粒径煤矸石的养分活化效果最佳。本研究筛选到的高效解磷菌不仅可以提高煤矸石养分利用效率，还为煤矸石资源循环利用及矿山生态修复提供了一条新途径。

摘要:【背景】新疆由于环境特殊，人为干扰较少，拥有巨大的微生物资源宝库，但是目前通过传统培养方法如降低培养基营养成分、添加选择性抑制剂或生长因子等，能分离到的微生物不到总量的0.1%-1.0%，大部分微生物资源无法被我们所用。【目的】筛选一种对新疆典型生境土壤微生物分离培养较好的最适碳源-氨基酸复配培养基，为新疆典型生境土壤微生物资源的挖掘奠定基础。【方法】采用基础培养基(g/L) [(NH₄)₂SO₄ 1.0，CaCl₂ 2.0，K₂HPO₄ 1.0，MgSO₄·7H₂O 1.0，NaCl 1.0，琼脂16.0，蒸馏水1 000 mL，制霉菌素0.01和放线菌酮0.025]加入脯氨酸，再分别添加海藻糖、3-吗啉丙磺酸、丙烯酰胺和乙二胺四乙酸等4种不同的碳源，结合稀释涂布平板法选出最适碳源；采用基础培养基加入海藻糖，再分别添加脯氨酸、精氨酸和谷氨酸等20种氨基酸，结合稀释涂布平板法选出最适氨基酸；以海藻糖-脯氨酸(trehalose-proline, TP)培养基为对照，在基础培养基中添加最适碳源和最适氨基酸进行复配，对新疆3种典型生境戈壁土、柽柳根际土和沙土中的微生物进行分离培养，结合稀释涂布平板法和16S rRNA基因测序和序列比对分析比较数量和种类的差异；并结合扩增子测序技术，将其与利用可培养技术分离的菌株进行比较，从而分析最适复配培养基对新疆典型生境土壤微生物分离培养的影响。【结果】海藻糖和甲硫氨酸是分离新疆典型生境土壤微生物的最适碳源和最适氨基酸；扩增子测序共检测到1 031个属中有11个在可培养过程中成功分离，其中有6个属只通过海藻糖-甲硫氨酸(trehalose-methionine, TM)培养基分离得到；用TM培养基对新疆典型生境土壤微生物进行分离培养，共分离得到130株菌，是TP培养基分离菌株数的1.76倍；其分属于3门5纲10目12科20属43种，共获得了44株潜在新物种。【结论】TM培养基是一种较好的分离新疆典型生境土壤微生物的培养基，为新疆特殊生境微生物资源的挖掘奠定了基础。

摘要:【背景】玉米迪克氏菌(Dickeya zeae)可引起作物细菌性软腐病，严重威胁香蕉、水稻等重要作物的生产安全。本研究在香蕉细菌性软腐病菌D. zeae MS1的Tn5突变体库中筛选到4个毒力显著减弱的突变体。【目的】进一步鉴定Tn5转座子插入突变体的具体基因位点，并明确该基因对细菌毒力的影响。【方法】通过热不对称交错PCR (thermal asymmetric interlaced polymerase chain reaction, TAIL-PCR)鉴定转座子插入位点；利用同源重组方法构建插入基因的敲除突变体及其互补菌株，并比较它们与野生型在细菌生长、相关代谢产物活性、植物细胞壁降解酶(plant cell wall-degrading enzymes, PCWDEs)分泌、运动性及毒力等方面的差异。【结果】TAIL-PCR鉴定出4个突变体的转座子插入位点均是位于α-酮戊二酸脱氢酶(α-ketoglutarate dehydrogenase, α-KGDH)基因sucA内，该基因编码三羧酸(tricarboxylic acid, TCA)循环过程的关键酶组分。基因敲除突变体ΔsucA在细菌生长曲线上受到一定程度的影响，但是其α-KGDH活性完全丧失。基因突变可显著减少PCWDEs的分泌并降低pelB和pelC等基因的转录表达，而不影响细菌的涌动、游动能力。对比野生型，ΔsucA在烟叶上产生的过敏性反应明显减弱，对香蕉幼苗的致病性也显著降低。回补菌株则可将上述细菌表型均恢复至与野生型接近的水平。【结论】本研究利用Tn5转座子插入突变鉴定到可影响细菌毒力的TCA关键酶基因sucA，该基因的突变可减弱重要毒力因子PCWDEs的分泌，但不影响细菌运动性。

