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微生物学通报

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    • 根际优势菌耐药菌株的获得及其15N标记

      1994, 21(4).

      关键词:根际细菌 耐药菌株15N标记 双标记菌株 反硝化活性
      摘要 (1823)HTML (10)PDF 0.00 Byte (2036)收藏

      摘要:对两株具有反硝化活性的根际优势细菌进行了耐药性和15N标记;研究了该双标记菌株在土壤中的动态及其活性。结果表明,所用双标记方法是可行的,应用标记菌株可以追踪其在土壤中的消长。结果还表明,标记15N菌株的15N丰度与供试培养基中氮源的15N丰度相近;标记菌株的反硝化活性与出发菌株的相同。

    • 大型真菌中SSR分子标记的开发与应用进展

      2013, 40(4):646-654.

      关键词:微卫星, 真菌, 综述
      摘要 (2185)HTML (0)PDF 359.40 K (4205)收藏

      摘要:SSR分子标记是近年来普遍应用的分子标记之一。大型真菌中常用的SSR分子标记开发策略有三类, 包括传统基因文库筛选法、富集文库筛选法和数据库筛选法, 其中富集文库筛选法因其分离效率高而被采用较多。本文综述大型真菌中SSR分子标记的应用现状, 发现相关研究多数集中于种系鉴定和遗传多样性分析, 有关遗传图谱构建和辅助育种虽有涉及但研究较少。讨论了SSR分子标记在大型真菌研究中存在的问题与发展前景。

    • 环链棒束孢IcHsp104与IcHsp78的克隆及在不同胁迫条件下的表达检测

      2021, 48(6):1952-1964.DOI: 10.13344/j.microbiol.china.200959CSTR: 32113.14.j.MC.200959

      关键词:环链棒束孢,热休克蛋白,生物信息学,温度胁迫,盐胁迫
      摘要 (503)HTML (1664)PDF 5.81 M (1333)收藏

      摘要:【背景】环链棒束孢(Isaria cateinannulata)是一种重要的虫生真菌,许多环境因子的胁迫作用影响了该菌在田间的生防效果。【目的】热休克蛋白酪蛋白溶解蛋白酶(Heat Shock Protein Casein Lytic Proteinase,Hsp100/Clp)是一类ATP依赖型Hsp100家族蛋白,克隆该菌株Hsp100/ClpB家族的2个关键基因IcHsp104与IcHsp78,探索该对基因在应对不同温度及盐浓度胁迫下的作用。【方法】通过前期获得的转录组数据库,采用本地Blast方法对环链棒束孢Hsp100家族基因进行分析筛选。通过RT-PCR技术,对环链棒束孢Hsp100基因的编码区(Open Reading Frame,ORF)进行碱基验证。通过分子生物信息学分析软件,对环链棒束孢Hsp100基因的氨基酸结构、进化树、功能结构域和三级结构进行分析。通过不同温度及盐浓度处理菌株,采用荧光定量PCR (Real-Time Quantitative PCR,RT-qPCR)技术,对获得的基因进行表达检测。【结果】共筛选出2个环链棒束孢Hsp100/ClpB基因Hsp104与Hsp78,将其命名为IcHsp104与IcHsp78,2个基因分别编码923个和805个氨基酸,分子量分别为103.199 kD和88.805 kD;2个基因均与棒束孢属、白僵菌属和虫草属3个物种的亲缘关系最近,但2个基因之间的同源性较低;2个基因编码的蛋白均为经典的AAA+-ATPase家族蛋白,三级结构以α螺旋为主。另外,经高低温处理菌株后,2个基因的表达均会上调,并随处理时间的延长上升越显著,而且高温胁迫组显著强于低温组。经不同浓度氯化钠处理后,低浓度组2个基因的表达量均上调,高浓度组2个基因的表达量均受到抑制。【结论】环链棒束孢IcHsp104与IcHsp78基因在抵抗外界温度及盐胁迫过程中起到重要的作用,为后续环链棒束孢应对环境胁迫的机理研究提供了理论基础。

    • 源于解淀粉芽胞杆菌酚酸脱羧酶的克隆与表达

      2020, 47(7):2060-2071.DOI: 10.13344/j.microbiol.china.200264CSTR: 32113.14.j.MC.200264

