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    • 大白菜NHX基因家族的鉴定与表达分析

      2023, 39(2):552-565.DOI: 10.13345/j.cjb.220622CSTR: 32114.14.j.cjb.220622

      关键词:NHX基因家族亚细胞定位荧光定量胁迫大白菜
      摘要 (481)HTML (1360)PDF 2.15 M (1230)收藏

      摘要:Na+/H+逆向转运蛋白(Na+/H+ antiporter, NHX)基因家族在植物响应盐胁迫中发挥重要作用。本研究鉴定了大白菜NHX基因家族成员,并分析了大白菜NHX基因(Brassica rapa ssp. Pekinensis NHX,BrNHXs)响应高温、低温、干旱和盐胁迫等非生物逆境的表达模式。结果表明,在大白菜中共鉴定到9个NHX基因家族成员,分布在大白菜的6条染色体上,其氨基酸数目在513–1 154 aa之间,相对分子量集中在56 804.22–127 856.66 kDa,等电点位于5.35–7.68之间。该基因家族成员主要存在于液泡中,基因结构完整,外显子的数目介于11–22之间。大白菜NHX基因家族编码的蛋白质二级结构都具有α-螺旋、b-转角和不规则卷曲结构,其中α-螺旋发生频率较高。实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR,qRT-PCR)分析显示,该基因家族成员在高温、低温、干旱和盐胁迫下均有不同程度地响应,且在不同时间表达差异显著。以BrNHX02和BrNHX09对这4种胁迫的响应最为显著,表达量在处理72 h时均显著上调,可作为候选基因进一步验证其功能。

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