摘要:【背景】植物内生细菌与宿主植物长期共同进化的过程中，能够与宿主植物形成互利共生的关系。植物生长环境的改变会影响植物内生细菌的种类、数量及分布，而内生细菌具有增强植物抗病性、促进植物生长等作用。新疆鼠尾草(Salvia deserta Schangin)是一种具有多种药理活性的植物，而有关新疆鼠尾草的内生细菌研究较少，具有潜在的研究价值。【目的】探究新疆鼠尾草内生细菌的多样性并挖掘药用植物内生细菌资源。【方法】通过纯培养分离方法对3个地区药用植物新疆鼠尾草组织进行内生细菌的分离纯化，基于16S rRNA基因序列分析探究3个地区新疆鼠尾草内生细菌的多样性；对分离获得的部分菌株进行产酶、促生属性和拮抗能力的筛选。【结果】从新疆3个地区新疆鼠尾草中共分离获得386株内生细菌，经鉴定隶属于3个门4个纲6个目14个科23个属70个种，主要优势属为短小杆菌属(Curtobacterium)、假单胞菌属(Pseudomonas)、芽孢杆菌属(Bacillus)和肠杆菌属(Enterobacter)；相对低海拔低降水量的新源地区新疆鼠尾草内生细菌物种多样性较昭苏和霍城地区更高；新疆鼠尾草经80 ℃、1 h处理后分离得到的放线菌门(Actinomycetota)高于常温处理，并且属水平上的多样性有所提高；共鉴定出68株菌具有溶磷能力，80株菌具有固氮能力，35株菌具有产铁载体能力，47株菌可以产生蛋白酶，57株菌可以产生纤维素酶；拮抗试验表明有48株菌对苹果树腐烂病病原菌黑腐皮壳菌(Valsa mali)有抑制效果，有37株菌对番茄枯萎病病原菌尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)有抑制效果，有20株菌对哈密瓜根腐病病原菌少根根霉(Rhizopus arrhizus)有抑制效果。【结论】新疆鼠尾草内生细菌具有丰富的物种多样性，不同生境的新疆鼠尾草内生细菌丰度存在差异。部分新疆鼠尾草内生细菌在促生及抗真菌活性方面具有一定潜力。

摘要:【背景】滇牡丹生长周期较长且容易受到多种病害侵染，亟待寻求安全、生态和高效的滇牡丹促生抗病新方法。【目的】鉴定4株滇牡丹优势内生木霉(Trichoderma)种类并开展促生抗病功能筛选，以确定具有促生抗病功能的潜力菌株。【方法】采用分子系统发育分析和形态学方法鉴定4株滇牡丹内生木霉种类，结合定性和定量方法测定4株木霉的溶磷、解钾、产吲哚-3-乙酸(indole-3-acetic acid, IAA)和产铁载体活性，并采用平板对峙法测定4株木霉对滇牡丹主要病害病原真菌的抑制效果。【结果】4株滇牡丹内生木霉鉴定为装絮木霉(Trichoderma tomentosum)、东方木霉(T. orientale)、盖姆斯木霉(T. gamsii)和近渐绿木霉(T. paraviridescens)。促生抗病功能筛选的结果表明，T. gamsii具有溶磷能力，溶磷活性为14.89 mg/L，T. gamsii和T. orientale具有解钾能力，解钾活性分别为24.16 mg/L和26.32 mg/L。同时，T. paraviridescens和T. orientale具有固氮活性。另外，T. gamsii还具有产IAA和产铁载体能力，其产IAA能力为51.92 mg/L，铁载体含量为56.70%。此外，T. gamsii对滇牡丹3种主要病害病原真菌交链孢霉(Alternaria alternata)、刺盘孢菌(Collectorichum sp.)和枝孢菌(Cladosporium sp.)的抑制率分别为52.24%、44.23%和31.78%，显著高于其余3株木霉。【结论】4株滇牡丹内生木霉T. tomentosum、T. orientale、T. gamsii和 T. paraviridescens均具有一定的促生或抗病功能，其中T. gamsii同时具有溶磷、解钾、产IAA、产铁载体和抗病能力，是理想的功能型潜力菌株。