      关键词:解淀粉芽胞杆菌,酚酸脱羧酶,克隆表达,底物特异性
      摘要 (937)HTML (1659)PDF 5.85 M (1876)收藏

      摘要:【背景】酚酸脱羧酶催化分解酚酸产生的4-乙烯基酚类物质可用于食品添加剂及香精香料行业,而酚酸脱羧酶的表达水平相对较低,因此,高水平的酚酸脱羧酶是工业规模生产4-乙烯基酚类物质的先决条件。【目的】克隆解淀粉芽胞杆菌的酚酸脱羧酶基因,实现在大肠杆菌中的高效异源表达,分析酚酸脱羧酶的底物特异性,并对其表达条件进行优化。【方法】通过PCR技术获得酚酸脱羧酶的基因,构建重组基因工程菌,将测序结果与其他酚酸脱羧酶序列进行比对,利用IPTG诱导方法高效表达蛋白。将重组酚酸脱羧酶与4种不同的底物进行反应,设计响应面试验对诱导条件进行优化。【结果】酚酸脱羧酶对对香豆酸、阿魏酸、咖啡酸、芥子酸的比酶活比率为:100:23.33:15.39:10.51。结合与其他酚酸脱羧酶比对结果发现酚酸脱羧酶家族的C末端区域氨基酸序列的变异率最高,这与酚酸脱羧酶的底物特异性和催化机制有关。通过单因素和响应面试验得到酚酸脱羧酶诱导表达的最佳条件为:2×YT培养基,诱导温度30 °C,接种量1.78%,诱导时机3.8 h,IPTG 1.25 mmol/L,诱导时间18 h,此时预测酶活和实际酶活分别为47.61 IU/mL和47.55 IU/mL。【结论】应用响应面法优化酚酸脱羧酶的诱导表达是可行的,本试验为以后生产稳定、高产的酚酸脱羧酶以及了解其催化机理提供了重要的理论基础。

    • DGGE分析东江流域农村饮用水源中微生物多样性及其与环境因子相关性

      2009, 36(9):1311-1317.

      关键词:农村饮用水源, 微生物多样性, 变性梯度凝胶电泳
      摘要 (2322)HTML (0)PDF 558.96 K (4742)收藏

      摘要:为评价东江流域农村饮用水源中微生物多样性及其与环境因子的相关性, 分别采集了集中式供水井、塘坝型水井、猪场附近水井、普通村落水井、水库水5种水样, 进行基因组总DNA的提取和主要理化指标的测定, 运用DGGE技术分析各水样总DNA的PCR产物。UPGMA聚类分析DGGE指纹图谱结果表明, 相同类型水样的微生物群落结构相似性较高, 聚集到一个分支上; 典型相关性分析(CCA)结果表明, 水体中总磷(TP)和总氮(TN)的浓度与微生物群落结构的关联度最高, 即磷和氮两种生命过程的基本元素对微生物群落影响最大; 序列分析表明农村饮用水源中微生物群落结构丰富, 包含了螺旋体门(Spirochaetes)、蓝藻门(Cyanobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)5个门的细菌, 且每类水样拥有各自的优势菌。

    • 激光共聚焦扫描显微镜在抗菌机理研究中的应用

      2015, 42(6):1108-1121.DOI: 10.13344/j.microbiol.china.140634CSTR: 32113.14.j.MC.140634

      关键词:激光共聚焦扫描显微镜,抗菌,机理,生物膜
      摘要 (1694)HTML (1258)PDF 532.26 K (4979)收藏

      摘要:激光共聚焦扫描显微镜采用激光光源、共聚焦技术和点扫描技术,使其分辨力较传统光学显微镜大为提高。与其他的生物学技术相配合,可定性、定量、定位地检测组织细胞内的多种生化成分。它具有的活细胞动态监测、断层扫描及三维图像重建等功能,使其在抗菌机理研究、尤其是抗生物膜研究中得到大量的应用。本文就激光共聚焦扫描显微镜在抗菌剂作用位点,抗菌剂对微生物细胞膜,微生物生理代谢,以及微生物生物膜形成与结构的影响等研究中的应用做一综述。

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