摘要:【背景】水绵是养殖水体常见的有害丝状藻类，但具有生物控制水绵功能的微生物资源极其匮乏。【目的】分离鉴定高效抑水绵菌株，分析其抑藻谱、抑藻方式和代谢组学特征，丰富用于养殖水体水绵控制的菌种资源。【方法】以纤细水绵(Spirogyra gracilis) FACHB-354株作为筛选指示藻，从虾池底泥中分离高效抑水绵菌株，采用16S rRNA基因序列分析和生理生化鉴定对高效抑水绵菌株进行鉴定，并在分析高效抑水绵菌株的抑藻谱、抑藻方式的基础上，采用比较代谢组学方法解析高效抑水绵菌株的代谢组学特征。【结果】从虾池底泥中分离筛选出1株高效抑水绵菌株GT5，经16S rRNA基因序列分析和生理生化鉴定确定菌株GT5为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。此外，菌株GT5具有广谱抑水绵活性，抑藻方式为间接抑藻。以无抑藻活性的枯草芽孢杆菌KC1的胞外代谢组为对照，菌株GT5表达量显著上调的代谢物187种，表达量显著下调的代谢物169种。这些显著差异代谢物主要富集到精氨酸和脯氨酸代谢、赖氨酸降解等20个代谢通路。其中，精氨酸生物合成、组氨酸代谢、氨基苯甲酸酯降解、嘧啶代谢、精氨酸和脯氨酸代谢等5个代谢通路影响较大，参与这5个代谢通路的显著上调的差异代谢物有4-(谷氨酰氨基)丁酸酯、邻苯二酚、6-去氢睾酮葡萄糖醛酸苷、N4-乙酰氨基丁醛、胍丁胺和4-羟脯氨酸。【结论】枯草芽孢杆菌GT5是优良的抑水绵菌株，其抑水绵活性可能与邻苯二酚、胍丁胺等潜在抑藻活性物质的产生有关。

摘要:【背景】烟草疫霉(Phytophthora nicotianae)是引起烟草黑胫病的重要病原菌，严重影响烟草种植业的生产和经济效益。采用病原菌的拮抗微生物进行生物防治，是一种控制植物病害的有效途径。【目的】从不同作物的根际土壤环境中分离具有拮抗烟草疫霉活性的放线菌，评价其生物防治效果和促生能力，并对其培养条件进行优化。【方法】采取稀释涂布平板法从作物根际土壤样本中分离放线菌，结合形态学分析、生理生化检测和16S rRNA基因序列比对分析对菌株进行鉴定；通过菌丝生长抑制、离体叶片和室内盆栽等试验进一步探索放线菌对烟草疫霉的拮抗作用。使用铬天青(chrome azurol sulphonate, CAS)平板检测法、产蛋白酶和烟草种子萌发等试验对菌株进行促生能力的测定；利用单因素试验优化发酵工艺。【结果】分离得到一株既对烟草疫霉产生拮抗作用又具有促生作用的菌株FK-15，经菌落形态和碱基序列比对分析，鉴定菌株FK-15为苍黄拟无枝酸菌(Amycolatopsis lurida)，对烟草疫霉的抑制率达到80.37%，室内盆栽防治效果为61.55%。同时，有嗜铁和产蛋白酶能力，利用该菌株制备的发酵液处理烟草种子后，胚根长度增加53.12%，胚芽长度增加51.20%，活力指数增加73.09%，促生能力显著提升；培养条件优化后菌株生长量增加132.48%，抑菌率增加198.80%。【结论】本研究从不同土壤环境中分离出一株具有强拮抗烟草疫霉能力的促生放线菌FK-15。进一步优化其培养条件，有望在实际应用中发挥作用。

摘要:【背景】随着细菌新物种的陆续报道，原先被注释为枝芽孢杆菌(Virgibacillus sp.)的高温大曲优势16S rRNA基因序列被重新归类为大曲慢生芽孢杆菌(Lentibacillusdaqui)，但对该物种在制曲过程中的发酵特性和代谢功能尚不了解。【目的】研究大曲慢生芽孢杆菌在高温大曲中的分布规律、生长和代谢特性。【方法】采用高通量测序技术分析大曲慢生芽孢杆菌在三类高温大曲中的分布规律；采用纯培养技术分离大曲慢生芽孢杆菌，研究其生长的温度、pH、NaCl浓度等范围；采用小麦固态发酵试验，研究大曲慢生芽孢杆菌在不同温度(30、45、60 ℃)的产酶和产香特征。【结果】从48个高温大曲样品中测序获得3条属于大曲慢生芽孢杆菌的16S rRNA基因扩增子序列变体(amplicon sequence variant, ASV)序列，平均相对丰度之和为21.4%，均存在于大曲慢生芽孢杆菌ZS110521^T的基因组上，共有6个基因拷贝。菌株ZS110521^T生长的温度范围10-55 ℃，pH 5.5-10.0，NaCl浓度范围0-20%。菌株ZS110521^T具有产生糖化酶、纤维素酶与蛋白酶的能力，在45 ℃实验组酶活最高。相较于30 ℃实验组，45 ℃和60 ℃发酵试验组的吡嗪类、酚类、酸类、酮类、酯类化合物含量均显著升高，而醇类化合物含量显著降低(P<0.05)。菌株ZS110521^T发酵小麦中含量超过180 ng/g的优势挥发性化合物有10种，包括川芎嗪、2,3,5-三甲基吡嗪、2,5-二甲基吡嗪、2-乙基-3,5,6-三甲基吡嗪、4-乙基愈创木酚、愈创木酚、苯乙醇、苯甲醛、异戊酸和乙偶姻，并且其含量均随着培养温度而显著增加。【结论】大曲慢生芽孢杆菌是高温大曲中的优势细菌，在45-60 ℃温度下具有良好的产吡嗪类和愈创木酚类物质的能力。研究结果为了解大曲慢生芽孢杆菌的发酵功能与应用潜力提供了依据。

摘要:【背景】黄曲霉毒素B₁ (aflatoxin B₁, AFB₁)是迄今为止发现的毒性最强的生物毒素之一，它通过污染花生、玉米、棉花和辣椒等不同作物，对人类和动物健康造成严重威胁。由于醛酮还原酶能够将多种醛酮类物质还原为毒性更小的醇类物质从而发挥解毒作用，所以推测醛酮还原酶可能具有转化AFB₁的可能。【目的】克隆了假蜜环菌(Armillariella tabescens)中的醛酮还原酶AtAKR297，以研究醛酮还原酶AtAKR297对AFB₁的转化作用。【方法】使用TRIzol法提取假蜜环菌的总RNA，根据蛋白质谱获取的肽段信息及cDNA末端快速克隆(rapid-amplification of cDNA ends, RACE)技术获取醛酮还原酶AtAKR297基因全长序列；构建醛酮还原酶AtAKR297的表达系统，用亲和层析对蛋白进行纯化，并进行酶活力检测及酶学性质分析。在pH 8.0缓冲体系中，将醛酮还原酶AtAKR297与AFB₁反应12 h，用高效液相色谱仪对残余的AFB₁进行检测，并用高分辨率液相色谱-质谱仪对转化产物进行鉴定。【结果】成功克隆出假蜜环菌的全长AtAKR297基因，基因长度为894 bp，共编码297个氨基酸；pET28a(+)-AtAKR297质粒转入大肠杆菌(Escherichia coli) BL21(DE3)宿主菌中，实现诱导表达并对酶学性质进行分析。AtAKR297的最适反应温度为20 ℃，最适反应pH值为8.0；在15-50 ℃具有较好的稳定性，孵育30 min酶活可维持60%以上；在pH 5.0-8.0具有较好的稳定性，孵育2 h酶活可维持75%以上。醛酮还原酶AtAKR297与AFB₁的相互作用质谱鉴定结果显示AtAKR297能作用于AFB₁ (依赖NADPH)，将AFB₁还原为毒性降低的黄曲霉毒醇(aflatoxicol, AFL)，该产物分子式为C₁₇H₁₄O₆。【结论】成功从假蜜环菌中克隆出醛酮还原酶基因AtAKR297，并构建了具有醛酮还原酶活性的AtAKR297的原核表达系统。AtAKR297在NADPH的存在下能将AFB₁还原为毒性降低的AFL。

摘要:【背景】采后病害是制约热带水果商品产业化发展的一大重要影响因素。【目的】明确采后莲雾致腐病原菌种类，并筛选高效生物抑制剂。【方法】以‘大叶’莲雾果实为试验材料，采用组织分离、科赫氏法则、形态学鉴定和ITS序列同源性分析对果实表面主要致病菌进行分离纯化及鉴定，验证莲雾果实主要致病菌种类，并结合体外和体内试验筛选适宜的高效生物抑制剂。【结果】从莲雾果实中共分离鉴定出5种病原菌，分别是可可毛色二孢菌(Lasiodiplodia rubropurpurea)、果生刺盘孢菌(Colletotrichum fructicola)、木贼镰刀菌(Fusarium equiseti)、小孢拟盘多毛孢(Pestalotiopsis microspora)和棒孢拟盘多毛孢菌(Neopestalotiopsis clavispora)，并且发现木贼镰刀菌(Fusarium equiseti)能诱发莲雾果实腐烂。体外试验结果表明：0.3 g/L咖啡酸(caffeic acid, CA)对5种不同病原菌的抑菌率最高，水杨酸(salicylic acid, SA)次之，对香豆酸(p-coumaric acid, PCA)抑菌效果最差。体内试验结果表明：CA可以通过延缓莲雾果实硬度(hardness)下降，降低絮状绵软物的生成，维持较高的抗坏血酸(vitamin C, V_C)和可滴定酸(titratable acid, TA)含量，降低丙二醛(malondialdehyde, MDA)累积速率，同时降低细胞膜透性，延缓膜脂过氧化，从而维持采后莲雾较好的贮藏品质。【结论】从采后莲雾果实中分离鉴定出5种致病菌，并筛选出有明显抑菌作用的生物抑制剂，为莲雾果实病害防治和采后贮藏保鲜提供了理论参考。

摘要:【背景】奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)是重要的人畜共患病病原，可引起梅花鹿仔鹿腹泻，给梅花鹿养殖业造成严重危害。【目的】鉴定引起吉林省某梅花鹿场仔鹿腹泻病的细菌性病原种类及其生物学特性，并确定该病原造成的主要病理特征。【方法】收集腹泻病空肠内容物，通过细菌分离培养、革兰氏染色、显微镜镜检、16S rRNA基因及atpD基因测序和进化树分析等方法鉴定细菌种类。采集腹泻鹿的空肠、肺、肝、脾、肾和心等组织样品制作病理切片。通过检测毒力基因、生物膜形成能力、耐药性与耐药基因，以及部分菌株的小鼠致病性分析该菌的生物学特性。【结果】共鉴定出3株奇异变形杆菌，分别命名为SKPM1、SKPM2、SKPM3。3株菌均携带ureC、zapA、atfC、atfA、rsbA、ucaA和pmfA等7种毒力基因，具有生物膜形成能力；3株菌对青霉素、头孢氨苄、庆大霉素、四环素、多黏菌素B等抗生素表现出多重耐药性，并检测出bla_TEM、bla_CTX-M、tetB、ant(3″)-I、sul2等耐药基因；致病性上菌株SKPM2的LD₅₀为3.98×10⁷ CFU/mL。【结论】本研究分离鉴定了3株梅花鹿源奇异变形杆菌，并研究了其生物学特性，为该菌引起的仔鹿腹泻病的防治和深入研究提供了实验基础。

摘要:【背景】大肠杆菌(Escherichia coli)为革兰氏阴性菌，广泛存在于肉鸡的肠道、排泄物、土壤、水和空气中。【目的】研究季节对大肠杆菌的流行情况和耐药性的影响。【方法】对3个定点肉鸡养殖场开展夏季和冬季大肠杆菌流行病学调查，以问卷形式调研3个养殖场基本情况，平板法分离大肠杆菌，对分离株开展14种抗菌药物最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration, MIC)的测定，检测分离株的耐药基因和毒力基因携带情况，最终采用统计学方法实证季节与大肠杆菌分离率的相关性、季节与细菌耐药性的相关性、耐药基因与耐药表型相关性。【结果】3个养殖场大肠杆菌总分离率为94.7% (284/300)，A养殖场>C养殖场>B养殖场(100.0%>93.0%>91.0%)，同一养殖场夏季和冬季的大肠杆菌分离率的统计学结果无显著差异(P>0.05)，A养殖场分离率显著大于B和C养殖场(P<0.05)；3个养殖场大肠杆菌分离株表现出多重耐药性，菌株对氨苄西林、头孢噻吩、卡那霉素、四环素、环丙沙星、磺胺甲噁唑、复方新诺明和氟苯尼考高度耐药，并且夏季分离株比冬季分离株耐药率高；进一步采用配对法t检验实证季节与细菌耐药性的相关性，发现仅多黏菌素E耐药性表现季节差异(P<0.05)；耐药基因检出率最高的基因为floR，其次为qnrS和mcr-1，bla_NDM和aac(6')-Ib检出率较低，cfr基因未检出，3个养殖场基因检出情况与季节相关性不完全一致，耐药表型与基因型相关性分析发现，floR基因与氟苯尼考耐药呈显著正相关(P<0.05)，bla_NDM基因与氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸耐药呈显著正相关(P<0.05)，mcr-1基因与多黏菌素E耐药呈显著正相关(P<0.05)，qnrS基因与环丙沙星耐药呈显著正相关(P<0.05)；17个毒力基因分析表明fimC、yijp、matA和iss检出率在70%以上，共有2株大肠杆菌被定义为致病性大肠杆菌。【结论】大肠杆菌在肠道的定殖不受季节影响，肉鸡养殖场大肠杆菌多重耐药性普遍，夏季大肠杆菌分离株比冬季分离株耐药情况严峻，大肠杆菌对多黏菌素E的耐药性与季节有关，细菌耐药性与耐药基因之间存在密切相关性，研究成果提示可在夏季加强细菌耐药性监测，指导肉鸡养殖规范和精准用药，为肉鸡大肠杆菌病防治和合理用药提供参考。

摘要:【背景】昆虫是生物种类最多的类群，是地球上尚未被充分开发与利用的巨大生物资源，昆虫来源真菌能产生结构丰富的次生代谢产物，是活性天然产物的重要来源。【目的】以金环胡蜂虫草来源短密青霉属(Penicillium brevicompactum) VMFST24为研究对象，分离鉴定其次级代谢产物并进行抗炎活性测试。【方法】首先以脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)诱导的RAW264.7细胞炎症模型对P. brevicompactum VMFST24的水萃取物、正丁醇萃取物、乙酸乙酯萃取物进行抗炎活性检测。再以活性为导向，采用多种色谱技术对P. brevicompactum VMFST24乙酸乙酯萃取的中等极性部位进行分离纯化，获得单体化合物进行抗炎活性测试；最后采用气相色谱-质谱(gas chromatography-mass spectrometry, GC-MS)技术对小极性部位的化学成分进行检测分析。【结果】通过抗炎活性检测发现P. brevicompactum VMFST24发酵产物的乙酸乙酯萃取物具有较好活性，对其进行分离纯化，共鉴定5个化合物：mycophenolic methyl ester (1)、α-acetylorcinol (2)、3-methoxy-6,8-dihydroxy-3-methyl-3,4-dihydroisocoumarin (3)、3,5-二羟基苯甲酸甲酯(4)和苔色酸(5)，其中化合物2和4具有抗炎活性；通过GC-MS技术对P. brevicompactum VMFST24乙酸乙酯萃取物的小极性部位化学成分进行检测分析，结果表明其富含大量的脂肪酸及其酯和酚类成分。【结论】金环胡蜂虫草来源真菌Penicillium brevicompactum具有产生抗炎活性次生代谢产物的能力，本研究为胡蜂虫草真菌活性天然药物的开发奠定了基础。

摘要:【背景】赤腐病是由紫菜腐霉(Pythium chondricola/porphyrae)引起的紫菜栽培期最主要病害，而现有的防治方法效果有限。【目的】提取杀鱼假交替单胞菌(Pseudoalteromonas piscicida) P3的抗菌成分，探究其抑制紫菜腐霉的机制及对赤腐病的防治效果。【方法】有机溶剂萃取法从无菌上清液(cell-free supernatant, CFS)中提取抗菌物质，纸片扩散法及含毒介质法评价提取物对紫菜腐霉抑制效果；在紫菜腐霉侵染前、后添加提取物评价其防治效果；转录水平分析处理后的紫菜腐霉基因表达差异。【结果】拮抗菌P3乙酸乙酯提取物抑制紫菜腐霉效果最佳，处理后紫菜腐霉菌丝表现为生长量下降、细胞壁弯曲变薄、细胞基质流失、出现藏卵器等；在紫菜腐霉侵染前、后分别添加终浓度为15 mg/L的提取物，病斑抑制率分别为96.64%和85.06%；转录组分析显示紫菜腐霉在细胞质、膜、磷脂酰肌醇等通路基因下调。【结论】菌株P3的胞外产物对紫菜腐霉有显著抑制效果，并且有效防治紫菜赤腐病，为赤腐病的新型防治技术和药物开发提供了支持。

摘要:【背景】宜春的温汤温泉是天然富硒温泉，同时也是富硒土壤区域。【目的】筛选优化富硒酵母并研究其对心功能的保护作用。【方法】实验选取了60个典型土壤样本，并通过筛选抗性平板获得了一种具有高硒富集能力的酵母菌株。显微镜和扫描电子显微镜观察表明，此酵母是一种典型的酵母菌株，通过18S测序鉴定为葡萄汁有孢汉逊酵母(Hanseniaspora uvarum)。实验进一步优化了亚硒酸钠的添加量、添加时间、发酵时间和温度，优化后酵母中的有机硒含量进一步升高。在发酵罐中进一步放大发酵后有机硒含量达到高水平，OD₆₀₀在56 h后高达132。为了研究富硒酵母的生理功能，实验通过阿霉素(doxorubicin, ADR)建立了心肌肥大小鼠模型。【结果】富硒酵母对改善心肌肥大有良好的效果，其机制可能与抗氧化和抗凋亡作用有关。【结论】筛选出一种高硒含量的酵母菌株。通过优化培养条件和5 L发酵罐的发酵，表明所获得的酵母具有良好的工业应用前景，并且这种富硒酵母具有良好的抗氧化活性。

摘要:【背景】稗草生防真菌稗属炭疽菌(Colletotrichum echinochloae) B-48是从水稻田自然发病的稗草上分离鉴定得到的，前期研究发现该菌株对稗草具有良好的生防效果，对主要作物如水稻、小麦、玉米等具有良好的安全性。【目的】研究稗草生防真菌B-48的最佳生长和产孢的培养基、生长温度、pH、光照条件、碳氮源等生物学特性，以便优化该菌株的培养和应用条件。解析该生防菌株的基因组序列信息，挖掘其次级代谢产物基因资源，为深入研究该菌株的除草活性天然产物及天然产物的生物合成机制奠定基础。【方法】对稗草生防真菌B-48的生长最适培养基、温度、pH、光照、生长碳氮源及致死温度等生物学特性进行研究。利用Nanopore及Illumina测序平台对稗草病原真菌B-48进行全基因组测序，采用相关软件进行菌株基因组序列拼接、基因组结构预测，以及基因组功能注释、并预测其次级代谢产物合成基因簇。【结果】稗草生防真菌B-48在马铃薯蔗糖琼脂(potato sucrose agar, PSA)培养基上生长产孢良好，最适生长温度为30 ℃，最适生长pH 7.0，最适光照条件为持续光照，最适碳氮源分别为淀粉和酵母浸粉，致死条件为55 ℃、10 min。全基因组序列结果显示该菌株基因组大小为62.25 Mb，G+C含量46.59%，预测到蛋白质编码基因11 324个，预测到次级代谢产物生物合成基因簇76个。【结论】稗属炭疽菌B-48具有开发为稗草生物除草剂的潜力，其次级代谢产物生物合成基因簇预示着其具有合成除草活性天然产物的潜力。以上结果为该菌后续发酵培养、次级代谢生物合成研究及实际应用奠定了理论基础。

摘要:【背景】肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)是一种革兰氏阴性杆菌，能够引发人类和动物呼吸道感染、尿路感染和败血症等。本实验室前期在海南黑山羊的患病羔羊中分离鉴定出一株肺炎克雷伯氏菌，命名为菌株KPHN001。【目的】扩充肺炎克雷伯氏菌的基因组数据库信息，明确菌株KPHN001的遗传进化关系。【方法】采用第3代Oxford Nanopore Technologies (ONT)和第2代Illumina两种测序技术相结合的方式，通过全基因组测序和比较基因组学来对菌株进行基因功能注释和生物信息学分析，并利用PCR技术验证测序结果。【结果】菌株KPHN001全基因组大小为5 470 968 bp，G+C含量为56.66%，预测到的编码基因有5 135个，包含25个rRNA、86个tRNA基因和58个sRNA；含14个基因岛、3个前噬菌体；在KEGG和COG数据库中分别注释3 321和4 075个基因，根据分析结果绘制该菌株的全基因组圈图。比较基因组分析发现该菌株与菌株HS11286进化关系最接近。本研究还对选取的相关耐药基因进行了PCR检测，成功筛选出4个耐药基因，分别为SHV-11、H-NS、FosA和MdtQ。这些基因的存在表明该菌株具有多重耐药性。【结论】通过全基因组和比较基因组学分析，揭示了菌株KPHN001的遗传信息。同时，通过比较不同菌株之间的差异，为肺炎克雷伯氏菌的鉴定和临床防治奠定了遗传学基础。

摘要:【背景】硫氧还蛋白系统是细菌重要的氧化还原状态维持系统。假结核耶尔森氏菌(Yersinia pseudotuberculosis) YPⅢ是肠道常见的机会致病菌，在YPⅢ中进行过氧化氢胁迫下的转录组测序，结果发现硫氧还蛋白系统的相关基因有所上调，可能参与细菌氧化胁迫的应答。【目的】研究假结核耶尔森氏菌中硫氧还蛋白系统应答氧化胁迫的方式。【方法】利用同源重组方法构建硫氧还蛋白系统缺失突变株(ΔtrxA、ΔtrxC和ΔtrxR)，研究假结核耶尔森氏菌在过氧化氢胁迫下的生长，测定过氧化氢对细菌的最低抑菌浓度、过氧化氢清除能力，以及过氧化氢处理下的存活率等。同时，通过lacZ报告基因系统对硫氧还蛋白系统的表达调控进行探究。【结果】构建硫氧还蛋白系统缺失突变株，发现缺失trxA后显著影响了假结核耶尔森氏菌的抗氧化胁迫能力，因此TrxA是硫氧还蛋白系统中应答氧化胁迫的主要蛋白；在ΔtrxA中过氧化氢酶的表达上调，但不足以保护细菌及时修复受损的生物大分子；启动子活性测定及实时荧光定量PCR (real time quantitative PCR, RT-qPCR)实验结果表明trxC和trxR的表达可能受到细菌氧化胁迫转录调控因子OxyR的影响。【结论】硫氧还蛋白系统作为细菌内部还原环境的维持系统，在OxyR的调控下参与氧化胁迫应答，并发挥了重要的作用。

摘要:【背景】猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome, PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)引起的母猪流产或死胎、仔猪呼吸道症状并伴随死亡率升高的一种传染性疾病。【目的】建立一种特异性强、灵敏度高、操作简捷、检测时间短的PRRSV抗体化学发光检测方法，用于检测PRRSV抗体水平。【方法】以羧基磁珠作为固相载体偶联PRRSV重组N蛋白，用适量的牛血清白蛋白(bovine serum albumin, BSA)进行封闭，加入检测样品进行反应，以兔抗猪IgG-AP抗体作为酶标二抗，加入相应底物进行显色，优化各项反应条件，建立PRRSV抗体化学发光检测方法，并对该方法的特异性、灵敏度、重复性和符合率进行验证。【结果】建立的PRRSV抗体化学发光检测方法的血清样品稀释倍数为1:30，蛋白与羧基磁珠偶联pH值为8.0，蛋白偶联量为20 μg/mL，使用20 μL 10% BSA溶液封闭最佳，磁珠稀释液用量为1 mL，酶标二抗稀释度为1:20 000，一步反应时间为20 min，二步反应时间为10 min，底物反应时间为3 min。根据背景清晰的PRRSV临床血清样本制标准曲线，通过绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线确定阴阳临界点为32.56 U，当临床PRRSV抗体阳性样品稀释到4倍时，ELISA和化学发光检测方法均鉴定为阴性，说明该化学发光检测方法具有良好的灵敏度。与非洲猪瘟病毒、经典猪瘟病毒、猪乙脑病毒、猪细小病毒、猪圆环病毒2型、猪流行性腹泻病毒抗体阳性血清均无交叉反应。重复性试验中，批内变异系数为2.79%-5.32%，批间变异系数为1.05%-11.31%，均<15%，与商品化猪繁殖与呼吸综合征抗体检测试剂盒阳性符合率93.8%，阴性符合率96.3%，总符合率96.1%。【结论】本研究建立的PRRSV抗体化学发光检测方法可用于PRRSV疫苗接种后或感染痊愈后抗体水平检测，为后续试剂盒的开发提供参考。

摘要:培养卓越工程人才是我国实现新质生产力背景下高水平科技自立自强的关键。地方高校在微生物制造领域研究生卓越工程人才培养中多存在教育理念滞后、教学方法单一和实践平台不足等短板。南京工业大学生工学科群在微生物制造卓越工程人才培养中开展了一系列产教融合模式的探索与实践，包括校企深度协同的培养方案制定与导师团队建设、新质生产技术导向的多学科交叉课程体系建设、产教融合与创新创业互促的研究生实践平台建设，以及面向产业赋能的多元化人才培养质量保障和评价体系构建等，为地方高校培养面向新质生产力的微生物制造卓越工程人才提供了有益的参考和借鉴。

摘要:一流本科课程建设是中国适应新时代发展需求、推动高等教育改革、提升人才培养质量的重要举措。本文以“海洋微生物学”课程为例，针对一流本科课程建设需要解决的痛点问题，教学团队围绕海洋学科人才培养要求和学生自身特点，立足提高课程“两性一度”，以学生为中心，从优化教学内容、更新教学手段、构建多元化教学和评价模式、融合理论和实践教学、拓展“第二课堂”等方面开展了“海洋微生物学”线下一流本科课程建设的探索和实践，构建了“知识→实践→能力→品德”多层次递进式的“海洋微生物学”课程体系，促进“知识型”大学生向“综合型”大学生的转变，为建设一流本科课程提供借鉴。

摘要:小规模限制性在线课程(small private online course, SPOC)是基于慕课(massive open online courses, MOOC)平台的一种结合了课堂教学与线上教学的混合学习模式。本文介绍了基于优慕课教学平台的SPOC混合式教学在动物药学专业“兽医微生物学与免疫学”课程的探索与实践，从线上平台建设、教学设计与实施、同步评价促学等方面全面进行教学改革，通过期末考试成绩和学生反馈分析评价教学效果。实践证明，SPOC混合式教学模式实现了线上线下的有效结合，提升了学生的学习效果和教学质量，有助于实现全面发展的高素质人才的培养目标。

摘要:“食品微生物学实验”课程教学在高等学校食品科学与工程类专业中占据核心地位，是培养学生实践能力、科学思维和创新精神的重要环节。本文以烟台理工学院的“食品微生物学实验”课程教学为例，针对以前该实验教学存在的安全教育刻板化、实验内容安排不合理、灌输式教学以及教学管理松散、无标准可依等问题，提出了一系列优化措施，包括安全教育现场化与可视化、实验内容系统化、教学方法数字化与互动化，以及教学管理日常化与规范化等。目前通过这些措施，构建了一个高效、安全、规范的实验教学体系。多轮的实践证明，这些优化措施提升了学生的实验技能、科学素养和团队协作能力，显著提高了“食品微生物学实验”课程教学的质量与效果，为相关专业应用型人才的培养提供了参考。